Esta es la versión HTML de un fichero adjunto a una solicitud de acceso a la información 'Infectious Diseases'.


TECHNICAL DOCUMENT
Point prevalence survey of 
healthcare-associated infections 
and antimicrobial use in 
European acute care hospitals
Protocol version 5.3 
www.ecdc.europa.eu


 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ECDC TECHNICAL DOCUMENT 
Point prevalence survey of healthcare- 
associated infections and antimicrobial 
use in European acute care hospitals 
Protocol version 5.3, ECDC PPS 2016–2017 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Suggested citation: European Centre for Disease Prevention and Control. Point prevalence survey of healthcare- 
associated infections and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3. Stockholm: 
ECDC; 2016. 
 
Stockholm, October 2016 
ISBN 978-92-9193-993-0 
doi 10.2900/374985 
TQ-04-16-903-EN-N 
 
© European Centre for Disease Prevention and Control, 2016 
Reproduction is authorised, provided the source is acknowledged. 
ii 
 
 
 

link to page 7 link to page 8 link to page 10 link to page 11 link to page 11 link to page 11 link to page 11 link to page 12 link to page 12 link to page 12 link to page 12 link to page 12 link to page 14 link to page 15 link to page 15 link to page 15 link to page 15 link to page 15 link to page 16 link to page 16 link to page 16 link to page 17 link to page 19 link to page 24 link to page 25 link to page 25 link to page 27 link to page 27 link to page 30 link to page 30 link to page 30 link to page 31 link to page 31 link to page 32 link to page 34 link to page 34 link to page 36 link to page 36 link to page 36 link to page 36 link to page 38 link to page 38 link to page 38 link to page 38 link to page 40  
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Contents 
Abbreviations ............................................................................................................................................... vi 
Background and changes to the protocol .......................................................................................................... 1 
Objectives ..................................................................................................................................................... 3 
 
Inclusion/exclusion criteria .............................................................................................................................. 4 
Hospitals .................................................................................................................................................. 4 
Wards ...................................................................................................................................................... 4 
Patients ................................................................................................................................................... 4 
 
Sample design ............................................................................................................................................... 5 
Sampling of patients within the hospital ...................................................................................................... 5 
Representative sampling of hospitals (for PPS coordinating centres only) ....................................................... 5 
Steps ................................................................................................................................................... 5 
Design effect and sample size ................................................................................................................ 5 
Other sampling methods: reporting of results and data collection periods .................................................. 7 
 
Data collection ............................................................................................................................................... 8 
When? ..................................................................................................................................................... 8 
Who will collect the data? .......................................................................................................................... 8 
Training of surveyors ................................................................................................................................. 8 
Data processing ........................................................................................................................................ 8 
 
Overview of collected data .............................................................................................................................. 9 
Light (unit-based) protocol ........................................................................................................................ 9 
Standard (patient-based) protocol .............................................................................................................. 9 
 
Hospital data ............................................................................................................................................... 10 
Definition of hospital data ........................................................................................................................ 12 
Hospital variables to be added by PPS coordinating centre before submission to ECDC’s TESSy ...................... 17 
 
Ward data ................................................................................................................................................... 18 
Definition of ward data ............................................................................................................................ 18 
 
Patient data (standard protocol option) .......................................................................................................... 20 
Definition of patient data ......................................................................................................................... 20 
 
Antimicrobial use data and HAI data .............................................................................................................. 23 
Antimicrobial use data ............................................................................................................................. 23 
Definitions of antimicrobial use data ..................................................................................................... 23 
Healthcare-associated infection data ......................................................................................................... 24 
Key terms and notes ........................................................................................................................... 24 
Definitions of healthcare-associated infection data ................................................................................. 25 
Recommended case-finding algorithm for healthcare-associated infections............................................... 27 
Numerator data in the light protocol ..................................................................................................... 28 
 
National/regional data .................................................................................................................................. 29 
Objectives .............................................................................................................................................. 29 
Notes..................................................................................................................................................... 29 
Definition of national/regional data ....................................................................................................... 29 
 
Data structure and variable names ................................................................................................................ 31 
Standard protocol option record types ...................................................................................................... 31 
Light protocol option record types ............................................................................................................ 31 
Note on microorganism and resistance data .............................................................................................. 31 
 
Acknowledgements ...................................................................................................................................... 33 
 
 
 
iii 
 
 
 

link to page 46 link to page 46 link to page 46 link to page 46 link to page 46 link to page 47 link to page 47 link to page 49 link to page 49 link to page 50 link to page 55 link to page 56 link to page 57 link to page 57 link to page 59 link to page 60 link to page 60 link to page 61 link to page 62 link to page 63 link to page 64 link to page 65 link to page 66 link to page 67 link to page 69 link to page 71 link to page 72 link to page 74 link to page 75 link to page 77 link to page 78 link to page 79 link to page 80 link to page 80 link to page 84 link to page 85 link to page 85 link to page 87 link to page 88  
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Annex 1. Additional materials ........................................................................................................................ 39 
 
Codebook............................................................................................................................................... 39 
Forms .................................................................................................................................................... 39 
TESSy variable definitions and validation rules ........................................................................................... 39 
Note on case definitions of healthcare-associated infections ........................................................................ 39 
 
Annex 2. Codebook ...................................................................................................................................... 40 
 
Specialty code list ................................................................................................................................... 40 
Diagnosis (site) code list for antimicrobial use ........................................................................................... 42 
Indications for antimicrobial use ............................................................................................................... 42 
Antimicrobial ATC codes (2016) ................................................................................................................ 43 
Healthcare-associated infections: code lists ............................................................................................... 49 
HAI code list, table ............................................................................................................................. 49 
Definition of active HAI ....................................................................................................................... 50 
HAI case definition codes, overview ..................................................................................................... 51 
BSI origin (BSI source) code list ........................................................................................................... 52 
 
Case definitions of healthcare-associated infections ................................................................................... 53 
SSI: SURGICAL SITE INFECTION ......................................................................................................... 53 
PN: PNEUMONIA ................................................................................................................................ 54 
UTI: URINARY TRACT INFECTION........................................................................................................ 55 
BSI: BLOODSTREAM INFECTION .......................................................................................................... 56 
CRI: CATHETER-RELATED INFECTION .................................................................................................. 57 
BJ: BONE AND JOINT INFECTION ........................................................................................................ 58 
CNS: CENTRAL NERVOUS SYSTEM INFECTION ..................................................................................... 59 
CVS: CARDIOVASCULAR SYSTEM INFECTION ....................................................................................... 60 
EENT: EYE, EAR, NOSE, THROAT, OR MOUTH INFECTION ...................................................................... 62 
LRI: LOWER RESPIRATORY TRACT INFECTION, OTHER THAN PNEUMONIA............................................. 64 
GI: GASTROINTESTINAL SYSTEM INFECTION ....................................................................................... 65 
REPR: REPRODUCTIVE TRACT INFECTION ........................................................................................... 67 
SST: SKIN AND SOFT TISSUE INFECTION ............................................................................................. 68 
SYS: SYSTEMIC INFECTION ................................................................................................................ 70 
NEO: SPECIFIC NEONATAL CASE DEFINITIONS ..................................................................................... 71 
 
Algorithm for diagnosis of catheter-related infections ................................................................................. 72 
 
Microorganism code list ........................................................................................................................... 73 
Microorganism code list (PPS selection), by category ............................................................................. 73 
Antimicrobial resistance markers and codes .......................................................................................... 77 
 
Surgery categories .................................................................................................................................. 78 
NHSN surgery codes ........................................................................................................................... 78 
Examples of non-NHSN surgery ........................................................................................................... 80 
 
References .................................................................................................................................................. 81 
 
 
 
iv 
 
 
 

link to page 11 link to page 13 link to page 13 link to page 17 link to page 18 link to page 18 link to page 25 link to page 27 link to page 27 link to page 34 link to page 35 link to page 36 link to page 13 link to page 13 link to page 14 link to page 39 link to page 40 link to page 40  
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Figures 
Figure 1. Examples of included and excluded patients in the point prevalence survey ........................................... 4 
Figure 2. Increasing design effect (DEFF) as a function of cluster size (average acute care hospital size) in the 
2011–2012 PPS database ............................................................................................................................... 6 

Figure 3. Hospital data 1/3 (form H1) ............................................................................................................ 10 
Figure 4. Hospital data 2/3 (form H2) ............................................................................................................ 11 
Figure 5. Hospital data 3/3 (form H3, optional): Ward indicator data collected at hospital level ........................... 11 
Figure 6. Ward data (form W) ....................................................................................................................... 18 
Figure 7. Patient-based risk factors (form A): one form per patient, antimicrobial use and HAI data collected on 
same form................................................................................................................................................... 20 

Figure 8. Recommended case finding algorithm for healthcare-associated infections .......................................... 27 
Figure 9. Antimicrobial use and HAI data form in the LIGHT option (form B2).................................................... 28 
Figure 10. National/regional data (form N) ..................................................................................................... 29 
Tables 
Table 1. Number of hospitals and patients needed to estimate an HAI prevalence of 6% (5–7%) with design effect 
depending on average acute care hospital size by country ................................................................................. 6 

Table 2. Criteria to categorise the national PPS sample representativeness .......................................................... 7 
Table 3. Conversion chart: PPS I protocol PPS antimicrobial marker data to the 4th level TESSy format ................ 32 
Table 4. Participants to ECDC PPS meetings on the first and second PPS protocol, by country and institution, 2009–
2015 ........................................................................................................................................................... 33 
 
 

 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Abbreviations 
A&E 
Accidents and emergency  
AM 
Antimicrobial/antimicrobial agent 
AMR 
Antimicrobial resistance 
ATC 
Anatomical Therapeutic Chemical classification system (WHO) 
AU 
Antimicrobial use 
BSI 
Bloodstream infection 
CDC 
Centres for Disease Control and Prevention (Atlanta, USA) 
CDI 
Clostridium difficile infections 
CFU 
Colony-forming units 
CVC 
Central vascular catheter 
DSN 
Dedicated surveillance network 
EARS-Net 
European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (at ECDC) 
ECDC 
European Centre for Disease Prevention and Control 
EEA 
European Economic Area 
EFTA 
European Free Trade Association 
ESAC 
European Surveillance of Antimicrobial Consumption project 
ESBL 
Extended-spectrum beta-lactamases 
ESCMID 
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 
ESGARS 
ESCMID Study Group on Antimicrobial Resistance Surveillance 
ESICM 
European Society of Intensive Care Medicine 
FTE 
Full-time equivalent 
HAI 
Healthcare-associated infections 
HAI-Net 
Healthcare-Associated Infection surveillance Network (at ECDC) 
HALT 
Healthcare-associated infections in long-term care facilities (ECDC-sponsored follow-up project 
to IPSE WP7) 
HCW 
Healthcare worker 
HELICS 
Hospitals in Europe Link for Infection Control through Surveillance project 
ICU 
Intensive care unit 
IPSE 
Improving Patient Safety in Europe project 
LTCF 
Long-term care facility 
LRT 
Lower respiratory tract 
MS 
Member States 
NHSN 
National Healthcare Safety Network (at CDC) 
PPS 
Point prevalence survey(also used as an abbreviation of the current survey) 
PVC 
Peripheral vascular catheter 
SPI 
Structure and process indicator 
SSI 
Surgical site infection 
TESSy 
The European Surveillance System (ECDC’s web-based data reporting system for the 
surveillance of communicable diseases) 
TRICE 
Training in Infection Control in Europe (ECDC-sponsored follow-up project to IPSE WP1) 
WHO 
World Health Organization 
 
vi 
 
 
 

link to page 88 link to page 88 link to page 88 link to page 88 link to page 88 link to page 88  
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Background and changes to the protocol 
In July 2008, the coordination of the EU-funded network IPSE (Improving Patient Safety in Europe) [1] and its 
component for the surveillance of healthcare-associated infections, HELICS (Hospitals in Europe Link for Infection 
Control through Surveillance), were transferred to ECDC to form ECDC’s healthcare-associated infections 
surveillance network, HAI-Net. Later, ECDC adopted a plan to conduct EU-wide point prevalence survey (PPS) of 
healthcare-associated infections (HAIs), based on the recommendations of the external evaluation of the IPSE 
network and on the conclusions of an expert group that met in January 2009. It was also agreed to include the 
hospital PPS component of the EU-funded ESAC project (European surveillance of antimicrobial consumption) in 
the ECDC PPS protocol.  
ECDC subsequently developed a protocol for PPSs of HAIs and antimicrobial use in acute care hospitals through 
seven expert meetings held between 2009 and 2011. More than 100 experts and representatives from all EU 
Member States, two EEA countries, four EU enlargement countries, international partners (the European Society of 
Intensive Care Medicine, WHO Regional Office for Europe, the United States Centers for Disease Control and 
Prevention), the ESAC project and ECDC contributed to the development of the PPS protocol. The first ECDC PPS 
based on this protocol was conducted in 2011–2012 (version 4.2 and 4.3 of the protocol, see [2])
The protocol provides a standardised methodology to Member States and hospitals in response to article II.8.c of 
Council Recommendation 2009/C 151/01 of 9 June 2009 on patient safety, including the prevention and control of 
healthcare-associated infections [3]. It also integrates the main variables of the ESAC hospital PPS protocol, 
thereby also providing support to Council Recommendation 2002/77/EC of 15 November 2001 on the prudent use 
of antimicrobial agents in human medicine.  
Version 5.3 is the final protocol for the second EU-wide point prevalence survey 2016–2017. It contains major 
changes compared to protocol version 4.3 (PPS 2011–2012). Compared to version 5.1 and version 5.2 (distributed 
to EU/EEA Member States in January and May 2016, respectively), the current version only contains a few 
corrections, editorial changes and clarifications.  
Changes to the protocol were discussed during six ECDC meetings held between 2013 and 2015 (involving 
153 participants, see Acknowledgements below). The new protocol further supports Council Recommendation 
2009/C 151/01 by including more structure and process indicators for the prevention of HAIs and antimicrobial 
resistance (AMR) in acute care hospitals, based on a systematic review of such indicators performed upon ECDC’s 
request [4].  
Indicators for antimicrobial stewardship are based on a consensus process carried out by a working group of the 
Transatlantic Taskforce on Antimicrobial Resistance (TATFAR) [5]. The new protocol also takes into account several 
lessons learned from the first ECDC point prevalence survey in 2011–2012 [6].  
The main changes compared to protocol version 4.3 (PPS 2011–2012) can be summarised as follows: 
 
Inclusion criteria now include chronic care wards in acute care hospitals. 
 
Inclusion of new structure and process indicators for HAI and AMR prevention at the hospital and ward 
level. 
 
Hospital data: Hospital ownership, more details on administrative hospital groups  
 
Ward data: Simplified ward specialty variable 
 
Patient data (standard protocol option only):  
 
Birth weight for neonates 
 
Surgery codes for patients with surgery since admission 
 
Antimicrobial use data:  
 
Date of start of the antimicrobial. Was the antimicrobial changed? If so, what was the reason for 
changing the antimicrobial? What was the start date for the first antimicrobial given for this infection 
episode? Information on the changed antimicrobials (plus reasons for the change) will allow for the 
evaluation of taken measures to improve antimicrobial prescribing, thus adding value to the PPS at 
the local hospital level. The start date (i.e. the date when the antimicrobial was first administered) 
serves as proxy indicator of the validity (sensitivity and specificity) of the prevalence of HAIs and will 
be used to estimate the total annual number of patients receiving antimicrobials in EU hospitals 
(prevalence to incidence conversion); as indicator of data validity, this variable needs to be 
interpreted together with the validation studies performed during the national PPS. 
 
Dosage per day (number, strength and unit of doses per day): to inform EU/US comparisons and 
updates of the defined daily dose (DDD) as set by the WHO Collaborating Centre for Drug Statistics 
Methodology, Norwegian Institute of Public Health (www.whocc.no). 

 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
 
HAI and AMR data:  
 
HAI associated to current ward 
 
AMR marker data collected as S/I/R/U rather than ‘susceptible/non-susceptible’, in addition to 
‘pandrug resistant’ (PDR)  
 
Codebook: 
 
Specialty list: new ward specialty code list (with only main specialties), consultant/patient specialty 
codes for healthy neonates added 
 
Diagnosis (site) code list for antimicrobial use: surgical site infection (SSI) was added as a 
subcategory of both skin or soft tissue infections (SST) and bone or joint infections (BJ); addition of 
cystic fibrosis (CF) as a separate entry 
 
Antimicrobial ATC codes: updated with new codes added since 2011 
 
HAI case definitions: 
  Surgical site infection (SSI): follow-up period of deep incisional and organ/space SSIs after 
implant surgery: changed from one year to 90 days 
  Pneumonia (PN): note added indicating that one definitive chest X-ray or CT-scan for the current 
pneumonia episode may be sufficient in patients with underlying cardiac or pulmonary disease if 
comparison with previous X-rays is possible 
  Clostridium difficile infection (GI-CDI): definition is now aligned with the case definition in the 
CDI surveillance protocol in order to account for other methods for detecting toxin-producing 
C. difficile organisms in stool. 
  SYS-CSEP: no change in the definition, but change of the name from ‘clinical sepsis’ to ‘treated 
unidentified severe infection’ in adults and children, to differentiate this last-resort HAI case 
definition from the modern concept of sepsis based on organ dysfunction. 

 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Objectives 
The objectives of the ECDC point prevalence survey of healthcare-associated infections (HAIs) and antimicrobial 
use (AU) in acute care hospitals are as follows: 
 
to estimate the total burden (prevalence) of HAIs and antimicrobial use in acute care hospitals in the EU 
 
to describe patients, invasive procedures, infections (sites, microorganisms including markers of 
antimicrobial resistance) and antimicrobials prescribed (compounds, indications) 
 
by type of patients, specialties or healthcare facilities and 
 
by EU country, adjusted or stratified 
 
to describe key structures and processes for the prevention of HAIs and antimicrobial resistance at the 
hospital and ward level in EU hospitals 
 
to disseminate results to those who need to know at local, regional, national and EU level: 
 
to raise awareness 
 
to enhance surveillance structures and skills 
 
to identify common EU problems and set up priorities accordingly 
 
to evaluate the effect of strategies and guide policies for the future at the local1/national/regional 
level (repeated PPS) 
 
to provide a standardised tool for hospitals1 to identify targets for quality improvement. 
 
 
                                                      
1 Results at the local (hospital) level should be interpreted careful y and take into account confidence intervals which are 
influenced by the hospital size (number of patients) and the frequency of the event (relatively wider intervals for rare events). 
Even if all patients in the hospital are included in the survey, one should consider that the survey day is only a sample of all 
possible days in that period. The evaluation of the effects of interventions in-between two repeated surveys are more likely to be 
more meaningful for interventions where important improvement can be expected (e.g. introduction of antimicrobial stop orders, 
control of an epidemic of specific healthcare-associated infections). If point prevalence surveys are repeated over several years, it 
wil  eventually become possible to interpret even weak trends. 

 
 
 


 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Inclusion/exclusion criteria 
Hospitals 
All acute care hospitals are eligible for inclusion. An acute care hospital is defined in accordance with national 
definitions. There is no minimal size of hospitals. 
For administrative hospital groups (hospital ‘mergers’ or ‘trusts’), data should ideally be collected by hospital site.  
Wards 
Include all wards in acute care facilities, including, for example, chronic care and long-term care wards, acute 
psychiatric wards and neonatal ICUs. 
Excluded are accident and emergency departments (except for wards attached to A&E departments where patients 
are monitored for more than 24 hours). 
The ward specialty is always recorded so that results can be stratified and standardised. 
Patients 
Include all patients admitted to the ward before or at 8 a.m. and not discharged from the ward at the time of the 
survey; in practice, this means that patients transferred in/out after 8 a.m. from/to another ward should not be 
included (see Figure 1). Include neonates on maternity and paediatric wards if born before/at 8 a.m. (see also 
under neonates). 
Exclude day cases: 
 
patients undergoing same day treatment or surgery; 
 
patients seen at outpatient department; 
 
patients in the emergency room;  
 
dialysis patients (outpatients). 
Note: Decision to include/exclude patients is based on information available at 8 a.m. on the day of the survey. 
Figure 1. Examples of included and excluded patients in the point prevalence survey 
 
Legend. W1: ward 1, W2: ward 2 
Note: Include patients who are temporarily off from the ward for diagnostic investigations, procedures; if patient does not return 
to the ward before the end of the PPS day and information about patient is not available at 8 a.m., please revisit ward. 
Include patients who are on the patient administration system but at home for a number of hours. 

 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Sample design 
Sampling of patients within the hospital 
All eligible patients will be included. This will enhance the local usefulness of the results because of the larger 
sample size by hospital (see objectives). 
Representative sampling of hospitals (for PPS coordinating 
centres only) 
In accordance with objective 1, the results of the PPS should ideally be based on data from hospitals that are 
representative of all acute care hospitals in the European Union. However, to meet national objectives, results 
should also be representative for each of the Member States’ total hospital population to be meaningful.  
Representative samples will be drawn using a systematic sampling design.  
Steps  
1. Obtain a list (for example in Microsoft Excel format) of all acute care hospitals in the country, including the 
number of acute care beds (use the total number of beds if the number of acute care beds is unknown). 
2. Rank the list in ascending order of the number of beds. 
3. Obtain the number of hospitals to be sampled from ECDC or from the tables and figures below. 
4. Divide the total number of hospitals by the number to be sampled = sampling interval k. 
5. Choose a random number between 1 and k = i. 
6. Select the ith hospital, ith +k hospital, the ith+2k hospital etc. 
7. Foresee substitution in the case of refusal of the first selected hospital: select the next hospital on the list (ith +1 
hospital, ith +k +1 hospital, etc.); if more than one refusal is expected per selected hospital, make a second list of 
reserve hospitals. 
8. Invite the hospitals selected in step 6 to participate; replace them in the case of refusal to participate. 
Systematic sampling procedure: Sorting the hospitals according to the number of beds before the selection process 
ensures that hospitals of different sizes are represented in exactly the same way in the sample as in the 
national/regional population of hospitals. Additional sorting according to hospital type (for example 
primary/secondary/tertiary, or any other available national categories that are related to case-mix severity) is 
recommended, as it ensures representativeness of the different types of hospitals. If the hospital type is available, 
first sort the hospital list according to hospital type, then according to size, before starting the systematic sampling 
procedure. 
Design effect and sample size 
The sample size is calculated to estimate an anticipated prevalence of 6% with a precision of +/- 1% at the 
national level. The proposed precision of the results is similar for all Member States. The number of hospitals to be 
included depends on the expected design effect and on the average hospital size in each country. The total number 
of hospitals and patients in the country has only a small effect on the recommended sample size.  
The selected hospitals can be considered as clusters of patients of the total acute care hospital patient population. 
Therefore a correction for cluster surveys (design effect) has to be applied when calculating the sample size.  
The design effect (DEFF) of a statistic is the ratio of actual variance for a given sample design over the variance if 
the patients were selected randomly (i.e. from all, or a much larger number of hospitals). The higher the design 
effect, the more patients have to be included in the sample to estimate the same prevalence with the same 
precision. The design effect increases with the size of the clusters (average hospital size) and with the magnitude 
(frequency) of the outcome under study (higher for antimicrobial use than for healthcare-associated infections). 
The DEFF for HAI prevalence was calculated on the basis of data from the 2011–2012 ECDC PPS with the Stata 12 
software package (using the survey prefix command ‘svy’). It was higher than expected compared with earlier 
national point prevalence surveys and the pilot ECDC PPS: overall DEFFPPS=8.0 compared with DEFF=5.4 as 
estimated earlier. Further simulations on subsamples from the database of the 2011–2012 ECDC PPS made it 
possible to estimate the design effect for different hospital size categories (Figure 2).  

 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Figure 2. Increasing design effect (DEFF) as a function of cluster size (average acute care hospital 
size) in the 2011–2012 PPS database 

12
10.5
10
tceff 8
8
e
6.8
gn is 6
5.7
5.7
6
De
4
4.1
2.6
2.7
2
1.8
0
Number of included patients in PPS by hospital (deciles)
 
Table 1 below shows the recommended sample size of patients and hospitals by country, using the national 
denominator data provided during the 2011–2012 PPS and the estimated design effect for an estimated HAI 
prevalence of 6% +/- 1% for different hospital sizes. If denominator data at the time of the PPS differ from the 
ones presented in the table, it is recommended that the number of patients and hospitals to be sampled are 
recalculated. For example, if national statistics report hospital groups (rather than hospital sites), but sampling for 
the PPS is done by site (rather than by group), national PPS coordinators should adjust the estimated DEFF and the 
number of hospitals (or hospital sites) to be sampled (Figure 2). This could, for example, result in a lower total 
number of patients but a higher number of (smaller) hospital entities.  
Table 1. Number of hospitals and patients needed to estimate HAI prevalence of 6% (5–7%), with 
design effect depending on average acute care hospital size by country 
Number of 
Country 
Number of acute 
Number of 
Average 
Estimated 
Recommended 
care hospitals(a)  hospital beds(a)  hospital size 
DEFF 
sample size, patients 
hospitals to be 
sampled 
Austria 
189 
53 371 
282 
6.0 
12 493 
44 
Belgium 
194 
51 798 
267 
6.0 
12 478 
47 
Bulgaria 
241 
44 164 
183 
5.7 
11 773 
64 
Croatia 
60 
15 640 
261 
6.0 
11 419 
44 
Cyprus 

2 769* 
346 
6.8 
2769 

Czech Republic 
158 
57 756 
366 
6.8 
14 201 
39 
Denmark 
52 
13 779 
265 
6.0 
11 234 
42 
Estonia 
40 
4 685 
117 
4.1 
4 685 
40 
Finland 
59 
9 601* 
163 
5.7 
9 601 
59 
France 
1558 
314 598 
202 
5.7 
12 265 
61 
Germany 
1736 
461 022 
266 
6.0 
12 939 
49 
Greece 
137 
35 120 
256 
6.0 
12 245 
48 
Hungary 
108 
69 466 
643 
10.5 
22 062 
34 
Iceland 

1 046 
131 
4.1 
1 046 

Ireland 
60 
12 398 
207 
5.7 
10 514 
51 
Italy 
1023 
226 095 
221 
5.7 
12 233 
55 
Latvia 
17 
6 975 
410 
8.0 
6 975 
17 
Lithuania 
92 
20 867 
227 
5.7 
11 189 
49 
Luxembourg 

2 377 
264 
6.0 
2 377 

Malta 

1 339 
446 
8.0 
1 399 

Netherlands 
96 
50 095* 
522 
8.0 
16 615 
32 
Norway 
60 
16 282 
271 
6.0 
11 474 
42 
Poland 
795 
181 077 
228 
5.7 
12 204 
54 
Portugal 
101 
24 773 
245 
6.0 
11 955 
49 
Romania 
311 
111 725 
359 
6.8 
14 453 
40 
Slovakia 
112 
31 217 
279 
6.0 
12 157 
44 

 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Number of 
Country 
Number of acute 
Number of 
Average 
Estimated 
Recommended 
care hospitals(a)  hospital beds(a)  hospital size 
DEFF 
sample size, patients 
hospitals to be 
sampled 
Slovenia 
21 
7 826 
373 
6.8 
7826 
21 
Spain 
550 
117 504 
214 
5.7 
12 126 
57 
Sweden 
80 
18 947* 
237 
6.0 
11 667 
49 
UK-England 
253 
158 928* 
628 
10.5 
22 444 
36 
UK-Northern Ireland 
16 
4 985 
312 
6.8 
4 985 
16 
UK-Scotland 
52 
16 537 
318 
6.8 
13 027 
41 
UK-Wales 
89 
9 952* 
112 
4.1 
7 296 
65 
(a) Number of hospitals and hospital beds as reported in the ‘national denominator data’ in the 2011–2012 PPS. If not 
available (*), Eurostat data for N of hospital beds (curative) are used. See: http://ec.europa.eu/eurostat/web/health/health-care. 
Sample size calculations were made using OpenEpi software (www.openepi.com); DEFF=design effect, estimated from the 2011–
2012 PPS database for different hospital sizes (deciles, see Figure 2); countries in italics need to include all hospitals. 
Other sampling methods: reporting of results and data collection 
periods 
Although representative sampling remains strongly recommended for the ECDC point prevalence survey, some 
countries may have difficulties to draw a representative sample of hospitals or may decide to use a different 
method for hospital recruitment, e.g. because the data quality is expected to be affected if representative sampling 
is used. Alternative methods of recruiting hospitals are voluntary participation after invitation of all hospitals, 
‘convenience’ sampling (selection of hospitals by the PPS coordinating centre) or mandatory participation. The 
hospital sampling/recruitment method(s) used is (are) recorded at the national/regional level and will be included 
when country data are reported at the European level.  
Moreover, some countries may want to include more hospitals than just those included in the sample, e.g. a 
combination of a representative sample and voluntary participation after invitation of all hospitals. In this case, only 
data of the representative sample will be used when European results are reported. However, if all data are 
submitted, ECDC will provide the national coordinators with feedback reports for all participating hospitals by 
comparing their results to the total national results. A variable at the hospital level indicates whether a hospital 
belongs to the representative sample or not (this variable should be provided by the national coordinator). This 
information will then be combined with the sampling method used at the national level to determine the sample for 
which national results are reported at the European level. If the number of submitted hospitals exceeds the 
recommended number for that country and information on whether the hospital is part of the representative 
sample is missing, ECDC will draw a random sample of the required number of hospitals for the reporting at the 
European level in order to obtain prevalence estimates with a similar precision as for other countries. 
In order to increase the number of participating hospitals for the 2016–2017 ECDC PPS, hospitals may be included 
in any of the four PPS periods: April–June 2016, September–November 2016, April–June 2017, and September–
November 2017. Although it is recommended that data collection should be organised during a single period for all 
hospitals, data collection may also extend over several periods. The same hospital may only be included once over 
the four periods. 
The national sample representativeness is assigned one of four categories (optimal, good, poor and very poor; 
Table 1) depending on compliance with the recommended sampling methodology.  
Table 2. Criteria for national PPS sample representativeness 
Optimal 
•  Systematic random sample of at least 25 hospitals or at least 75% of the number of hospitals specified in Table 
1. 
•  Inclusion of at least 75% of al  hospitals or occupied hospital beds in the country and recommended sample 
size (Table 1) achieved  
Good 
•  Selection of at least 25 hospitals or at least 75% of the number of hospitals and/or residents specified in 
Table 1 using another methodology (e.g. voluntary participation); 
•  Recommended sample size not achieved, but inclusion of ≥75% of al  hospitals or occupied hospital beds in 
the country. 
Poor 
•  Between 5 and 25 hospitals included in countries with more than 25 hospitals and recommended sample size 
not achieved; 
•  Less than 5 hospitals included in countries with more than 5 hospitals but inclusion of 50–75% of al  hospitals 
or occupied hospital beds in the country. 
Very poor 
•  Inclusion of less than 5 hospitals and less than 50% of all hospitals and less than 50% of all occupied hospital 
beds. 
 
 
 

 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Data collection 
Data collection includes variables at the national, hospital, ward and patient level. In the patient-based (standard) 
protocol, denominator data are collected for each patient. In the unit-based (light) protocol, aggregated 
denominator data are collected for each ward. In both protocol options, hospital and ward data (optional 
indicators) are collected, and numerator data are collected for each patient with an active healthcare-associated 
infection (related to acute care hospital stay) and/or receiving an antimicrobial drug at the time of the survey. The 
patient-based and unit-based protocol may not be combined for the same PPS in a single hospital.  
When? 
Data should be collected in a single day for each ward/unit. The total time frame for data collection for all wards of 
a single hospital should not exceed two to three weeks. It is practice in some hospital units to admit additional 
patients on Mondays for elective procedures; it is therefore recommended to conduct the survey in these units 
between Tuesday and Friday. 
Who will collect the data? 
The composition of the team responsible for data collection may vary from one hospital to another. It is 
recommended that hospital infection control personnel as well as the team in charge of the patients are involved.  
Training of surveyors 
Training material for the personnel collecting the data is made available by ECDC. It is recommended that 
national/regional PPS coordinators organise at least a one-day information and training session for participating 
hospitals prior to the point prevalence survey.  
Data processing 
Each country is free to organise its own system for data collection and processing. The standard scenario however 
foresees that data should be collected on forms (see examples provided in this protocol) and subsequently be 
entered in a computer system by the hospital staff after data verification. Countries may choose to develop and 
use their own software system to do this. Alternatively, ECDC supports a free software tool for data entering at the 
hospital level (HelicsWin.Net). If HelicsWin.Net is used, data should be exported by the hospitals and transferred to 
the national coordination centre. National centres will then submit the national database or individual hospital data 
to ECDC, using ECDC’s TESSy, after which online reports will be made available by ECDC (see also chapter on 
sample design for reporting of results at the European and hospital level).  
 
 

 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Overview of collected data 
Data collected at the hospital level conform to the following two protocol types: 
Light (unit-based) protocol 
 
Hospital data (forms H1-H3): one form per hospital per PPS. 
 
Ward data (form W): one form per ward, including structure and process indicators (optional) and 
denominator data for all patients present in the ward at 8 a.m. and not discharged at the time of the survey 
(mandatory). 
 
Numerator data (form B): healthcare-associated infection data (to be collected for all patients with an 
infection that matches the definition of active healthcare-associated infection) and/or antimicrobial use data 
(to be collected for all patients receiving an antimicrobial agent), together with basic patient variables for 
each patient with an HAI and/or receiving an antimicrobial agent. 
 
National data (e.g. hospital denominator data) are collected by the PPS coordinating centre (form N). 
Standard (patient-based) protocol 
 
Hospital data (forms H1–H3): one form per hospital per PPS. 
 
Ward data (form W): one form per ward, including structure and process indicators (optional) and 
denominator data for all patients present in the ward at 8 a.m. and not discharged at the time of the survey 
(optional). 
 
Patient data (form A): one form per patient (for all patients present in the ward at 8 a.m. and not 
discharged at the time of the survey) collecting risk factors for each eligible patient, with or without an HAI 
or antimicrobial; healthcare-associated infection data (to be collected for all patients with an infection that 
matches the definition of active healthcare-associated infection) and/or antimicrobial use data (to be 
collected for all patients receiving an antimicrobial agent) are collected on the same form.  
 
In addition to the hospital data, national data (e.g. hospital denominator data) are collected by the PPS 
coordinating centre (form N). 
 
 

 
 
 

link to page 88
 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Hospital data 
Hospital variables are collected in order to describe results by type and size of healthcare facilities and by the 
average length of stay in the hospital, a variable which is known to influence prevalence figures because patients 
with infections are known to stay longer in the hospital than the average hospital population. 
The questionnaire also includes structure and process indicators (SPIs) at the hospital level in the context of 
Council Recommendation 2009/C 151/01 of 9 June 2009 on patient safety, including the prevention and control of 
healthcare-associated infections. For the selection process of SPIs and the scientific reference [4], see introduction.  
Figure 3. Hospital data 1/3 (form H1) 
 
10 
 
 
 



 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Figure 4. Hospital data 2/3 (form H2) 
 
 
Figure 5. Hospital data 3/3 (form H3, optional): Ward indicator data collected at hospital level 
 
 
11 
 
 
 

link to page 88 link to page 88 link to page 88  
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Definition of hospital data 
Hospital code. 
Hospital identifier/code assigned by national/regional PPS coordinating centre; unique code per 
surveillance/PPS network; should remain the same for all PPS periods/years.  
Survey dates. Start and end date for the PPS in the entire hospital; the end date is the date the data were 
collected in the last ward. 
Hospital size. Total number of beds in the hospital. Include all beds that may generate (in)patient-days and 
admissions/discharges. Exclude beds which are exclusively used for day cases (e.g. day-care wards).  
Number of acute care beds. Number of acute care beds in the hospital (in accordance with to national 
definition) 
Number of ICU beds. Number of intensive care unit beds in the hospital. No ICU=0  
Ward exclusion. Were any wards excluded for the PPS in your hospital? Yes/No. 
Specify excluded wards. Specify which wards where excluded, if any; free text; please use specialty codes if 
possible. 
Total number of beds in included wards. Sum of the number of beds in wards that were included in the PPS.  
Total number of patients included in PPS. Sum of the number of patients included in the PPS; variable used 
to double-check the exhaustiveness of reported data, i.e. the sum of a ward’s total number of patients in the light 
protocol option, or the total number of individual patients in the standard protocol option.  
Hospital type. Hospital type – PRIM: primary, SEC: secondary, TERT: tertiary, SPEC: specialised (definitions see 
below), missing=UNK; include specialisation if applicable; report the hospital type of the hospital site (single 
hospital) here; the type of the administrative hospital group/trust (if applicable) is reported in a separate variable 
(see variable ‘Administrative hospital group type’ below). 
1 Primary 
 
Often referred to as ‘district hospital’ or ‘first-level referral’. 
 
Few specialities (mainly internal medicine, obstetrics-gynaecology, paediatrics, general surgery or only general 
practice). 
 
Limited laboratory services are available for general, but not for specialised pathological analysis. 
 
Often corresponds to general hospital without teaching function. 
2 Secondary 
 
Often referred to as ‘provincial hospital’. 
 
Hospital is highly differentiated by function with five to ten clinical specialities, such as haematology, oncology, 
nephrology, ICU. 
 
Takes some referrals from other (primary) hospitals. 
 
Often corresponds to general hospital with teaching function. 
3 Tertiary 
 
Often referred to as ‘central’, ‘regional’ or ‘tertiary-level’ hospital. 
 
Highly specialised staff and technical equipment (ICU, haematology, transplantation, cardio-thoracic surgery, 
neurosurgery). 
 
Clinical services are highly differentiated by function. 
 
Specialised imaging units. 
 
Provides regional services and regularly takes referrals from other (primary and secondary) hospitals. 
 
Often a university hospital or associated to a university. 
4 Specialised hospital 
 
Single clinical specialty, possibly with sub-specialties. 
 
Highly specialised staff and technical equipment. 
 
Specify (e.g. paediatric hospital, infectious diseases hospital). 
Hospital specialisation type. Free text. Include hospital specialty if specialised hospital (e.g. paediatric, 
infectious diseases, etc.); please use specialty codes if possible 
Hospital ownership. Hospital ownership as defined by WHO Regional Office for Europe [7], Eurostat [8] and OECD 
[9]: PUB: Public, PRIVNFP: private, not-for-profit, PRIVFP: private, for profit, OTHUNK: other or unknown 
 
Public: Hospitals that are owned or controlled by a government unit or a public corporation (where control is 
defined as the ability to determine the general corporate policy). 
12 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
 
Private, not for profit: Hospitals that are legal or social entities created for the purpose of producing goods and 
services, whose status does not permit them to be a source of income, profit, or other financial gain for the 
unit(s) that establish, control or finance them. 
 
Private, for profit: Hospitals that are legal entities set up for the purpose of producing goods and services and 
are capable of generating a profit or other financial gain for their owners. 
 
Other or unknown: Hospital ownership cannot be categorised as one of one of the above, or hospital 
ownership is unknown.  
Note: If applicable, prioritise ‘for profit’ over ownership of the building, e.g. if a hospital building is state-owned but the 
management is private (for profit), select ‘private, for-profit’.  
Hospital is part of administrative hospital group (AHG): The hospital is part of an administrative group of 
hospitals (AHG, including entities referred to as ‘trusts’, ‘mergers’, ‘fusions’, ‘boards’, ‘chains’, etc.). Yes/No 
Data apply to single hospital site or to AHG/trust. If the hospital is part of an administrative hospital group 
(AHG), data apply to a single hospital (hospital with a single address, or a hospital site belonging to a trust) (S) OR 
to an administrative group of hospitals (T). 
AHG code. Unique code/identifier for the administrative hospital group; text allowed; please ensure that the AHG 
code/identifier is identical for all hospital sites belonging to that AHG. Code is selected and generated by the 
Member State and should remain identical in different surveillance/PPS periods/years; can be identical to the 
hospital code if the data apply to an AHG. 
Administrative hospital group type. If the hospital is part of an AHG, what is the hospital type, e.g. PRIM: 
primary, SEC: secondary, TERT: tertiary, SPEC: specialised (see above for definition of hospital type). Report the 
highest level of care, e.g. ‘tertiary’ if a group with three sites contains one specialised, one primary, one secondary 
and one tertiary hospital. The combined services of the hospital sites belonging to a hospital group may also 
change the level of care (e.g. combination of the clinical specialties of primary and/or specialised hospitals may 
result in the AHG matching the definition of a secondary hospital). 
Total number of beds in administrative hospital group. Total number of beds of the administrative hospital 
group.  
Number of acute care beds in administrative hospital group. Total number of acute care beds of the 
administrative hospital group. 
Hospital indicators: 
Number of discharges/admissions. Number of hospital discharges in a given year (data from previous year if 
available, specify year in second column), use number of admissions if discharges are not available; provide the 
number for the included wards only (if not available, provide number for entire hospital; specify ‘included wards 
only’ OR ‘total for hospital’ in last column). 
Number of patient-days. Number of hospital patient-days in a given year (data from previous year if available, 
specify year in second column). Provide data for the same year and wards (included wards only OR total for 
hospital) as for the number of discharges/admissions.  
Alcohol hand rub consumption. Total number of litres of alcoholic hand rub used in a given year (data from 
previous year if available, specify year in second column); provide the number for the included wards only (if 
available, otherwise provide number for the entire hospital; specify ‘included wards only OR total for hospital’ in 
last column). 
Number of observed hand hygiene opportunities. Number of observed hand hygiene opportunities 
performed in the previous year (or the most recent available year). Report the total number of observed 
opportunities for hand hygiene, not only the compliant observations.  
Number of blood cultures per year. Number of inpatient blood culture sets received and incubated by the 
microbiological laboratory for the current hospital over the period of one year. Provide data for the previous year or 
report the most recent available data (specify year data in a separate variable). If the number of blood culture sets 
is not available, estimate by dividing the [total number of blood culture bottles processed] by the [total number of 
bottles per blood culture request]. Count all blood culture sets per patient, not the number of patients for whom 
≥1 set was processed. Count the number of blood culture sets actually received and incubated, not the number 
sent to the laboratory for analysis. 
Number of stool tests for CDI per year. Number of inpatient stool tests performed for Clostridium difficile 
infections (CDI) per year. Provide data for previous year or the most recent available data (specify year data in a 
separate variable). Count all stool specimens per patient, not the number of patients for whom ≥1 test was 
performed. Count the number of stool specimens actually processed by the laboratory (= at least one test for CDI 
was performed on the sample), not the number sent to the laboratory for analysis. 
13 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Number of FTE infection control nurses. Number of full-time equivalent (FTE) infection control nurses in the 
hospital; infection control nurse=nurse with specialised training in infection control/hospital hygiene and usually 
responsible for infection control/hospital hygiene tasks such as training of hospital employees in infection control, 
elaboration and implementation of infection control procedures, management (implementation, follow-up, 
evaluation) of an infection control work plan and projects, audits and evaluation of performance, procedures for 
disinfection of medical devices etc.. Specify year of data collection (current year if available) and whether the 
number of FTE infection control nurses is provided for the entire hospital or only for the included wards. 
Number of FTE infection control doctors. Number of full-time equivalent (FTE) infection control doctors (or 
pharmacists, hospital epidemiologists, etc.) in the hospital with specialised training in infection control/hospital 
hygiene and usually responsible for infection control/hospital hygiene tasks such as identification and investigation 
of outbreaks, analysis and feedback of infection control data, elaboration of an infection control work plan and 
projects, design and management of surveillance systems, elaboration of infection control procedures etc.. Please 
ensure that the reported number was collected for the same year and wards (included wards only OR total for 
hospital) as the number of FTE infection control nurses. 
Number of FTE antimicrobial stewardship consultants. Number of full-time equivalent antimicrobial 
stewardship consultants in the hospital. FTE antimicrobial stewardship refers to the dedicated time of a consultant 
(or pharmacist) employed by the hospital and specifically paid for antimicrobial stewardship tasks (e.g. 
antimicrobial stewardship activities mentioned as part of his/her job description), not  the time spent by treating 
physicians on antimicrobial stewardship activities (e.g. post-prescription review) as part of their daily practice. 
Deduct FTE from FTE infection control doctor if same person: in case antimicrobial stewardship tasks are an 
integral part of the job description/daily activities of the infection control doctor (or equivalent), the estimated FTE 
(proportion of his/her time) spent on antimicrobial stewardship activities should be deduced from the FTE infection 
control doctors and be reported separately. 
Number of FTE registered nurses. Number of full-time equivalent registered (graduated, qualified) nurses in 
the hospital. A ‘registered nurse’ is a nurse who has graduated from a college’s nursing programme or from a 
school of nursing and has passed a national licensing exam to obtain a nursing license. Also include ‘agency 
nurses’, ‘bank nurses’, ‘interim nurses’ or other registered nurses who are not permanently employed for that 
position in the hospital. Students are not included. Provide current situation if possible, or the situation for the 
earliest available year (specify year) and specify if the number of FTEs is given for the entire hospital or for the 
included wards only. 
Number of FTE nursing assistants. Number of full-time equivalent nursing assistants in the hospital. A ‘nursing 
assistant’ is also referred to as ‘nurses’ aide’, ‘healthcare assistant’, ‘nursing auxiliary’, ‘auxiliary nurse’, ‘patient care 
assistant’ or similar terms. Also include nursing assistants who are not permanently employed for that position in 
the hospital. Nursing assistants work under the supervision of nurses or physicians to address the most 
fundamental elements of a patient’s care. In general, they feed, dress, bathe and groom patients, but they can 
also perform more medically oriented but basic duties such as measuring and recording temperature, blood 
pressure, and other vital signs. Other licensed health professionals such as dieticians, physiotherapists or speech or 
occupational therapists, logistic personnel, students of any kind or volunteers who provide basic patient care 
without pay should not be included. Provide current situation if possible, or the situation for the earliest available 
year (specify year) and specify if the number of FTEs is given for the entire hospital or for the included wards only. 
Number of FTE registered nurses in ICU. Number of full-time equivalent registered (graduated, qualified) 
nurses in intensive care unit(s). A ‘registered nurse’ is a nurse who has graduated from a college’s nursing 
programme or from a school of nursing and has passed a national licensing exam to obtain a nursing license. Also 
include ‘agency nurses’, ‘bank nurses’, ‘interim nurses’ or other registered nurses who are not permanently 
employed for that position in the hospital. Students are not included. Provide current situation if possible, or the 
situation for the earliest available year (specify year) and specify if the number of FTEs is given for the entire 
hospital or for the included wards only. 
Number of FTE nursing assistants in ICU. Number of full-time equivalent nursing assistants in in intensive 
care unit(s). A ‘nursing assistant’ is also referred to as ‘nurses’ aide’, ‘healthcare assistant’, ‘nursing auxiliary’, 
‘auxiliary nurse’, ‘patient care assistant’ or similar terms. Also include nursing assistants who are not permanently 
employed for that position in the hospital. Nursing assistants work under the supervision of nurses or physicians to 
address the most fundamental elements of a patient’s care. In general, they feed, dress, bathe and groom 
patients, but they can also perform more medically oriented but basic duties such as measuring and recording 
temperature, blood pressure, and other vital signs. Other licensed health professionals such as dieticians, 
physiotherapists or speech or occupational therapists, logistic personnel, students of any kind or volunteers who 
provide basic patient care without pay should not be included. Provide current situation if possible, or the situation 
for the earliest available year (specify year) and specify if the number of FTEs is given for the entire hospital or for 
the included wards only. 
14 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Number of airborne infection isolation rooms. Number of airborne infection isolation rooms in the hospital. 
An airborne infection isolation room is defined as a hospital room provided with negative pressure and an 
anteroom. 
Annual IPC plan, approved by CEO. Is there an annual infection prevention and control (IPC) plan and if so, 
was it approved by the hospital Chief Executive Officer (CEO, managing director) or by a senior executive officer? 
Yes/No. 
Annual IPC report, approved by CEO. Is there an annual infection prevention and control (IPC) report and if 
so, was it approved by the hospital Chief Executive Officer (CEO, managing director) or by a senior executive 
officer? Yes/No. 
Participation in surveillance networks. Indicate (Yes/No) if your hospital participates in a national or regional 
surveillance network for each of following surveillance modules: surveillance of surgical site infections (SSI), 
surveillance of HAIs in intensive care (ICU), surveillance of C. difficile infections (CDI), surveillance of antimicrobial 
resistance in accordance with the EARS-Net protocol (surveillance of antimicrobial resistance in invasive isolates of 
S. pneumoniae, S. aureus, Enterococcus spp., E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa and/or A. baumannii), 
surveillance of antimicrobial consumption in the hospital (surveillance at 5th ATC level in defined daily dose (DDD) 
per 1 000 patient-days) and other HAI or AMR surveillance modules (national/regional protocols for which a 
European/ECDC protocol does not exist). Local surveillance without transmission of data to a national or regional 
surveillance coordination centre for comparative analysis and feedback is not sufficient.  
Other surveillance networks specification. Free text. Specify which other surveillance networks the hospital 
participates in (free text). 
Microbiological laboratory performance during weekends. At weekends, can clinicians request routine 
microbiological tests and receive back results within the standard turnaround time? Report yes/no/unknown 
separately for Saturdays and Sundays for clinical tests and screening tests, respectively. 
Does your hospital have the following in place for HAI prevention or antimicrobial stewardship? 
Indicate for each of the main HAI types and for antimicrobial stewardship which components of a multimodal 
strategy are available at the hospital-wide level and specifically in intensive care (presence in at least one adult, 
paediatric or neonatal ICU). Each cell of the table is a Yes/No/Unknown variable (28 variables for ICU + 35 
variables hospital-wide/other non-ICU wards): mark Y=Yes, N=No or U=Unknown or ‘not assessed’ in each cell. 
A multimodal strategy is defined as an intervention aiming at improving practice and offering education and 
training at multiple levels (e.g. written information, leaflets, posters, bedside teaching, workshops, focus groups, 
knowledge tests, competency assessments, surveillance and feedback, audits, checklists). The strategy must be 
underpinned by written guidelines. Simple information sessions (e.g. for new staff), updating guidelines, or target 
setting alone (even if communicated to staff but without combining it with education and training) are not 
multimodal strategies.  
Targets for multimodal strategies:  
 
Pneumonia: prevention of healthcare-associated pneumonia. You should tick the box for pneumonia, even if 
the components of your multimodal strategy only refer to device-associated pneumonia. 
 
Bloodstream infections (BSIs): prevention of healthcare-associated BSIs. You should tick the box for 
bloodstream infections, even if the components of your multimodal strategy only refer to catheter-
associated/related BSIs.  
 
Surgical site infections (SSIs): prevention of SSIs. You should tick the box for surgical site infections, even if 
the components of your multimodal strategy only refer to specific types of surgery. 
Note: Prevention of SSIs in the ICU is assumed to be part of the hospital-wide SSI prevention strategy. 
 
Urinary tract infections (UTIs): prevention of UTIs. You should tick the box for urinary tract infections, even 
if the components of your multimodal strategy only refer to catheter-associated/related UTIs. 
 
Antimicrobial use/stewardship: Antimicrobial stewardship refers to a coordinated programme that 
implements interventions to ensure appropriate antimicrobial prescribing in order to improve clinical efficacy 
of antimicrobial treatment, to limit AMR and to prevent Clostridium difficile infections. Antimicrobial 
stewardship contributes to high quality and effective healthcare through decreasing unnecessary 
antimicrobial-related morbidity and mortality and limiting selective pressure to minimise development of 
resistance to currently effective antibiotics. 
Multimodal strategy components: only report the existence of any of following components when evidence can be 
presented, e.g. printed copies or electronic documents or tools. 
 
Guideline: written guideline document available on the ward  
15 
 
 
 

link to page 88  
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
 
Care bundle: a care bundle is a structured way of improving the processes of care and patient outcomes: 
a small, straightforward set of evidence-based practices — generally three to five — that, when performed 
collectively and reliably, have been proven to improve patient outcomes [9]. Should be implemented as part 
of a formally endorsed hospital programme. 
 
Training: regular training, courses or other forms of education. Should be organised at least once per year. 
 
Checklist: checklist is filled in by the healthcare workers (HCWs), as opposed to an audit (see directly 
below). 
 
Audit: evaluation of the implementation of prevention practices (process evaluation, observations, etc.) by 
another person than the one/those who are supposed to implement the practices. An audit is a process 
during which a practice is measured against a standard such as VAP/CLABSI prevention or antimicrobial 
stewardship guidelines (e.g. intubation/catheterisation, tube care/catheter care). Includes giving verbal 
feedback, e.g. between two clinicians. Formal feedback of printed/written results should be reported 
separately under ‘feedback’. 
 
Surveillance: surveillance of HAI type on a periodical or continuous basis, also including local surveillance 
(not only as part of a surveillance network) 
 
Feedback of surveillance and/or audit results to frontline HCWs. Only report ‘yes’ in the case of (yearly or 
more frequently) written feedback, e.g. as part of an institutional infection prevention and control report. 
Verbal feedback as part of an audit is not sufficient.  
H3 form: optional 
The variables on the third hospital form (H3) are normally collected at the ward level. However, countries which do 
not collect indicators at the ward level may collect these data at the hospital level. Also, if some wards failed to 
provide a complete set of ward-level indicators, hospital-level data make it possible to obtain a complete picture. 
Provide data from the current year, or from the most recent available year.  
Number of beds with AHR dispensers at point of care. Number of beds in the hospital with alcohol hand rub 
(AHR) dispensers available at the point of care as recommended by the 2009 WHO Guidelines on Hand Hygiene in 
Health Care. AHR dispensers at the entrance of the patient room only are not considered as ‘available at the point 
of care’. The ‘point of care’ is the place where three elements come together: the patient, the HCW, and care or 
treatment involving contact with the patient or his/her surroundings (within the patient zone). The concept 
embraces the need to perform hand hygiene at recommended moments exactly where care delivery takes place. 
This requires that a hand hygiene product (e.g. alcohol-based hand rub, if available) be easily accessible and as 
close as possible – within arm’s reach of where patient care or treatment is taking place. Point-of-care products 
should be accessible without having to leave the patient zone. Dispensers available at the point of care that are 
empty on the PPS day should be included. Provide the number for the included wards only (if available, otherwise 
provide number for the entire hospital; specify ‘included wards only OR total for hospital’ in last column).  
Number of beds assessed for the presence of AHR dispensers. The denominator of the previous variable, 
i.e. the total number of beds for which the presence of alcohol hand rub dispensers at the point of care was 
checked. If all wards were assessed, then this number would in principle be the same as the total number of 
hospital beds. 
Total number of patient rooms. Total number of rooms in included wards or total for hospital. Provide the 
number for the included wards only. If not available, provide number for the entire hospital; specify ‘included wards 
only or  total for hospital’ in last column. 
Number of single patient rooms. Total number of single-bed rooms in included wards or  total for hospital. 
Please ensure that the number of single patient rooms was collected for the same year and wards (included wards 
only OR total for hospital) as the total number of patient rooms. Rooms with more than one bed that are 
designated for use as single occupancy and isolation rooms (e.g. for infection control purposes) should be included. 
Number of single patient rooms with individual toilet and shower. Total number of single-bed rooms with 
individual toilet and shower in included wards or total for hospital. Please ensure that the number was collected in 
the same year and the same wards (included wards only or total for hospital) as the total number of patient rooms. 
Rooms with more than one bed that are designated for use as single occupancy and isolation rooms (e.g. for 
infection control purposes) should be included. Rooms which have toilet and shower in a communal area should 
not be counted. An individual toilet alone or a commode (toilet chair) is not sufficient to qualify for this indicator.  
Number of beds occupied at 00:01 on the day of the PPS. Number of hospital beds occupied at midnight on 
the day of the PPS. Because the PPS for an entire hospital usually takes several days, this variable does not have to 
be recorded at the beginning of the PPS data collection period; it should, however, not be recorded on weekends. 
Number of beds assessed for occupancy at 00:01 on the day of PPS. Number of hospital beds that were 
checked for occupancy at midnight on the day of the PPS. Denominator of the previous variable. If occupancy was 
16 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
checked for all beds, this variable normally equals the total number of beds in the hospital. Specify ‘included wards 
only or total for hospital’ in the last column. 
Percentage of healthcare workers in hospital that carry alcohol hand rub dispensers. Do healthcare 
workers in your hospital carry AHR dispensers (e.g. in their pockets)? (If yes, please estimate percentage). 
No=0%, Q0; 1–25%: Q1; 26–50%: Q2; 51–75%: Q3; >75%: Q4 
Post-prescription review of antimicrobials in hospital. Is there a formal procedure in the hospital to review 
the appropriateness of an antimicrobial within 72 hours (three calendar days) from the initial order in the hospital 
(post-prescription review)? A formal post-prescription review procedure should be documented and adopted by the 
hospital management and should be performed by a person or team other than the treating physician. The 
procedure should at least address the prescription of broad-spectrum or reserve antimicrobials. Choose one 
answer. YESALL = Yes, in all wards; YESSEL = Yes, in selected wards only (usually, but not necessarily, including 
ICU); YESICU = Yes, in ICU only; N = No; UNK=Unknown. 
General variables and notes: 
Year data. Year for which different hospital data apply; to be specified for each variable. 
Included wards only/total for hospital. Hospital data were collected for wards included in the PPS only (code: 
Incl, this is the recommended case) or for the entire hospital (code: Tot); if all wards are included in the PPS 
(Incl=Tot), mark ‘Incl’; to be specified for each variable. 
Comments. Free text, comments, maximum 255 characters. 
Note: Full-time equivalent (FTE) is the proportion of a ful  time position/job. One FTE = one ful  time position, but this could 
also be the sum of 2 half-time (50%) positions of two different persons; 0.10 FTE is 10% of a ful  time position. FTEs are 
reported ‘on the day of the PPS’ or as a ‘daily average’ for the previous year, depending on the variable. If only person-hours or 
person-days are available for a year (e.g. for registered nurses), they should be converted to FTEs ‘per day’, taking into account 
the local definition of a ful -time position in terms of number of hours per day, week or month (and, if applicable, the number of 
working days per month or per year).  
Hospital variables to be added by PPS coordinating centre 
before submission to ECDC’s TESSy   
RecordId. 
Unique identifier for each hospital-PPS within each network (combination of 
[NetworkId]+[HospitalId]+[DateStartSurvey]). 
RecordType. The record type tells TESSy which protocol and level the data relate to. For the PPS, the record type 
at hospital level (first level) is ‘HAIPPS’ for the standard protocol, and ‘HAIPPSLIGHT’ for the light protocol. 
RecordTypeVersion. There may be more than one version of a record type. 
Subject. ‘Disease’ to report. For PPS, ‘HAIPPS’ for all levels. 
DataSource. One country can have several data sources. Should correspond to the name of the data source 
defined in TESSy (e.g. CC-HAI, where ‘CC’ is a country code); one data source can be used to upload different HAI 
data (e.g. SSI, ICU and PPS) if the coordinating centre is the same for different surveillance protocols. 
ReportingCountry. Country reporting the record, codes see codebook. 
DateUsedForStatistics. Start date of the survey in the hospital; this date allows to distinguish repeated surveys 
for the same institution. Countries can upload more than one PPS in a single year. 
Status. Status of reporting NEW/UPDATE or DELETE (deactivate). Default if omitted: NEW/UPDATE. If set to 
DELETE, the record with the given RecordId will be deleted from the TESSy database (or, rather, invalidated). If set 
to NEW/UPDATE or left blank, a new record is entered into the database. 
NetworkId. Unique identifier for each surveillance/PPS network within the country, selected and generated by 
Member State, e.g. EN, NI, SC, WA for United Kingdom or different CClin networks in France; this field is combined 
with the hospital identifier to create a unique hospital code since different networks within one country may use 
the same hospital code. Can be omitted if the hospital identifiers are unique within the reporting country. 
Hospital location. Region (NUTS 1 code) where the hospital is located; NUTS 1 codes see codebook. 
Hospital is part of national representative sample. ‘Yes’ if the hospital is part of a national representative 
sample of hospitals (if the national sampling method provides a representative sample, only these hospitals will be 
included for the national figures at the EU level; see chapter on sampling). To be provided by the national/regional 
PPS coordinator.  
 
17 
 
 
 


 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Ward data 
Ward data can be collected in the standard and light protocol options. Ward-level indicators can optionally be 
collected at the hospital level, for the entire hospital (form H3), instead of – or in addition to – collecting these 
variables for each ward. Ward-level denominator data are optional for the standard option but mandatory for the 
light option. Denominator data are collected for all patients admitted before or present at 8 a.m. in the ward and 
not discharged from the ward at the time of the survey.  
Figure 6. Ward data (form W) 
 
Definition of ward data 
Survey date. 
Date on which the data were collected in the ward. Data from a single ward should be collected on 
one day; date dd/mm/yyyy. 
Hospital code. Hospital identifier/code assigned by national/regional PPS coordinating centre; unique code per 
surveillance/PPS network, should remain the same in different PPS periods/years.  
Ward name (abbreviated)/unit ID. Unique identifier for each hospital unit (abbreviated ward name); essential 
for linking between denominator and HAI/AU data; should be used consistently on all forms and should remain the 
same in different PPS periods/years.  
Ward specialty. Main ward specialty (≥ 80% of patients requiring this specialty). If fewer than 80%, report 
‘mixed ward’ (MIX). PED=Paediatrics, NEO=Neonatal, ICU=Intensive Care, MED=Medicine, SUR=Surgery, 
GO=Gynaecology/Obstetrics, GER=Geriatrics, PSY=Psychiatry, RHB=Rehabilitation, LTC=Long-term care, 
OTH=Other, MIX=Mixed.  
As a rule, the ward specialty code is composed of the three first letters of the main consultant/patient specialty, 
with two exceptions: code ICUNEO (NICU) as ward specialty NEO and ICUPED (PICU) as ward specialty PED. The 
ward specialty can be combined with patient specialty to refine specialties, e.g. in paediatrics: ward specialty PED 
+ patient specialty: ICUPED = paediatric ICU, PED + SURCARD = paediatric cardiac surgery, PED + MEDONCO = 
paediatric oncology.  
A ward with healthy newborns must either be allocated to GO (GOBAB) when it is located in obstetrics, or to PED 
(PEDBAB) if it is located in paediatrics. 
18 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Note: How to code paediatric patients: Use the ward code PED for paediatric wards. If the ward specialty code is PED, then 
patients should be coded as per consultant/patient specialty MEDGEN, MEDSUR, etc. The consultant/patient specialty PEDGEN 
should normally only be used for paediatric patients on adult wards. 
Total number of patients in ward. Total number of patients admitted to the ward before or at 8 a.m. that were 
not discharged from the ward at the time of the survey. This is mandatory for the light protocol option, but optional 
for the standard protocol option. 
Number of patients in ward by consultant/patient specialty. Light protocol option only. Number of 
patients admitted to the ward before or at 8 a.m. and not discharged from the ward at the time of the survey, 
recorded separately for each consultant/patient specialty. 
Consultant/patient specialty. Specialty of physician in charge of the patient, or main specialty for which the 
patient was admitted to the hospital. See specialty list (six-letter codes). In ward data, this variable needs to be 
completed in light protocol option only. Also see patient data. 
Post-prescription review of antimicrobials in ward. Is there a formal procedure to review the 
appropriateness of an antimicrobial within 72 hours from the initial order in this ward (post-prescription review)? 
A formal post-prescription review procedure should be documented and adopted by the hospital management and 
should be performed by a person or team other than the treating physician. The procedure should at least address 
the prescription of broad-spectrum or reserve antimicrobials. Yes/no 
Number of patient-days in ward. Number of patient-days in one year for current ward (data from previous year 
if available, specify year in second column).  
Alcohol hand rub consumption in wards (litres/year). Number of litres of alcohol hand rub delivered to the 
ward in one year. Provide data for the same year as the number of patient-days in the ward. 
Number of hand hygiene opportunities observed in ward/year. Number of hand hygiene opportunities 
observed in the current ward in one year. Provide data for previous year or the most recent data available (specify 
year in second column). Report the total number of observed opportunities for hand hygiene, not only the 
compliant observations.  
Number of beds in ward. Total number of beds in ward on the PPS day. Include ‘corridor beds’ and neonatal 
beds. 
Number of beds in ward with AHR dispensers at the point of care. Number of beds in the ward with 
alcohol hand rub (AHR) dispensers available at the point of care as recommended by the 2009 WHO Guidelines on 
Hand Hygiene in Health Care. AHR dispensers at the entrance of the patient room only are not considered as 
‘available at the point of care’. The ‘point of care’ is the place where three elements come together: the patient, the 
HCW, and care or treatment involving contact with the patient or his/her surroundings (within the patient zone). 
The concept embraces the need to perform hand hygiene at recommended moments exactly where care delivery 
takes place. This requires that a hand hygiene product (e.g. alcohol-based hand rub, if available) be easily 
accessible and as close as possible – within arm’s reach of where patient care or treatment is taking place. Point-
of-care products should be accessible without having to leave the patient zone. 
Number of HCWs on ward at time of PPS. Number of healthcare workers (HCWs) on ward at the time of PPS. 
The purpose of this variable is to measure the denominator of those carrying AHR dispensers. Therefore, HCWs 
should not be included if there is no information on the carriage of alcohol hand rub dispensers. 
Number of HCWs on ward carrying AHR dispensers. Number of HCWs on ward carrying AHR dispensers 
(e.g. in their pockets).  
Number of rooms in ward. Total number of rooms in the ward on the PPS day. 
Number of single rooms in ward. Total number of single-bed rooms in the ward on the PPS day. Rooms with 
more than one bed that are designated for use as single occupancy and isolation rooms (e.g. for infection control 
purposes) should be included. 
Number of single rooms with individual toilet and shower. Total number of single-bed rooms with individual 
toilet and shower in the ward. Rooms which have toilet and shower in a communal area should not be counted. An 
individual toilet alone or a commode (toilet chair) is not sufficient to qualify for this indicator. 
Number of beds occupied at 00:01 on the day of PPS. Number of ward beds occupied at midnight on the 
day of the PPS (can also be measured at midnight after the PPS took place). 
Comments/observations. Free text field to report, for example, feasibility issues, data quality problems, or 
specific epidemiological information for the current ward.  
 
 
19 
 
 
 


 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Patient data (standard protocol option) 
In the standard (patient-based) protocol option, demographic data and risk factors are collected for each patient 
present at/admitted to the ward before or at 8 a.m. and not discharged from the ward at the time of the survey 
(including patients not receiving an antimicrobial and not presenting a healthcare-associated infection).  
Figure 7. Patient-based risk factors (form A): one form per patient, antimicrobial use and HAI data 
collected on same form 

 
 
Definition of patient data 
Hospital code. 
Hospital identifier/code assigned by national/regional PPS coordinating centre; unique code per 
surveillance/PPS network. 
Ward name. Abbreviated name of hospital ward: essential for linking between denominator and HAI/AU data; 
should be used consistently on all forms and should remain the same in different PPS periods/years. 
Ward specialty. Main ward specialty (≥ 80% of patients requiring this specialty). If fewer than 80%, choose 
mixed ward (MIX). See more details under ward data and specialty code list. This variable can be omitted from the 
patient data if ward data are provided. If ward data are not provided, it should be added on the patient form. 
Survey date. Date on which data were collected in this ward. Data from a single ward should be collected on one 
day (dd/mm/yyyy). This variable can be omitted from the patient data if ward data are provided. If ward data are 
not provided, it should be added on the patient form. 
Patient counter. Number: anonymised patient number makes it possible to establish a link between patient data 
and HAI or antimicrobial use data. Not the actual patient identifier. 
Age in years. Patient age in years. 
Age in months. Patient age in months if the patient is less than two years old.  
Sex. Gender of the patient: M (male), F (female), or UNK (unknown). 
Date of hospital admission. Date on which the patient was admitted to the hospital for the current 
hospitalisation (dd/mm/yyyy). 
20 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Consultant/patient specialty. Specialty of physician in charge of the patient or main specialty for which the 
patient was admitted to the hospital. If the consultant specialty differs from the patient specialty, give priority to 
the patient specialty. For paediatric patients on a PED ward, use the subspecialty (MEDGEN, MEDSUR, etc.) (see 
ward specialty). Please note that long-term care is a ward specialty and should only exceptionally be used as a 
patient/consultant specialty. 
Surgery since admission. Patient has undergone surgery during current hospitalisation. Surgery is defined as a 
procedure performed primarily for therapeutic reasons where an incision is made (not just a needle puncture), with 
breach of mucosa and/or skin – not necessarily in the operating theatre. Answer categories: No surgery; yes, 
minimally invasive/non-NHSN surgery (examples see annex); yes, NHSN surgery – optionally specify NHSN surgery 
code (ICD-9-CM code of the intervention is listed for the surveillance of surgical site infections in the NHSN system, 
examples see annexes); unknown. 
McCabe score. Classification of the severity of underlying medical conditions. Disregard the influence of acute 
infections, e.g. if the patient has an active HAI, estimate the score the patient had before the infection. Answer 
categories: Non-fatal disease (expected survival at least five years); ultimately fatal disease (expected survival 
between one and five years); rapidly fatal disease (expected death within one year); unknown. 
Although the prognosis of diseases varies in time and between hospitals due to changes in treatment options and 
their availability, using McCabe scores can still be helpful. Some examples of diseases and their different McCabe 
score categories are given below. These examples, in particular those of the second (ultimately fatal) category, are 
not meant to be exhaustive but rather to serve as a guidance tool for the current protocol.  
Examples of diseases for different McCabe score categories: 
Rapidly fatal: < one year 
 
End-stage haematological malignancies (unsuitable for transplant, or relapsed), heart failure (EF < 25%) 
and end-stage liver disease (unsuitable for transplant with recalcitrant ascites, encephalopathy or varices) 
 
Multiple organ failure on intensive care unit – APACHE II score > 30, SAPS II score > 70  
 
Pulmonary disease with cor pulmonale 
Ultimately fatal: one year to four years  
 
Chronic leukaemias, myelomas, lymphomas, metastatic carcinoma, end-stage kidney disease (without 
transplant) 
 
Motor neuron disease, multiple sclerosis non-responsive to treatment 
 
Alzheimer’s disease/dementia 
 
Diabetes requiring amputation or post amputation 
Non fatal: > five years 
 
Diabetes 
 
Carcinoma/haematological malignancy with > 80% five-year survival 
 
Inflammatory disorders 
 
Chronic GI, GU conditions 
 
Obstetrics 
 
Infections (including HIV, HCV, HBV – unless in above categories) 
 
All other diseases 
Birth weight: birth weight in grams, to be provided for neonates (infants less than one month old); the birth 
weight is the weight of the infant at the time of birth and should not be changed as the infant gains or loses 
weight. 
Central vascular catheter. Patient has central vascular catheter in place on survey date; yes/no/unknown. 
A central vascular catheter is defined by the CDC as an:  
 
intravascular catheter that terminates at or close to the heart or in one of the great vessels which is used 
for infusion, withdrawal of blood, or hemodynamic monitoring. The following are considered great vessels 
for the purpose of reporting central-line BSI and counting central-line days in the NHSN system: Aorta, 
pulmonary artery, superior vena cava, inferior vena cava, brachiocephalic veins, internal jugular veins, 
subclavian veins, external iliac veins, common iliac veins, femoral veins, and in neonates, the umbilical 
artery/vein. 
Notes: Neither the insertion site nor the type of device may be used to determine if a line qualifies as a central line. The device 
must terminate in one of these vessels or in or near the heart to qualify as a central line.  
An introducer is considered an intravascular catheter, and depending on the location of its tip and use, may be a central line.  
21 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Pacemaker wires and other non-lumened devices inserted into central blood vessels or the heart are not considered central lines, 
because fluids are not infused, pushed, nor withdrawn through such devices. 
Source: CDC. Bloodstream infection event. January 2016. Available from: http//www.cdc.gov/nhsn/pdfs/pscmanual/4psc_clabscurrent.pdf  
Peripheral vascular catheter. Patient has peripheral vascular (venous or arterial catheter) in place; 
yes/no/unknown. 
Urinary catheter. Patient has indwelling urinary catheter in place at the date of the survey; yes/no/unknown. 
Intubation. Patient is under intubation with or without mechanical ventilation (endotracheal tube or 
tracheostomy) on survey date; yes/no/unknown. 
Patient receives antimicrobial(s). Patient receives at least one systemic antimicrobial agent at the date of the 
survey (given or planned treatment, including intermittent treatments, e.g. alternate day; or medical prophylaxis); 
for surgical antimicrobial prophylaxis, check whether any surgical prophylaxis was given in the 24 hours prior to 8 
a.m. on the day of the survey; yes/no. If yes, collect antimicrobial use data. 
Patient has active HAI. Patient has an active healthcare-associated infection on survey date; yes/no. If yes, 
collect HAI data. 
Notes: 
Patient data have to be col ected for each patient admitted to the ward at 8 a.m. on the survey date, infected or not, only 
excluding day cases (see inclusion criteria). 
Maternity: both mother and neonate are counted if present at 8 a.m. on the day of the survey. 
Neonates: 
 
Count all infections after their birth. 
 
Register consultant/patient specialty for healthy neonates as either GOBAB or PEDBAB. 
 
Obstetrics: in the case of natural birth with no interventions/procedures/devices, a maternal infection is only considered 
as an HAI if the date of onset is on day 3 or later.  
 
 
22 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Antimicrobial use data and HAI data 
Only collect information if the patient receives at least one antimicrobial at the time of the survey (except in the 
24 hours prior to 8 a.m. on the day of the survey for surgical prophylaxis) or if the patient has an active infection 
associated to an acute care hospital stay (current or another hospital).  
The use of antimicrobials will often lead to the detection of a HAI. Some patients may have a HAI that is not 
treated by an antimicrobial (e.g. viral infections, urinary tract infections, etc.), which makes it necessary to consult 
other sources (see HAI case finding algorithm). In other cases, the physicians may treat an infection which does 
not match the case definition. Therefore the diagnosis list for antimicrobial use differs from the HAI case definition 
list (see codebook) and the indication list mentions treatment intention of an infection. It is not the objective of this 
survey to relate the use of an antibiotic to the information on HAIs (such as microorganisms). Both types of data 
are collected separately. 
Antimicrobial use data 
Surgical prophylaxis should be registered if given the day before the survey (i.e. in the 24 hours prior to 8 a.m. on 
the day of the survey). For all other antimicrobial use (e.g. treatment, medical prophylaxis), any given or planned 
(including intermittent treatments, e.g. alternate day) administration of antimicrobials should be registered at the 
time of the survey only. If the antimicrobial agent given for treatment or medical prophylaxis was changed on the 
day of the survey, only record the last antimicrobial agent at the time of the survey.  
Note: The aim is to determine what the physicians think they are treating. In order to do so, we wil  look at all patient records 
and may request additional information from nurses, pharmacists or doctors. The appropriateness of prescriptions wil  not be 
discussed. Also, no attempts wil  be made to change prescriptions. At no time the staff should feel supervised.  
Definitions of antimicrobial use data 
Antimicrobial generic or brand name. 
Allowed are, for example, amoxicillin, but also national brand names; 
include ATC codes (ATC2: J01 antibacterials, J02 antifungals; ATC4: A07AA, P01AB, D01BA; ATC5: J04AB02). 
Treatment for tuberculosis is excluded but antituberculosis drugs are included when used for treatment of 
mycobacteria other than tuberculosis (MOTT) or as reserve treatment for multidrug-resistant bacteria. Brand 
names or drug names should be converted into ATC5 codes. See codebook for included antimicrobial agents. 
Route. Route of administration of the antimicrobial agent; P=parenteral; O=oral; R=rectal; I=inhalation. 
Indication for antimicrobial use. Patient receives systemic antimicrobials for : 
 
Treatment intention: CI: community-acquired infection; LI: infection acquired in long-term care facility (e.g. 
nursing home) or chronic-care hospital; HI: acute-hospital-acquired infection. 
 
Surgical prophylaxis: SP1: single dose; SP2: one day; SP3: > 1 day: check if given in the 24 hours prior to 8 
a.m. on the day of the survey – if yes, check if given on the day before yesterday or on the day of the 
survey in order to determine duration. 
 
MP. Medical prophylaxis. 
 
O. Other indication (e.g. erythromycin use as a prokinetic agent). 
 
UI. Unknown indication/reason (verified during PPS). 
 
UNK. Unknown/missing, information on indication was not verified during PPS. 
If the antimicrobial use is intended for treatment of an infection, fill in site of infection (diagnosis). Otherwise code 
NA (not applicable). 
Diagnosis (site). Diagnosis group by anatomical site: see diagnosis (site) code list for antimicrobial use. Should 
only be recorded when the indication is ‘intention to treat an infection’; not recorded for prophylaxis or other 
indications (use code NA=not applicable). 
Reason in notes: yes/no. Yes if the reason for antimicrobial use was documented in the patient chart/notes. 
Date start antimicrobial. Day on which the first dose of the current antimicrobial was administered. If the 
patient received the antimicrobial on admission, record the date of admission. 
Antimicrobial changed? (+ reason). Was the antimicrobial (or the route of administration) changed for this 
infection episode, and if so, what was the reason? If the antimicrobial was changed more than once for the current 
infection episode, report the reason of the last change. Changes should be considered for the entire treatment 
regimen for one infection episode. 
 
N=no change, antimicrobial was not changed.  
23 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
 
E=escalation: antimicrobial was escalated (or another antimicrobial was added) on microbiological and/or 
clinical grounds, i.e. the isolated microorganism was not susceptible to the previous antimicrobial and/or 
lack of clinical effect of previous antimicrobial; includes switch from oral to parenteral for the same 
antimicrobial.  
 
D=De-escalation: antimicrobial was de-escalated on microbiological and/or clinical grounds, i.e. the isolated 
microorganism was susceptible to more narrow-spectrum or first-line antimicrobials than the previous 
antimicrobial and/or the clinical situation of the patient allows changing to a more narrow-spectrum or to a 
first-line antimicrobial. If other antimicrobials given for the same indication were stopped at the time of the 
survey, report de-escalation for the remaining antimicrobial(s).  
 
S=switch IV to oral; route of administration of same antimicrobial was changed from parenteral to oral. 
A switch can also occur between antimicrobials belonging to the same antimicrobial class, e.g. 
IV ampicillin/sulbactam to oral amoxicillin/clavulanate or IV ceftriaxone to oral cefuroxime axetil.  
 
A=adverse effects; antimicrobial was changed because of observed or expected side or adverse effects of 
the antimicrobial.  
 
OU=change for other or unknown reason: the antimicrobial for that indication was changed for another 
reason, or the antimicrobial was changed but the reason could not be determined by the surveyor. 
 
U=unknown: no information on whether the antimicrobial was changed or not. 
Date start first antimicrobial (if change): If the current antimicrobial replaces a previous one: date on which 
the first dose of the first antimicrobial given for the same infection episode was administered. Leave blank if there 
was no change (or if there is no information available). If the antimicrobial was changed more than once for the 
current indication, report the start date of the first (not the previous) antimicrobial. If the patient received the first 
antimicrobial on admission, record the date of admission. The main objectives of collecting this variable are 1) 
estimation of the total annual number of patients receiving antimicrobials in acute care hospitals (prevalence to 
incidence conversion) and 2) proxy validation of the prevalence of HAIs. Optional. 
Dosage per day. Number and strength (in milligrams, grams, IU or MU) of doses of the current antimicrobial 
given per day. Report as, for example, ‘4 x 1 g per day’ (three variables: number of doses, strength of one dose, 
unit of one dose). When one dose of an antimicrobial is given every other day, report the number of doses as 0.5 
(e.g. 0.5 x 1 g/day). The main objectives for collecting this variable are to provide information to 1) enable 
comparisons of antimicrobial consumption between Europe and the US, and 2) enable updating the defined daily 
doses (DDD) values as set by the WHO Collaboration Centre for Drug Statistics Methodology (Norwegian Institute 
of Public Health, www.whocc.no). Report dosage as written in the patient records. Recoding (e.g. to inform DDD 
updates) will be done in the analysis phase if needed (e.g. for combined products). 
Healthcare-associated infection data 
Key terms and notes 
An active healthcare-associated infection (associated to acute care hospital stay) present on the day of the 
survey is defined as follows: 
 
An infection is active when signs and symptoms of the infection are present on the survey date or signs and 
symptoms were present in the past and the patient is (still) receiving treatment for that infection on the 
survey date. The presence of symptoms and signs should be verified until the start of the treatment in order 
to determine whether the treated infection matches one of the case definitions of healthcare-associated 
infection. 
AND 
 
The onset of symptoms was on Day 3 or later (day of admission = Day 1) of the current admission or the 
patient presents with an infection but has been readmitted less than 48 hours after a previous admission to 
an acute care hospital; or  
 
The patient has been admitted (or develops symptoms within two days) with an infection that meets the 
case definition of an active surgical site infection (SSI), i.e. the SSI occurred within 30 days of the operation 
(or in the case of surgery involving an implant, was a deep or organ/space SSI that developed within 90 
days of the operation) and the patient either has symptoms that meet the case definition and/or is on 
antimicrobial treatment for that infection; or 
 
The patient has been admitted (or develops symptoms within two days) with C. difficile infection less than 
28 days after a previous discharge from an acute care hospital; or 
 
An invasive device was placed on Day 1 or Day 2, resulting in an HAI before Day 3. 
Note: Results of tests/examinations that are not yet available on the survey date should neither be completed after the survey 
date nor taken into account when establishing whether the case definition criteria are fulfil ed. This wil  probably cause some 
actual cases of HAI to be discarded, but this can be seen as compensation for the (potential y long) retrospective period 
preceding the start of the treatment when no more signs or symptoms are present on the survey date. 
24 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Device-associated HAI is an HAI in a patient with a (relevant) device that was used within the 48-hour period 
before onset of infection (even intermittently). The term ‘device-associated’ is only used for pneumonia, 
bloodstream infection and urinary tract infection. The ‘relevant devices’ are intubation, vascular (central/peripheral) 
catheter and urinary catheter, respectively. If the interval is longer than 48 hours, there must be compelling 
evidence that the infection was associated with device use. For catheter-associated UTI, the indwelling urinary 
catheter must have been in place within seven days before positive laboratory results or signs and symptoms 
meeting criteria for UTI were evident. See: Horan et al. Definitions of key terms used in the NNIS system. Am J 
Infect Control 1997; 25:112-6. 
bloodstream infection (BSI and secondary BSI) is always registered as a separate HAI with specification of 
the source in a separate field (peripheral or central catheter, other infection site – S-PUL, S-UTI, S-DIG, S-SSI, S-
SST, S-OTH; the only exceptions are a CRI3 (catheter-related bloodstream infection with microbiological 
documentation of the relationship between the vascular catheter and the BSI) and neonatal bloodstream 
infections: CRI3 and neonatal BSIs should not be reported twice in the point prevalence survey (see case 
definitions). Microbiologically confirmed catheter-related BSI should be reported as a CRI3. Neonatal bloodstream 
infections should be reported as NEO-LCBI or NEO-CNSB, together with BSI origin. 
Definitions of healthcare-associated infection data 
Case definition code. 
HAI case definition codes: specify subcategory, e.g. PN4, CVS-VASC (see code lists, 
overview and HAI case definitions in Annex 2). A single-case definition code should only be provided once per 
patient (no different infection episodes). For pneumonia and urinary tract infections, only fill in one subcategory 
(priority pneumonia: PN1> PN2> PN3> PN4> PN5; urinary tract infections: UTI-A> UTI-B). For laboratory-
confirmed bloodstream infections, provide only one of BSI, CRI3 (priority CRI3> BSI), NEO-LCBI or NEO-CNSB 
(priority NEO-LCBI> NEO-CNSB [> BSI]). All signs and symptoms since the onset of the infection until the time of 
the survey should be considered to categorise the HAI. 
Relevant device in situ: yes/no/unknown. To be specified for PN, BSI, NEO-LCBI, NEO-CNSB and UTI only. 
Answer ‘Yes’ if a relevant invasive device was in situ (even intermittently) for any amount of time within a 48-hour 
time period (seven days for UTIs) before onset of the infection, i.e. intubation for pneumonia, central/peripheral 
vascular catheter for bloodstream infections, urinary catheter for UTI; Unk=unknown; used to apply CDC definition 
of device-associated infection (see Horan TC, et al. Definitions of key terms used in the NNIS system. Am J Infect 
Control 1997; 25:112-6). 
Infection present at admission: yes/no. Signs and symptoms of the infection were present at admission to 
the hospital; if not, provide date onset of infection.  
Date of onset. Date of onset of the infection (dd/mm/yyyy). Not to be recorded if signs/symptoms are present at 
admission, but mandatory if onset during current hospitalisation. Record the date of first signs or symptoms of the 
infection; if unknown, record the date treatment was started for this infection or the date the first diagnostic 
sample was taken. If no treatment or sample, please estimate.  
Origin of the infection. Infection is associated with (1) current hospital; (2) another acute care hospital; 
(3) other origin or unknown. Infections present at admission may be associated with a previous stay in your 
hospital or a transfer from another acute care facility. The category ‘other origin or unknown’ can be used, for 
example, for infections with an onset after day 2 of the current hospitalisation (= HAI by definition) which the 
surveyor does not consider to be associated with the current hospital stay. However, the category should not be 
used for long-term care-facility/nursing-home-associated infections, since only HAI associated with acute care 
hospital stays are recorded in the ECDC PPS. 
HAI associated to current ward. An HAI is associated with the current ward if the infection started on day 3 or 
later after admission to the current ward (where the date of admission to the ward is day 1) or  if the infection 
started on day 1 or 2 after placement of an invasive device in the current ward or  if the patient was readmitted 
with an HAI present on admission associated to a previous stay in the same ward, within 30 days after operation 
for surgical site infections (or 90 days for deep and organ/space SSI after implant surgery), less than 28 days after 
discharge for C. difficile infections, less than 48 hours (two calendar days) after discharge for other HAIs.   
If BSI: source. If lab-confirmed bloodstream infection, specify the origin: catheter-related (central: C-CVC
peripheral C-PVC), secondary to another infection: pulmonary (S-PUL), urinary tract (S-UTI), digestive tract (S-
DIG), surgical site infection (S-SSI), skin and soft tissue infection (S-SST), other infection (S-OTH), or BSI of 
(confirmed) unknown origin (UO); missing data, no information available=UNK; secondary BSI reported as 
separate HAI, in addition to the primary infection if it matches the case definition. 
Microorganisms. Collect microbiological results available on the survey date (do not wait for results not available 
on the survey date). Specify up to three isolated microorganisms using six-letter microorganism codes (e.g. 
STAAUR=Staphylococcus aureus); see codebook. 
25 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Antimicrobial resistance phenotype. Specify susceptibility to selected antimicrobial resistance (AMR) marker 
depending on microorganism.  
Report S (susceptible), I (intermediate), R (resistant) or UNK (unknown) for the antimicrobial group (preferred) or 
for tested antimicrobials within the group. Reporting group susceptibility requires that at least one antimicrobial 
belonging to the group is tested.  
If several antibiotics within the group were tested (e.g. carbapenems (CAR)), report the least susceptible result for 
the group (e.g. meropenem R + imipenem I = CAR R).  
If AMR markers are collected in accordance with the PPS I protocol methodology (still allowed but not 
recommended
), report S (susceptible), IR (non-susceptible) or U (unknown), except for MRSA, report non-
susceptibility to oxacillin (or equivalent) as R (resistant). 
Staphylococcus aureus: OXA, GLY 
 
MRSA: Resistant to oxacillin (OXA) or other markers of meticillin-resistant S. aureus (MRSA), such as 
cefoxitin (FOX), cloxacillin (CLO), dicloxacillin (DIC), flucloxacillin (FLC), methicillin (MET)  
 
VRSA: Resistant to glycopeptides (GLY): vancomycin (VAN) or teicoplanin (TEC) 
 
VISA: Intermediate to glycopeptides (GLY): vancomycin (VAN) or teicoplanin (TEC) 
Enterococcus spp.: GLY 
 
VRE: Resistant to glycopeptides (GLY): vancomycin (VAN) or teicoplanin (TEC) 
Enterobacteriaceae (Selection: Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp., Citrobacter spp., 
Serratia spp., Morganella spp.): C3G, CAR 
 
Third-generation cephalosporins (C3G): cefotaxime (CTX), ceftriaxone (CRO), ceftazidime (CAZ) 
 
Carbapenems (CAR): imipenem (IPM), meropenem (MEM), doripenem (DOR) 
Pseudomonas aeruginosa: CAR 
 
Carbapenems (CAR): imipenem (IPM), meropenem (MEM), doripenem (DOR) 
Acinetobacter spp.: CAR 
 
Carbapenems (CAR): imipenem (IPM), meropenem (MEM), doripenem (DOR) 
Pandrug-resistant (PDR). Microorganism is pandrug-resistant. Not PDR =N (susceptible to at least one 
antimicrobial), possible PDR = P (I/R to all antimicrobials tested in hospital), confirmed PDR = C (I/R to all 
antimicrobials confirmed by reference laboratory), UNK=Unknown.  
Source: Magiorakos AP, Srinivasan A, Carey RB, Carmeli Y, Falagas ME, Giske CG, et al. Multidrug-resistant, extensively drug-
resistant and pandrug-resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. 
Clin Microbiol Infect. 2012 Mar;18(3):268-81.  
26 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Recommended case-finding algorithm for healthcare-associated 
infections 
Figure 8. Recommended case finding algorithm for healthcare-associated infections 

Introduce yourself to ward manager.
Col ect ward specialty type, number
Surveil ance team arrives on ward.
of beds.
Record start date and time
Request patient list.
Exclude patients from further data 
col ection if admitted after 8 a.m.
Col ect denominator data on al  
Walk around ward.
patients in hospital before 8 a.m.
For each patient, observe for 
invasive devices (UC, PVC, CVC, 
ventilation)
Collect ONE set of patient notes (medical, nursing, 
observation, drug, wound, pressure, stool charts, etc.)
HAI according to standard 
On antimicrobials?
definitions?
NO, 
If notes are 
If notes are unclear, 
mark on form*
unclear, ask for 
ask for clarification of 
treatment 
signs and 
indication from 
symptoms only
medical, pharmacy, 
YES, fill in surveillance form*
from nursing/medical 
or nursing teams.
team
Complete data col ection for al  patients. 
Once complete, thank ward manager and leave.
Record end time on forms
Pass on data forms to 
local coordinator or data 
entry facilitator.
 
UC=urinary catheter; PVC=peripheral vascular catheter; CVC=central vascular catheter 
 
 
27 
 
 
 


 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Numerator data in the light protocol 
Since in the light (unit-based) protocol option denominator data are collected at the aggregated (ward) level, some 
additional patient and ward variables should be collected for patients receiving antimicrobials and/or patients with 
an active healthcare-associated infection.  
Hospital code. Hospital identifier/code assigned by national/regional PPS coordinating centre; unique code per 
surveillance/PPS network, should remain the same in different PPS periods/years.  
Ward name (abbreviated)/unit ID. Unique identifier for each hospital unit (abbreviated ward name); essential 
for linking between denominator and HAI/AU data; should be used consistently in all forms and should remain the 
same in different PPS periods/years.  
Patient counter. Number: anonymised patient number allows establishing the link between patient data and HAI 
or antimicrobial use data. Not the actual patient identifier. 
Age in years. Patient age in years; number; if missing=UNK. 
Age in months. Patient age in months if the patient is less than two years old. 
Sex. Gender of the patient: M (male), F (female), or UNK. 
Date of hospital admission. Date patient was admitted to the hospital for the current hospitalisation 
(dd/mm/yyyy). 
Consultant/patient specialty. Specialty of physician in charge of the patient or main specialty for which the 
patient was admitted to the hospital. If the consultant specialty differs from the patient specialty, give priority to 
the patient specialty. For paediatric patients on a PED ward, use the subspecialty (MEDGEN, MEDSUR etc) (see 
ward specialty). LTC should only exceptionally be used as a patient/consultant specialty. 
Patient receives antimicrobial: yes/no/unknown. Patient receives non-topical antibacterials or antifungals. 
Prophylaxis: any patient who received one or more doses in the 24 hours prior to 8 a.m. on the day of the survey.  
Patient has active HAI: yes/no/unknown. See definition of active infection above.  
Figure 9. Antimicrobial use and HAI data form in the LIGHT option (form B2) 
 
  
 
 
28 
 
 
 


 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
National/regional data 
(Applies only to PPS coordinating centres.) 
Objectives 
 
To assess the total number of acute care hospitals in a country and in the EU and to estimate the total 
number of hospital admissions per year, in order to estimate the total burden of HAIs and antimicrobial use 
in acute care hospitals. 
 
To collect information on the sampling methodology used at the national level. 
Notes 
 
Data at the national level are preferred, but if needed or more appropriate, please provide data from 
regional (sub-national) levels (e.g. England, Northern Ireland, Scotland and Wales for UK). 
 
National/regional data are provided by the point prevalence survey coordinating centre before submitting 
the national/regional hospital data to ECDC. They can be entered manually or be uploaded (one record) to 
TESSy (ECDC’s surveillance system).  
Figure 10. National/regional data (form N) 
 
Definition of national/regional data 
Country code. 
The country reporting the record. 
 
Network ID. Code of the region or network for which data are provided (e.g. EN, NI, SC, WA for England, 
Northern Ireland, Scotland and Wales); leave blank if data are provided for the entire country (national level). 
Date start PPS. First date on which data were collected (by first hospital) or official launch date of the current 
national/regional point prevalence survey, whichever comes first. 
National/regional PPS coordination centre/institution. Name of PPS coordinating centre or institution (e.g. 
national public health institute) in English (if available) or the local language.  
29 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
National/regional PPS coordination programme/unit, name. Name of PPS coordinating programme or unit 
(e.g. name of national HAI surveillance programme) in English (if available) or local language; leave blank if not 
relevant. 
National/regional PPS coordination programme/unit, website. Web address (URL) of programme or unit 
that coordinated the PPS (if available), regardless of specific PPS pages. 
Total number of acute care hospitals (‘sites’). Total number of acute care hospitals (separate sites or 
geographical entities) in your country/region, in accordance with national/regional definition of acute care 
hospitals. 
Number of administrative hospital groups/mergers. Total number of administrative hospital groups 
(including at least one acute care hospital site) in your country or region; leave blank if not applicable in your 
country/region; unknown= UNK. 
Total number of beds in acute care hospitals. Total number of beds (including non-acute beds) in acute care 
hospitals; unknown=UNK. 
Total number of acute care beds. Total number of acute care beds (excluding non-acute beds) in acute care 
hospitals; unknown=UNK. 
Number of discharges/admissions, all. Total number of hospital discharges from acute care hospitals in your 
country/region in the previous year (or the nearest year for which data are available); if discharges are not 
available, report number of admissions to acute care hospitals; unknown=UNK. 
Number of discharges/admissions, acute care beds only. If available: number of yearly hospital discharges 
from acute care hospitals for acute care beds only (previous year or the nearest year for which data are available); 
if discharges are not available, report admissions; unknown=UNK. 
Number of patient-days, all. Total number of patient-days in acute care hospitals in the previous year (or the 
nearest year for which data are available); unknown=UNK. 
Number of patient-days, acute care beds only. If available: number of yearly patient-days in acute care 
hospitals for acute care beds only (previous year or the nearest year for which data are available); unknown=UNK. 
Year data. For each of the hospital statistics, report the year for which data apply; leave blank if data is unknown; 
UNK=data available but year data unknown. 
Method of sampling/recruitment of hospitals. Method used for sampling (or recruitment) of hospitals for the 
national PPS; more than one answer is possible: 
 
 
REPSRS=representative sample (recommended method): the necessary number of hospitals was selected 
using systematic random sampling as described in the protocol under ‘sample design’. 
 
REPOTH=other representative sampling method; please describe the method used under 
‘comments/observations’. 
 
CONSAM=convenience sample: selection of hospitals by coordinating centre (e.g. based on expectations of 
high data quality). 
 
ALLHOSP=all hospitals invited: all acute care hospitals were invited to participate in the national point 
prevalence survey; can be combined with sample. 
 
VOLUNT=voluntary participation; hospitals can freely choose whether they respond to the invitation to 
participate. 
 
MANDAT=mandatory participation; participation following invitation is mandatory. 
Total number of hospitals in PPS. Total number of hospitals that participated in the national/regional PPS (if 
not all data are submitted to ECDC, provide total number of hospitals), both for the light (unit-based) and standard 
(patient-based) protocols. 
Comments/observations. Free text; provide any comment you consider relevant or that should be taken into 
account for the interpretation of the national/region data; for example, provide additional details on the sampling 
method used. 
 
 
30 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Data structure and variable names 
Tables with the PPS data structure for the files to be uploaded to TESSy are available in a separate Excel 
document. The structure is similar to that of other HAI-Net surveillance modules and has four hierarchical levels.  
Data can be uploaded in XML format (one single file) or in CSV format (separate files for each level). In CSV files, 
the RecordId in the superior level links to the ParentId in the underlying level. CSV file names should start with the 
number indicating the level of the data subset in the database hierarchy. The record type (variable RecordType) 
provides the level and data subset identity to TESSy. The record types for the PPS data are as follows: 
Standard protocol option record types 
 
HAIPPS (1st level): Hospital data, one record per hospital-survey 
 
HAIPPS$WD (2nd level): Ward data, one record per ward-survey (optional); link ParentId to RecordId in 
HAIPPS (1st level) 
 
HAIPPS$PT (2nd level): Patient data, one record per patient; link ParentId to RecordId in HAIPPS (1st 
level) 
 
HAIPPS$PT$AM (3rd level): Antimicrobial use data, one record per antimicrobial agent-route indication; 
link ParentId to RecordId in HAIPPS$PT (2nd level) 
 
HAIPPS$PT$INF (3rd level): Healthcare-associated infection data, one record per HAI site; link ParentId 
to RecordId in HAIPPS$PT (2nd level) 
 
HAIPPS$PT$INF$RES (4th level): Microorganism and antimicrobial resistance data for healthcare-
associated infections; link ParentId to RecordId in HAIPPS$PT$INF (3rd level) 
CSV files to be uploaded to TESSy: 1. HAIPPS.csv, 2. HAIPPSWD.csv (optional), 2. HAIPPSPT.csv, 
3. HAIPPSPTAM.csv, 3. HAIPPSPTINF.csv, 4.HAIPPSPTINFRES.csv 
Light protocol option record types 
 
HAIPPSLIGHT (1st level): Hospital data, one record per hospital-survey 
 
HAIPPSLIGHT$WD (2nd level): Ward data, one record per ward-survey (optional); link ParentId to 
RecordId in HAIPPSLIGHT (1st level) 
 
HAIPPSLIGHT$DENO (2nd level): Ward denominator data, one record per patient; link ParentId to 
RecordId in HAIPPSLIGHT (1st level) 
 
HAIPPSLIGHT$DENO$AM (3rd level): Antimicrobial use data, one record per antimicrobial agent-route 
indication; link ParentId to RecordId in HAIPPSLIGHT$DENO (2nd level) 
 
HAIPPSLIGHT$DENO$INF (3rd level): Healthcare-associated infection data, one record per HAI site; link 
ParentId to RecordId in HAIPPSLIGHT$DENO (2nd level) 
 
HAIPPSLIGHT$DENO$INF$RES (4th level): Microorganism and antimicrobial resistance data for 
healthcare-associated infections; link ParentId to RecordId in HAIPPSLIGHT$DENO$INF (3rd level) 
CSV files to be uploaded to TESSy: 1. HAIPPSLIGHT.csv, 2. HAIPPSLIGHTWD.csv (optional), 
2. HAIPPSLIGHTDENO.csv, 3. HAIPPSLIGHTDENOAM.csv, 3. HAIPPSLIGHTDENOINF.csv, 
4. HAIPPSLIGHTDENOINFRES.csv 
National data: record type HAIPPSDENOM, denominator data and PPS data for the country (or region if the data 
source is region-specific) 
A new ward level with structure and process indicators was added at the second level in both the standard and the 
light protocol options. Since ward indicator data are optional, this data level is optional; all other elements of the 
data structure are identical to the first PPS: patient data and ward denominator data are directly linked to the 
hospital level (not the ward level). It is crucial that the Ward ID code is identical (i.e. spelled exactly the same) at 
all data levels.  
Note on microorganism and resistance data  
The TESSy format of the microorganism and resistance data follows the bug-drug structure as in EARS-Net, HAI-
Net SSI and HAI-Net ICU. The reasons for this are 1) consistency with other data in TESSy and 2) to allow for 
changes in antimicrobial markers in future versions of the protocols.  
In the current PPS II protocol, data are directly collected in the bug-drug format. Collection of S/I/R data for each 
bug-drug combination will allow analysing the data exactly as in the EARS-Net report.  
31 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
If S/I/R data are not available, the PPS antimicrobial marker data can still be collected in accordance with the PPS I 
protocol (code system, only indicating non-susceptibility, without detail on intermediate susceptibility or 
resistance). In this case, they should be converted to the 4th level TESSy format as illustrated in the following 
table. 
Table 3. Conversion chart: PPS I protocol PPS antimicrobial marker data to the 4th level TESSy 
format 
 
MO 
Code 
 
ResultIsolate 
Antibiotic 
SIR 
Staphylococcus aureus (STAAUR) 
STAAUR 

  STAAUR 
OXA 

STAAUR 

  STAAUR 
OXA 

STAAUR 

  STAAUR 
OXA 
UNK 
Enterococcus spp., 
ENCFAI 

  ENCFAI 
GLY 

e.g. Enterococcus faecium (ENCFAI) 
ENCFAI 

  ENCFAI 
GLY 
IR 
ENCFAI 

  ENCFAI 
GLY 
UNK 
Enterobacteriaceae*,  
KLEPNE 

  KLEPNE 
C3G 

e.g. Klebsiel a pneumoniae (KLEPNE) 
 
KLEPNE 
CAR 

KLEPNE 

  KLEPNE 
C3G 
IR 
 
KLEPNE 
CAR 

KLEPNE 

  KLEPNE 
C3G 
IR 
 
KLEPNE 
CAR 
IR 
KLEPNE 

  KLEPNE 
C3G 
UNK 
 
KLEPNE 
CAR 
UNK 
Pseudomonas aeruginosa (PSEAER) 
PSEAER 

  PSEAER 
CAR 

PSEAER 

  PSEAER 
CAR 
IR 
PSEAER 

  PSEAER 
CAR 
UNK 
Acinetobacter baumanni  (ACIBAU) 
ACIBAU 

  ACIBAU 
CAR 

ACIBAU 

  ACIBAU 
CAR 
IR 
ACIBAU 

  ACIBAU 
CAR 
UNK 
* Enterobacteriaceae: only record antimicrobial susceptibility data for fol owing selection: Escherichia coli, Klebsiel a spp., 
Enterobacter spp., Proteus spp., Citrobacter spp., Serratia spp., Morganel a spp.  
 
 
32 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Acknowledgements 
Participation to PPS protocol meetings 
The protocol for the first ECDC point prevalence survey (PPS) of healthcare-associated infections and antimicrobial 
use in European acute care hospitals (2011–2012) was established during the following meetings: 
 
PPS working group at the 2009 Annual HAI Surveillance Meeting, 8–10 June 2009, ECDC, Stockholm 
 
PPS expert meeting, 8–9 September 2009, ECDC, Stockholm 
 
PPS expert meeting, 24–25 February 2010, ECDC, Stockholm 
 
Two PPS working groups at the 2010 Annual HAI Surveillance Meeting, 7–9 June 2010, ECDC, Stockholm 
 
PPS protocol meeting after pilot PPS, 6 October 2010, ECDC, Stockholm 
 
PPS workshop at the conference ‘New strategies to monitor and control infections, antibiotic use and 
resistance in healthcare facilities in the EU Member States’ organised by the Belgian EU Presidency 
(BAPCOC) and ECDC, 8–10 November 2010 
 
HAI-Net coordination group meeting, Prague, 3–4 March 2011 
 
PPS train-the-trainer course for national PPS coordinators/trainers, London, 28–30 March 2011 
 
Teleconference meetings, on sample design, as well as during and after the pilot PPS with the pilot PPS 
support team 
Changes to the protocol for the second ECDC point prevalence survey of healthcare-associated infections and 
antimicrobial use in European acute care hospitals in 2016–2017 were discussed during following meetings:  
 
PPS 2011–2012 Evaluation Meeting, 17–18 September 2013, ECDC, Stockholm 
 
HAI-Net protocol meeting on structure and process indicators, 19–20 February 2014, ECDC, Stockholm 
 
HAI-Net Coordination Committee meeting, 9 May 2014, Hospital del Mar, Barcelona 
 
HAI-Net PPS sessions at the third Joint Meeting of the ARHAI Networks, 11–13 February 2015, Courtyard 
Stockholm Kungsholmen, Stockholm 
 
HAI-Net Coordination Committee meeting, 14–15 April 2015, ECDC, Stockholm 
 
Meeting and workshop on the second ECDC point prevalence survey of healthcare-associated infections and 
antimicrobial use in acute care hospitals, 2016–2017, 20–22 October 2015, ECDC, Stockholm 
In total, 111 experts participated in at least one meeting regarding the first ECDC PPS and 153 experts participated 
in at least one meeting regarding the protocol for the second ECDC PPS. Meeting participants (n=229) are listed by 
country and institution in the table below together with the number of meetings to which they participated, in total 
and for the first and second PPS separately (in brackets).  
Table 4. Participants to ECDC PPS meetings on the first and second PPS protocol, by country and 
institution, 2009–2015 
Country 
Name (Number of meetings total; PPS1/PPS2) 
Institution 
EU/EEA Member States 
Austria 
Alexander Blacky (6; 6/0), Elisabeth Presterl (3; 0/3), Michael Hiesmayr (1;  Medical University Vienna 
0/1) 
Reinhild Strauss (3; 1/2) 
Federal Ministry of Health, Vienna 
Rainer Hartl (1; 1/0) 
Elisabethinen Hospital Linz 
Belgium  Mat Goossens (3; 3/0), Katrien Latour (3; 0/3), Béatrice Jans (2; 1/1), Karl  Scientific Institute of Public Health, 
Mertens (2; 2/0), Sofie Vaerenberg (2; 2/0), Sylvanus Fonguh (1; 0/1), 
Brussels 
Natacha Viseur (1; 1/0) 
Bulgaria  Rossitza Vatcheva-Dobrevska (7; 7/0), Elina Dobreva (2; 0/2), Ivan Ivanov  National Center of Infectious and 
(1; 0/1), Nadezhda Vladimirova (1; 0/1) 
Parasitic Diseases, Sofia 
Hristina Hitkova (1; 1/0) 
Medical University Pleven 
Croatia 
Zrinka Bošnjak (7; 4/3), Ana Budimir (3; 0/3),  
University Hospital Centre Zagreb 
Domagoj Drenjancevic (1; 1/0), Smilja Kalenic (1; 1/0) 
Arjana Tambic Andrasevic (1; 1/0) 
University Hospital for Infectious 
Diseases, Zagreb 
Cyprus 
Avgi Hadjiloukas (4; 4/0) 
Ministry of Health, Nicosia 
Niki Paphitou (1; 0/1) 
Nicosia General Hospital/ Ministry of 
Health, Nicosia 
Emmelia Vounou (1; 1/0) 
Limassol Hospital 
33 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Country 
Name (Number of meetings total; PPS1/PPS2) 
Institution 
Czech 
Jana Prattingerová (4; 1/3) 
Regional Public Health Authority, 
Republic 
Liberec; National Institute of Public 
Health, National reference centre on 
HAI, Prague 
Miroslava Girod Schreinerova (4; 4/0) 
Ministry of Health, department of 
Epidemiology, Prague 
Vlastimil Jindrák (3; 1/2) 
National Institute of Public Health, 
National reference centre on HAI, 
Prague 
Jan Sturma (2; 2/0) 
National Institute of Public Health, 
Prague 
Hana Tkadlecová (1; 1/0) 
Regional Public Heatlh Authority in Zlín 
Václav Vaniš (1; 0/1) 
Na Homolce Hospital, Prague 
Denmark  Christian Stab Jensen (6; 4/2), Brian Kristensen (3; 0/3), Elsebeth 
Statens Serum Institute, Copenhagen 
Tvenstrup Jensen (3; 3/0) 
Estonia 
Pil e Märtin (7; 4/3) 
West-Tallinn Central Hospital 
Piret Mitt (3; 1/2), Viivika Adamson (1; 1/0) 
Tartu University Hospital 
Annika Lemetsar (2; 2/0) 
Health Board, Tallinn 
Finland 
Outi Lyytikäinen (11; 6/5), Dinah Ariful a (2; 0/2), Tommi Kärki (2; 2/0) 
National Institute for Health and 
Welfare, Helsinki 
France 
Bruno Coignard (8; 7/1), Sophie Vaux (2; 1/1) 
Institute for Public Health Surveil ance, 
Kathleen Chami (1; 0/1), Valérie Ponties (1; 0/1), Jean-Michel Thiolet (1; 
Paris 
1/0) 
Anne Savey (3; 0/3), Marine Giard (2; 0/2) 
Centre de Coordination de la Lutte 
contre les Infections Nosocomiales Sud-
Est, Lyon 
Pascal Astagneau (1; 1/0) 
C-Clin Nord, Université ParisVI, Paris 
Germany  Sonja Hansen (7; 4/3), Brar Piening (5; 3/2), Petra Gastmeier (4; 1/3), 
Institute of Hygiene and Environmental 
Michael Behnke (3; 1/2) 
Medicine, Charité-Universitätsmedizin, 
Berlin 
Martine Mielke (2; 1/1), Muna Abu Sin (1; 0/1), Jan Walter (1; 0/1) 
Robert Koch Institute, Berlin 
Greece 
Achil eas Gikas (4; 3/1), Evangelos Kritsotakis (3; 2/1) 
Medical School, University of Crete, 
Heraklion 
Xanthi Dedoukou (3; 1/2), Antonios Maragkos (2; 1/1), Paraskevi Tsounou  Hel enic Centre for Disease Control and 
(1; 0/1), Flora Kontopidou (1; 1/0) 
Prevention, Athens 
Hungary  Karolina Böröcz (5; 4/1), Andrea Kurcz (4; 1/3) 
National Centre for Epidemiology, 
Ágnes Hajdu (2; 1/1), Emese Szilágyi (2; 2/0), István Veress (1; 0/1) 
Budapest 
Iceland 
Ólafur Guðlaugsson (4; 1/3) 
Landspitali University Hospital, Reykjavik 
Ireland 
Karen Burns (3; 1/2), Fidelma Fitzpatrick (2; 2/0), Stephen Murphan (2; 
Health Protection Surveil ance Centre, 
1/1), Fiona Roche (2; 1/1), Robert Cunney (1; 1/0), Sheila Donlon (1; 0/1)  Dublin 
Italy 
Maria Luisa Moro (9; 5/4), Enrico Ricchizzi (3; 1/2), Angelo Pan (1; 1/0), 
Regional Health Agency Emilia-
Davide Resi (1; 1/0) 
Romagna, Bologna 
Antonel a Agodi (1; 0/1) 
University of Catania 
Michela Stil o (1; 0/1) 
University of Turin 
Latvia 
Elina Dimina (6; 3/3), Raina Nikiforova (2; 1/1) 
Centre for Disease Prevention and 
Control of Latvia, Riga 
Uga Dumpis (5; 5/0), Aija Vilde (1; 0/1) 
Stradins University Hospital, Riga 
Jelena Galajeva (1; 1/0) 
Infectiology Center of Latvia, Riga 
Marite Kula (1; 1/0) 
Liepaja Regional Hospital 
Lithuania  Rolanda Valintėlienė (9; 5/4), Greta Vizujė (3; 1/2), Jolanta Ašembergienė  Institute of Hygiene, Vilnius 
(2; 0/2), Ramute Budginaitė (1; 1/0), Ieva Kisielienė (1; 0/1), Ruta 
Markevicė (1; 1/0) 
Nerija Kupreviciene (1; 0/1) 
Ministry of Health, Vilnius 
Luxem-
Elisabeth Heisbourg (2; 1/1), Martine Debacker (1; 0/1), Eliane Gelhausen  Ministry of Health, Luxembourg 
bourg 
(1; 0/1) 
Robert Hemmer (1; 1/0) 
Centre Hospitalier Luxembourg 
Malta 
Peter Zarb1,2 (6; 5/1), Elizabeth Scicluna (5; 3/2), Rodianne Abela (1; 0/1),  Mater Dei Hospital, Msida 
Michael Borg (1; 0/1), Deborah Xuereb (1; 0/1) 
The 
Titia Hopmans (4; 1/3), Mayke Koek (4; 1/3), Birgit Van Benthem (3; 3/0),  National Institute for Public Health and 
Nether-
Sabine De Greeff (1; 0/1), Iralice Jansen (1; 1/0), Emma Smid (1; 0/1), 
the Environment, Bilthoven 
lands 
Tjallie Van der Kooi (1; 1/0) 
34 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Country 
Name (Number of meetings total; PPS1/PPS2) 
Institution 
Norway 
Nina Kristine Sorknes (5; 2/3), Janne Møl er-Stray (4; 4/0), Thale Catherine  Norwegian Institute of Public Health, 
Berg (2; 0/2) 
Oslo 
Torunn Alberg (1; 0/1), Horst Bentele (1; 1/0) 
Jørgen Bjørnholt (1; 0/1), Hanne-Merete Eriksen (1; 0/1), Hege Line Løwer 
(1; 1/0) 
Poland 
Aleksander Deptula (6; 2/4) 
Nicolaus Copernicus University, Torun 
Tomasz Ozorowski (3; 3/0) 
Poznan Medical University 
Waleria Hryniewicz (2; 1/1) 
National Medicines Institute, Warsaw 
Ewa Trejnowska (2; 1/1) 
Regional Medical Centre, Opole 
Jadwiga Wójkowska-Mach (1; 0/1) 
Jagiel onian University Medical Col ege, 
Kraków 
Portugal  Ana Cristina Costa (4; 4/0), Elaine Pina (3; 1/2) 
Directorate General of Health, Lisbon 
Ana Paula Cruz (1; 0/1), Paulo Nogueira (1; 0/1), Maria Elena Noriega (1; 
1/0) 
Paulo André Fernandes (2; 0/2) 
National Authority of Medicines and 
Health Products, Lisbon 
José Artur Paiva (2; 1/1) 
Director PPCIRA; Centro Hospitalar de 
S.João, Porto 
Romania  Roxana Serban (6; 3/3), Ionel Iosif (2; 0/2), Aurora Violeta Stanescu (1; 
National Institute of Public Health, 
1/0) 
Bucharest  
Camelia Ghita (1; 1/0) 
Bucharest hospital 
Gabriel Adrian Popescu (1; 0/1) 
Carol Davila University of Medicine and 
Pharmacy, Bucharest; National Institute 
of Infectious Disease ‘Dr. Matei Bals’, 
Bucharest 
Slovak 
Slavka Litvova (4; 4/0), Mária Štefkovicová (3; 0/3), Eva Kopšíková (1; 0/1)  Regional Public Health Authority, Trencin 
Republic  Lukas Murajda (2; 2/0) 
Comenius University, Jessenius Faculty 
of Medicine, Martin 
Jana Námešná (2; 0/2) 
Regional Public Health Authority, Banska 
Bystrica 
Slovenia  Jana Kolman (11; 5/6), Irena Klavs (4; 2/2) 
National Institute of Public Health, 
Ljubljana 
Božena Kotnik Kevorkijan (2; 2/0), Rajko Saletinger (1; 0/1) 
University Medical Centre Maribor 
Tatjana Lejko Zupanc (1; 1/0) 
University Medical Centre Ljubljana 
Spain 
Josep Vaque Rafart (7; 4/3), Jose Angel Rodrigo Pendas (1; 1/0) 
Vall d'Hebron University Hospital, 
Barcelona 
Angel Asensio Vegas (3; 2/1), Mireia Cantero Caballero (1; 0/1) 
University Hospital Puerta de Hierro 
Majadahonda, Madrid 
Mercedes Palomar (3; 0/3) 
Spanish Society of Intensive and Critical 
Care Medicine; University Hospital Arnau 
de Vilanova, Lleida 
Sweden  Tomas Söderblom (4; 1/3), Inga Zetterqvist (2; 0/2), Jenny Hel man (1; 
Public Health Agency of Sweden, 
0/1), Johan Struwe (1; 1/0) 
Stockholm 
Mats Erntel  (3; 3/0), Gunil a Skoog (1; 1/0) 
Swedish Strategic Programme Against 
Antibiotic Resistance, Stockholm 
Dag Ström (1; 1/0) 
Swedish Association of Local Authorities 
and Regions, Stockholm 
UK-
Susan Hopkins (9; 5/4), Jennie Wilson (3; 3/0), Andre Charlett (1; 1/0), 
Public Health England, Colindale 
England  Elizabeth Sheridan (1; 1/0) 
UK-
Gerard McIlvenny (4; 2/2), Lourda Geoghegan (2; 0/2), Ed Smyth (1; 1/0)  Public Health Agency, Nothern Ireland, 
Northern 
Belfast 
Ireland 
UK-
Jacqui Reil y (11; 5/6), Shona Cairns (4; 4/0) 
Health Protection Scotland, Glasgow 
Scotland  Peter Davey1 (1; 1/0) 
University of Dundee 
UK-Wales  Wendy Harrison (2; 0/2), Dafydd Wil iams (2; 1/1) 
Public Health Wales, Cardiff 
David Nicholas Looker (1; 1/0) 
Glan Clwyd Hospital, Denbighshire 
EU enlargement countries 
Albania 
Zahide Sulejmani (1; 0/1), Eugena Tomini (1; 0/1) 
Institute of Public Health, Tirana 
Pel umb Pipero (1; 1/0) 
Ministry of Health, Tirana 
35 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Country 
Name (Number of meetings total; PPS1/PPS2) 
Institution 
Bosnia 
Maja Ostojic (1; 0/1) 
University Clinical Hospital Mostar 
and 
Aida Pitic (1; 0/1) 
Clinical center University of Sarajevo 
Herze-
govina 
Kosovo 
Agreta Gecaj-Gashi (1; 0/1) 
University clinical center of Kosovo, 
Intensive Care, Pristina 
Lul Raka (1; 0/1) 
National Institute of Public Health of 
Kosovo, Pristina 
The 
Gordana Kuzmanovska (1; 0/1), Kristina Stavridis (1; 0/1) 
Institute of Public Health, Skopje 
former 
Katja Popovska (1; 0/1) 
Institute of microbiology Medical faculty, 
Yugoslav 
Skopje 
Republic 
of 
Macedoni

Monte-
Anton Duravcaj (1; 0/1), Gordana Mijovic (1; 1/0) 
Institute for Public Health of 
negro 
Montenegro, Podgorica 
Miro Kneževic (1; 0/1) 
Clinical Centre of Montenegro, Podgorica 
Sanja Simovic (1; 0/1) 
National Commission for hospital 
infections 
Republic  Gorana Cosic (1; 0/1) 
Institute for Public Health, Novi Sad 
of Serbia  Mitra Drakulovic (1; 0/1) 
Institute of Public Health of Serbia "Dr 
Milan Jovanovic Batut", Belgrade 
Natasa Mazic (1; 0/1) 
Clinical Center of Serbia, Belgrade 
Turkey 
Dilek Arman (1; 1/0) 
Gazi University, Ankara 
Fadime Callak Oku (1; 0/1) 
General Directorate of Health Services, 
Department of Health Service Standards 
EU Neighbourhood Policy countries 
Algeria 
Amhis Wahiba (1; 0/1) 
Etablissement Public Hospitalier 
Bologhine, Alger 
Armenia  Romel a Abovyan (1; 0/1) 
National Centre for Disease Control and 
Prevention, Yerevan 
Egypt 
Khaled Hassanein (1; 0/1) 
Ministry of Health and Population, Cairo 
Georgia 
Giorgi Chakhunashvili (1; 0/1) 
National Centre for Disease Control and 
Public Health, Tbilisi 
Israel 
Mitchel  J. Schwaber (1; 0/1) 
National Centre for Infection Control and 
Antibiotic Resistance, Tel Aviv 
Lebanon  Rima Moghnieh (2; 0/2) 
Makassed General Hospital, Beirut 
Tunesia 
Ihlem Boutiba (1; 0/1) 
Faculté de Médecine de Tunis 
Ukraine 
Maxym Pylypenko (1; 0/1), Aidyn Salmanov (1; 0/1) 
P.L. Shupyk National Medical Academy 
of Postgraduate Education, Kiev 
Viktoriia Zadorozhna (1; 0/1) 
Gromashevsky Institute of Epidemiology 
and Infectious Diseases, Kiev 
Individual experts 
France 
Arno Mul er1 (9; 6/3) 
Individual expert, France; ECDC 
consultant for ESAC-Net 
France 
Catherine Dumartin (1; 0/1) 
Centre de Coordination de la Lutte 
contre les Infections Nosocomiales Sud-
Ouest, Bordeaux 
UK/PPS 
Barry Cookson (2; 2/0), Gareth Hughes (2; 2/0) 
Public Health England, Colindale 
Training  Berit Mül er-Peabody (2; 2/0), Naomi Boxal  (1; 1/0) 
United 
Walter Zingg (3; 0/3) 
Imperial Col ege London 
Kingdom 
United 
Mike Sharland2 (1; 0/1) 
St George's Healthcare NHS Trust, 
Kingdom 
London 
International and European organisations/projects 
European  Nicole Heine (1; 0/1) 
European Commission, Luxembourg 
Commissi
on 
ESAC 
Herman Goossens (5; 5/0), Nico Drapier (1; 1/0) 
European Surveil ance of Antimicrobial 
Consumption (ESAC) project; University 
of Antwerp, Antwerp 
36 
 
 
 

link to page 88 link to page 88  
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Country 
Name (Number of meetings total; PPS1/PPS2) 
Institution 
ESICM 
Alain Lepape (4; 1/3) 
European Society of Intensive Care 
Medicine (ESICM), Infection Section; 
CHU, Lyon 
EUCIC 
Evelina Tacconel i (1; 0/1) 
European Society of Clinical Microbiology 
and Infectious Diseases (ESCMID), 
European Committee on Infection 
Control (EUCIC) 
USA/CDC  Shelley Magill (5; 3/2), Scott Fridkin (2; 2/0) 
Centers for Disease Control and 
Prevention, Atlanta 
WHO 
Ana Paula Coutinho (5; 3/2), Bernardus Ganter (2; 2/0) 
World Health Organization, Regional 
Regional 
Office for Europe, Copenhagen 
Office for 
Europe 
ECDC 
Carl Suetens (14; 8/6), Jolanta Griškevičienė (8; 5/3), Pete Kinross (5; 0/5),  European Centre for Disease Prevention 
Dominique L. Monnet (5; 1/4), Klaus Weist (5; 3/2), Ole Heuer (4; 2/2), 
and Control, Stockholm 
Carlo Gagliotti (3; 3/0), Diamantis Plachouras (3; 0/3), Tommi Kärki (1; 
0/1), Barbara Albiger (1; 0/1), Tommi Asikainen (1; 1/0), Anna-Pelagia 
Magiorakos (1; 0/1), Sorin Ostafiev (1; 0/1), Vladimir Prikazsky (1; 1/0), 
Luisa Sodano (1; 1/0) 
1Also representing the ESAC project 
2Also representing the ESAC-Net Coordination Committee 
In addition, seven teleconferences for the selection of structure and process indicators were organised with the 
members of the HAI-Net PPS expert group: Outi Lyytikainen (Finland); Sonja Hansen (Germany); Maria-Louisa 
Moro (Italy); Peter Zarb (Malta, ESAC-Net Coordination Group); Jana Kolman (Slovenia); Susan Hopkins (UK-
England); Jacqui Reilly (UK-Scotland); Walter Zingg (SIGHT project); Arno Muller (ESAC-Net consultant); Pete 
Kinross (ECDC); Anna-Pelagia Magiorakos (ECDC), Diamantis Plachouras (ECDC), Carl Suetens (ECDC). 
National PPS coordination teams during the first ECDC PPS are listed in the ECDC PPS 2011–2012 report [6].  
Support projects 
The following projects were outsourced in support of the first point prevalence survey. 
1. Contract ECD.2172 following a call for tender entitled ‘Support to the pilot point prevalence survey of healthcare-
associated infections and antimicrobial use in European acute care hospitals’. 
The support to the pilot PPS was outsourced to a consortium under coordination of the University of Antwerp, 
Belgium, in collaboration with the National Institute for Public Health Surveillance (InVS) in Paris, France, and the 
Scientific Institute of Public Health in Brussels, Belgium. The helpdesk team during the pilot PPS discussed 
methodological issues during regular teleconferences and was composed of Herman Goossens (Team leader), Arno 
Muller, Peter Zarb, Bruno Coignard, Boudewijn Catry, Sofie Vaerenberg, Mat Goossens, Susan Hopkins, Klaus Weist, 
Jolanta Griškevičienė and Carl Suetens (ECDC PPS project manager). During the pilot PPS project, the ESAC web-
PPS software for hospitals was adapted to the ECDC protocol.  
Participants in the pilot PPS tested V3.3 of the PPS protocol and are listed in Zarb et al [11]. 
2. Contract ECD.1842 following a call for tender entitled ‘Curriculum for course on epidemiology and analysis of 
point prevalence studies of healthcare-associated infections’.  
The development of PPS courses and teaching materials was outsourced to the Health Protection Agency, London 
(Susan Hopkins (coordinator), Barry Cookson, Berit Müller-Pebody, Gareth Hughes, Naomi Boxall) with 
collaboration of Health Protection Scotland (Jacqui Reilly, Shona Cairns). Some material developed by the training 
curriculum team was integrated in the protocol. 
3. Contract ECD.2218 following a request for an offer on ’HELICSwin Hospital Software Support’ was made with the 
Belgian Scientific Institute of Public Health to develop a standalone software package for PPS data entry, export 
and analysis (HELICSwin.Net).  
4. Contract ECD.2971 following a call for tender entitled ‘Pilot validation study of the ECDC Point Prevalence Survey 
of healthcare-associated Infections and Antimicrobial Use in European Acute Care Hospitals. OG/23/06/2011-
PROC/2011/060’.  
The pilot PPS validation study was outsourced to a consortium under coordination of Glasgow Caledonian 
University, Glasgow, United Kingdom (Jacqui Reilly, Lesley Price, Jon Godwin), in collaboration with Health 
Protection Scotland, Glasgow, United Kingdom (Jacqui Reilly, Shona Cairns, William Malcolm), Public Health 
England, London, United Kingdom (Susan Hopkins, Barry Cookson, Gareth Hughes), National Institute for Health 
37 
 
 
 

link to page 88  
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
and Welfare, Helsinki, Finland (Outi Lyytikäinen), Institut de Veille Sanitaire, Saint-Maurice, France (Bruno 
Coignard) and Charité University Medicine Berlin, Germany (Petra Gastmeier, Sonja Hansen). 
Participants in the ECDC pilot validation study are listed in Reilly et al [12]. 
 
 
38 
 
 
 

link to page 88 link to page 89 link to page 89 link to page 89  
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Annex 1. Additional materials 
Codebook 
The codebook is attached to this publication as Annex 2 and contains the following: 
 
specialty list (ward, Patient/consultant); 
 
antimicrobial agent generic names and ATC-5 codes; 
 
diagnosis site list for treatment intention with antimicrobials (adapted from ESAC); 
 
HAI case definitions; 
 
algorithm for the diagnosis of catheter-related infections; 
 
microorganism codes; 
 
antimicrobial resistance markers codes; and 
 
surgery categories (NHSN/examples of non-NHSN). 
Forms 
A PowerPoint file with all forms is available as a separate download. It is intended for high quality printing and/or 
the translation of forms. 
TESSy variable definitions and validation rules 
An Excel file containing the definition of variables for data upload to ECDC’s TESSy system is available as a 
separate download from TESSy or on ECDC’s HAI-Net extranet. It can also be requested by email from 
xxxxx@xxxx.xxxxxx.xx. 
Note on case definitions of healthcare-associated infections 
As recommended by the joint expert group in January 2009 and confirmed during the PPS expert meetings in 2009 
and 2010, the ECDC PPS protocol uses existing European case definitions [13-17] and complements them by case 
definitions from the Centers for Disease Control and Prevention (CDC), as used by CDC’s National Healthcare Safety 
Network (NHSN, formerly NNIS)[18]. The concordance between US/CDC and EU/HELICS case definitions was 
assessed by Hansen et al [19]. 
The European case definitions used in the ECDC PPS are: 
 
HELICS/IPSE case definitions 
 
 
Surgical site infection 
 
Pneumonia 
 
Bloodstream infection 
 
Central vascular catheter related infection 
 
Urinary tract infections 
Clostridium difficile infection 
Specific neonatal definitions, as established by the KISS network: 
 
 
Clinically suspected bloodstream infections (clinical sepsis) 
 
Laboratory-confirmed bloodstream infection 
 
Laboratory-confirmed bloodstream infection with coagulase-negative staphylococci 
 
Pneumonia in neonates 
 
Necrotising enterocolitis 
Note: The CDC HAI case definitions in neonates were replaced by case definitions used in the Neo-KISS system. These definitions 
were not established at the EU level, but they were preferred by the EU-PPS expert group. 
All other case definitions are CDC/NHSN case definitions. 
 
 
 
39 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Annex 2. Codebook 
Specialty code list 
Specialty codes are used for following variables: Ward specialty, patient/consultant specialty, specialised hospital 
(form H). Ward specialty codes are shown in the first column (in parentheses). 
Categories (ward specialty) 
Patient/consultant 
specialty code 
Patient/consultant specialty name 
Surgical specialties (SUR) 
SURGEN 
General surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURDIG 
Digestive tract surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURORTR 
Orthopaedics and surgical traumatology 
Surgical specialties (SUR) 
SURORTO 
Orthopaedics 
Surgical specialties (SUR) 
SURTR 
Traumatology 
Surgical specialties (SUR) 
SURCV 
Cardio surgery and vascular surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURCARD 
Cardio surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURVASC 
Vascular surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURTHO 
Thoracic surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURNEU 
Neurosurgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURPED 
Paediatric general surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURTRANS 
Transplantation surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURONCO 
Surgery for cancer 
Surgical specialties (SUR) 
SURENT 
ENT 
Surgical specialties (SUR) 
SUROPH 
Ophthalmology 
Surgical specialties (SUR) 
SURMAXFAC 
Maxil o-facial surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SURSTODEN 
Stomatology/Dentistry 
Surgical specialties (SUR) 
SURBURN 
Burns care 
Surgical specialties (SUR) 
SURURO 
Urology 
Surgical specialties (SUR) 
SURPLAS 
Plastic and reconstructive surgery 
Surgical specialties (SUR) 
SUROTH 
Other surgery 
Medical specialties (MED) 
MEDGEN 
General medicine 
Medical specialties (MED) 
MEDGAST 
Gastroenterology 
Medical specialties (MED) 
MEDHEP 
Hepatology 
Medical specialties (MED) 
MEDENDO 
Endocrinology 
Medical specialties (MED) 
MEDONCO 
Oncology 
Medical specialties (MED) 
MEDHEMA 
Haematology 
Medical specialties (MED) 
MEDBMT 
Bone marrow transplantation (BMT) 
Medical specialties (MED) 
MEDHEMBMT 
Haematology/BMT 
Medical specialties (MED) 
MEDCARD 
Cardiology 
Medical specialties (MED) 
MEDDERM 
Dermatology 
Medical specialties (MED) 
MEDNEPH 
Nephrology 
Medical specialties (MED) 
MEDNEU 
Neurology 
Medical specialties (MED) 
MEDPNEU 
Pneumology 
Medical specialties (MED) 
MEDRHEU 
Rheumatology 
Medical specialties (MED) 
MEDID 
Infectious diseases 
Medical specialties (MED) 
MEDTR 
Medical traumatology 
Medical specialties (MED) 
MEDOTH 
Other medical 
Paediatrics (PED) 
PEDGEN 
Paediatrics general, not specialised 
Neonatology (NEO) 
PEDNEO 
Neonatology (excl. healthy neonates)  
Neonatology (NEO) 
PEDBAB 
Healthy neonates (paediatrics) 
Neonatology (NEO) 
ICUNEO 
Neonatal ICU 
Paediatrics (PED) 
ICUPED 
Paediatric ICU 
Intensive care medicine (ICU) 
ICUMED 
Medical ICU 
Intensive care medicine (ICU) 
ICUSUR 
Surgical ICU 
Intensive care medicine (ICU) 
ICUMIX 
Mixed (polyvalent) ICU, general intensive or critical care 
Intensive care medicine (ICU) 
ICUSPEC 
Specialised ICU 
Intensive care medicine (ICU) 
ICUOTH 
Other ICU 
40 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Categories (ward specialty) 
Patient/consultant 
specialty code 
Patient/consultant specialty name 
Gynaecology/Obstetrics (GO) 
GOOBS 
Obstetrics /maternity  
Gynaecology/Obstetrics (GO) 
GOGYN 
Gynaecology  
Gynaecology/Obstetrics (GO) 
GOBAB 
Healthy neonates (maternity) 
Geriatrics (GER) 
GER 
Geriatrics, care for the elderly 
Psychiatry (PSY) 
PSY 
Psychiatry 
Rehabilitation (RHB) 
RHB 
Rehabilitation 
Long-term care (LTC) 
LTC* 
Long-term care 
OTHER (OTH) 
OTH 
Others not listed 
Mixed (MIX) 
MIX* 
Combination of specialties 
* LTC and MIX are in principle ward specialties and should only exceptionally be used as a patient/consultant specialty (e.g. for 
LTC, use MEDGEN, GER, RHB instead; for MIX, use the specialty of the main disease of the patient only). 
 
 
41 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Diagnosis (site) code list for antimicrobial use  
Diagnosis 
Examples 
CNS 
Infections of the central nervous system 
EYE 
Endophthalmitis 
ENT 
Infections of ear, nose, throat, larynx and mouth 
BRON 
Acute bronchitis or exacerbations of chronic bronchitis 
PNEU 
Pneumonia 
CF 
Cystic fibrosis 
CVS 
Cardiovascular infections: endocarditis, vascular graft 
GI 
Gastrointestinal infections (e.g. salmonel osis, antibiotic-associated diarrhoea) 
IA 
Intra-abdominal sepsis, including hepatobiliary 
SST-SSI 
Surgical site infection involving skin or soft tissue but not bone 
SST-O 
Cel ulitis, wound, deep soft tissue not involving bone, not related to surgery 
BJ-SSI 
Septic arthritis, osteomyelitis of surgical site 
BJ-O 
Septic arthritis, osteomyelitis, not related to surgery 
CYS 
Symptomatic lower urinary tract infection (e.g. cystitis) 
PYE 
Symptomatic upper urinary tract infection (e.g. pyelonephritis) 
ASB 
Asymptomatic bacteriuria 
OBGY 
Obstetric or gynaecological infections, STD in women 
GUM 
Prostatitis, epididymo-orchitis, STD in men 
BAC 
Laboratory-confirmed bacteraemia 
CSEP 
Clinical sepsis (suspected bloodstream infection without lab confirmation/results are not available, no blood 
cultures col ected or negative blood culture), excluding febrile neutropenia 
FN 
Febrile neutropenia or other form of manifestation of infection in immunocompromised host (e.g. HIV, 
chemotherapy, etc.) with no clear anatomical site 
SIRS 
Systemic inflammatory response with no clear anatomical site 
UND 
Completely undefined; site with no systemic inflammation 
NA 
Not applicable; for antimicrobial use other than treatment 
Indications for antimicrobial use 
Treatment 
CI 
Treatment of community-acquired infection (CI) 
LI 
Treatment of long-term care-acquired infection (LI) 
HI 
Treatment of hospital-acquired infection (HI) 
Prophylaxis 
MP 
Medical prophylaxis 
SP1 
Surgical prophylaxis: single dose 
SP2 
Surgical prophylaxis: one day 
SP3 
Surgical prophylaxis: > 1 day 
Other 

Other reason (e.g. prokinetic erythromicin) 
UI 
Unknown indication (verified during PPS) 
 
 
 
42 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Antimicrobial ATC codes (2016) 
Antimicrobial agent: generic name 
ATC5 
Amikacin 
J01GB06 
Amoxicil in 
J01CA04 
Amoxicil in and enzyme inhibitor 
J01CR02 
Amphotericin B (oral) 
A07AA07 
Amphotericin B (parenteral) 
J02AA01 
Ampicil in 
J01CA01 
Ampicil in and enzyme inhibitor 
J01CR01 
Ampicil in, combinations 
J01CA51 
Anidulafungin 
J02AX06 
Arbekacin 
J01GB12 
Aspoxicil in 
J01CA19 
Azanidazole 
P01AB04 
Azidocil in 
J01CE04 
Azithromycin 
J01FA10 
Azithromycin, fluconazole and secnidazole 
J01RA07 
Azlocil in 
J01CA09 
Aztreonam 
J01DF01 
Bacampicil in 
J01CA06 
Bacitracin 
J01XX10 
Bekanamycin 
J01GB13 
Benzathine benzylpenicil in 
J01CE08 
Benzathine phenoxymethylpenicil in 
J01CE10 
Benzylpenicil in 
J01CE01 
Biapenem 
J01DH05 
Brodimoprim 
J01EA02 
Carbenicil in 
J01CA03 
Carindacil in 
J01CA05 
Carumonam 
J01DF02 
Caspofungin 
J02AX04 
Cefacetrile 
J01DB10 
Cefaclor 
J01DC04 
Cefadroxil 
J01DB05 
Cefalexin 
J01DB01 
Cefaloridine 
J01DB02 
Cefalotin 
J01DB03 
Cefamandole 
J01DC03 
Cefapirin 
J01DB08 
Cefatrizine 
J01DB07 
Cefazedone 
J01DB06 
Cefazolin 
J01DB04 
Cefbuperazone 
J01DC13 
Cefcapene 
J01DD17 
Cefdinir 
J01DD15 
Cefditoren 
J01DD16 
Cefepime 
J01DE01 
Cefepime and amikacin 
J01RA06 
Cefetamet 
J01DD10 
Cefixime 
J01DD08 
Cefmenoxime 
J01DD05 
Cefmetazole 
J01DC09 
43 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Antimicrobial agent: generic name 
ATC5 
Cefminox 
J01DC12 
Cefodizime 
J01DD09 
Cefonicide 
J01DC06 
Cefoperazone 
J01DD12 
Cefoperazone, combinations 
J01DD62 
Ceforanide 
J01DC11 
Cefotaxime 
J01DD01 
Cefotaxime, combinations 
J01DD51 
Cefotetan 
J01DC05 
Cefotiam 
J01DC07 
Cefoxitin 
J01DC01 
Cefozopran 
J01DE03 
Cefpiramide 
J01DD11 
Cefpirome 
J01DE02 
Cefpodoxime 
J01DD13 
Cefprozil 
J01DC10 
Cefradine 
J01DB09 
Cefroxadine 
J01DB11 
Cefsulodin 
J01DD03 
Ceftaroline fosamil  
J01DI02 
Ceftazidime 
J01DD02 
Ceftazidime, combinations 
J01DD52 
Ceftezole 
J01DB12 
Ceftibuten 
J01DD14 
Ceftizoxime 
J01DD07 
Ceftobiprole medocaril 
J01DI01 
Ceftolozane and enzyme inhibitor 
J01DI54 
Ceftriaxone 
J01DD04 
Ceftriaxone, combinations 
J01DD54 
Cefuroxime 
J01DC02 
Cefuroxime and metronidazole 
J01RA03 
Chloramphenicol 
J01BA01 
Chlortetracycline 
J01AA03 
Cinoxacin 
J01MB06 
Ciprofloxacin 
J01MA02 
Ciprofloxacin and metronidazole 
J01RA10 
Ciprofloxacin and ornidazole 
J01RA12 
Ciprofloxacin and tinidazole 
J01RA11 
Clarithromycin 
J01FA09 
Clindamycin 
J01FF01 
Clofoctol 
J01XX03 
Clometocil in 
J01CE07 
Clomocycline 
J01AA11 
Cloxacil in 
J01CF02 
Colistin (injection, infusion) 
J01XB01 
Colistin (oral) 
A07AA10 
Combinations of beta-lactamase sensitive penicil ins  
J01CE30 
Combinations of intermediate-acting sulphonamides 
J01EC20 
Combinations of long-acting sulphonamides 
J01ED20 
Combinations of penicil ins 
J01CR50 
Combinations of penicil ins with extended spectrum 
J01CA20 
Combinations of short-acting sulphonamides 
J01EB20 
44 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Antimicrobial agent: generic name 
ATC5 
Combinations of tetracyclines 
J01AA20 
Cycloserine 
J04AB01 
Dalbavancin 
J01XA04 
Daptomycin 
J01XX09 
Demeclocycline 
J01AA01 
Dibekacin 
J01GB09 
Dicloxacil in 
J01CF01 
Dirithromycin 
J01FA13 
Doripenem 
J01DH04 
Doxycycline 
J01AA02 
Enoxacin 
J01MA04 
Epicil in 
J01CA07 
Ertapenem 
J01DH03 
Erythromycin 
J01FA01 
Ethambutol  
J04AK02 
Ethionamide 
J04AD03 
Faropenem 
J01DI03 
Fidaxomicin 
A07AA12 
Fleroxacin 
J01MA08 
Flomoxef 
J01DC14 
Flucloxacil in 
J01CF05 
Fluconazole 
J02AC01 
Flucytosine 
J02AX01 
Flumequine 
J01MB07 
Flurithromycin 
J01FA14 
Fosfomycin 
J01XX01 
Furazidin 
J01XE03 
Fusidic acid 
J01XC01 
Garenoxacin 
J01MA19 
Gatifloxacin 
J01MA16 
Gemifloxacin 
J01MA15 
Gentamicin 
J01GB03 
Grepafloxacin 
J01MA11 
Griseofulvin 
D01BA01 
Hachimycin 
J02AA02 
Hetacil in 
J01CA18 
Iclaprim 
J01EA03 
Imipenem and enzyme inhibitor 
J01DH51 
Isavuconazole 
J02AC05 
Isepamicin 
J01GB11 
Isoniazid 
J04AC01 
Itraconazole 
J02AC02 
Josamycin 
J01FA07 
Kanamycin 
A07AA08 
Kanamycin 
J01GB04 
Ketoconazole 
J02AB02 
Latamoxef 
J01DD06 
Levofloxacin 
J01MA12 
Levofloxacin, combinations with other antibacterials 
J01RA05 
Lincomycin 
J01FF02 
Linezolid 
J01XX08 
Lomefloxacin 
J01MA07 
45 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Antimicrobial agent: generic name 
ATC5 
Loracarbef 
J01DC08 
Lymecycline 
J01AA04 
Mandelic acid 
J01XX06 
Mecil inam 
J01CA11 
Meropenem 
J01DH02 
Metacycline 
J01AA05 
Metampicil in 
J01CA14 
Methenamine 
J01XX05 
Meticil in 
J01CF03 
Metronidazole (oral, rectal) 
P01AB01 
Metronidazole (parenteral) 
J01XD01 
Metronidazole, combinations 
P01AB51 
Mezlocil in 
J01CA10 
Micafungin 
J02AX05 
Miconazole 
J02AB01 
Midecamycin 
J01FA03 
Minocycline 
J01AA08 
Miocamycin 
J01FA11 
Moxifloxacin 
J01MA14 
Nafcil in 
J01CF06 
Nalidixic acid 
J01MB02 
Natamycin 
A07AA03 
Nemonoxacin 
J01MB08 
Neomycin (injection, infusion) 
J01GB05 
Neomycin (oral) 
A07AA01 
Neomycin, combinations (oral) 
A07AA51 
Netilmicin 
J01GB07 
Nifurtoinol 
J01XE02 
Nimorazole 
P01AB06 
Nitrofurantoin 
J01XE01 
Nitrofurantoin, combinations 
J01XE51 
Nitroxoline 
J01XX07 
Norfloxacin 
J01MA06 
Norfloxacin and tinidazole 
J01RA13 
Nystatin 
A07AA02 
Ofloxacin 
J01MA01 
Ofloxacin and ornidazole 
J01RA09 
Oleandomycin 
J01FA05 
Oritavancin 
J01XA05 
Ornidazole (oral) 
P01AB03 
Ornidazole (parenteral) 
J01XD03 
Oxacil in 
J01CF04 
Oxolinic acid 
J01MB05 
Oxytetracycline 
J01AA06 
Oxytetracycline, combinations 
J01AA56 
Panipenem and betamipron 
J01DH55 
Paromomycin 
A07AA06 
Pazufloxacin 
J01MA18 
Pefloxacin 
J01MA03 
Penamecil in 
J01CE06 
Penicil ins, combinations with other antibacterials 
J01RA01 
Penimepicycline 
J01AA10 
46 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Antimicrobial agent: generic name 
ATC5 
Pheneticil in 
J01CE05 
Phenoxymethylpenicil in 
J01CE02 
Pipemidic acid 
J01MB04 
Piperacil in 
J01CA12 
Piperacil in and enzyme inhibitor 
J01CR05 
Piromidic acid 
J01MB03 
Pivampicil in 
J01CA02 
Pivmecil inam 
J01CA08 
Polymyxin B 
A07AA05 
Polymyxin B 
J01XB02 
Posaconazole 
J02AC04 
Pristinamycin 
J01FG01 
Procaine benzylpenicil in 
J01CE09 
Propenidazole 
P01AB05 
Propicil in 
J01CE03 
Prulifloxacin 
J01MA17 
Pyrazinamide 
J04AK01 
Quinupristin/dalfopristin 
J01FG02 
Ribostamycin 
J01GB10 
Rifabutin 
J04AB04 
Rifampicin 
J04AB02 
Rifaximin 
A07AA11 
Rokitamycin 
J01FA12 
Rolitetracycline 
J01AA09 
Rosoxacin 
J01MB01 
Roxithromycin 
J01FA06 
Rufloxacin 
J01MA10 
Secnidazole 
P01AB07 
Sisomicin 
J01GB08 
Sitafloxacin 
J01MA21 
Solithromycin 
J01FA16 
Sparfloxacin 
J01MA09 
Spectinomycin 
J01XX04 
Spiramycin 
J01FA02 
Spiramycin and metronidazole 
J01RA04 
Streptoduocin 
J01GA02 
Streptomycin (oral) 
A07AA04 
Streptomycin (parenteral) 
J01GA01 
Streptomycin, combinations 
A07AA54 
Sulbactam 
J01CG01 
Sulbenicil in 
J01CA16 
Sulfadiazine 
J01EC02 
Sulfadiazine and tetroxoprim 
J01EE06 
Sulfadiazine and trimethoprim 
J01EE02 
Sulfadimethoxine 
J01ED01 
Sulfadimidine 
J01EB03 
Sulfadimidine and trimethoprim 
J01EE05 
Sulfafurazole 
J01EB05 
Sulfaisodimidine 
J01EB01 
Sulfalene 
J01ED02 
Sulfamazone 
J01ED09 
Sulfamerazine 
J01ED07 
47 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Antimicrobial agent: generic name 
ATC5 
Sulfamerazine and trimethoprim 
J01EE07 
Sulfamethizole 
J01EB02 
Sulfamethoxazole 
J01EC01 
Sulfamethoxazole and trimethoprim 
J01EE01 
Sulfamethoxypyridazine 
J01ED05 
Sulfametomidine 
J01ED03 
Sulfametoxydiazine 
J01ED04 
Sulfametrole and trimethoprim 
J01EE03 
Sulfamoxole 
J01EC03 
Sulfamoxole and trimethoprim 
J01EE04 
Sulfanilamide 
J01EB06 
Sulfaperin 
J01ED06 
Sulfaphenazole 
J01ED08 
Sulfapyridine 
J01EB04 
Sulfathiazole 
J01EB07 
Sulfathiourea 
J01EB08 
Sulfonamides, combinations with other antibacterials (excl. trimethoprim) 
J01RA02 
Sultamicil in 
J01CR04 
Talampicil in 
J01CA15 
Tazobactam 
J01CG02 
Tedizolid 
J01XX11 
Teicoplanin 
J01XA02 
Telavancin 
J01XA03 
Telithromycin 
J01FA15 
Temafloxacin 
J01MA05 
Temocil in 
J01CA17 
Terbinafine 
D01BA02 
Tetracycline 
J01AA07 
Tetracycline and oleandomycin 
J01RA08 
Thiamphenicol 
J01BA02 
Thiamphenicol, combinations 
J01BA52 
Ticarcil in 
J01CA13 
Ticarcil in and enzyme inhibitor 
J01CR03 
Tigecycline 
J01AA12 
Tinidazole (oral, rectal) 
P01AB02 
Tinidazole (parenteral) 
J01XD02 
Tobramycin 
J01GB01 
Trimethoprim 
J01EA01 
Troleandomycin 
J01FA08 
Trovafloxacin 
J01MA13 
Vancomycin (oral) 
A07AA09 
Vancomycin (parenteral) 
J01XA01 
Voriconazole 
J02AC03 
Xibornol 
J01XX02 
 
 
 
48 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Healthcare-associated infections: code lists 
HAI code list, table 

HAI code 
HAI label 
SSI-S 
Surgical site infection, superficial incisional  
SSI-D 
Surgical site infection, deep incisional  
SSI-O 
Surgical site infection, organ/space 
PN1 
Pneumonia, clinical + positive quantitative culture from minimally contaminated lower respiratory tract 
specimen 
PN2 
Pneumonia, clinical + positive quantitative culture from possibly contaminated lower respiratory tract specimen 
PN3 
Pneumonia, clinical + microbiological diagnosis by alternative microbiology methods 
PN4 
Pneumonia, clinical + positive sputum culture or non-quantitative culture from lower respiratory tract 
specimen 
PN5 
Pneumonia: clinical signs of pneumonia without positive microbiology 
UTI-A 
symptomatic urinary tract infection, microbiological y confirmed 
UTI-B 
symptomatic urinary tract infection, not microbiologically confirmed  
BSI 
Bloodstream infection (laboratory-confirmed), other than CRI3  
CRI1-CVC 
Local CVC-related infection (no positive blood culture) 
CRI2-CVC 
General CVC-related infection (no positive blood culture) 
CRI3-CVC 
Microbiologically confirmed CVC-related bloodstream infection 
CRI1-PVC 
Local PVC-related infection (no positive blood culture) 
CRI2-PVC 
General PVC-related infection (no positive blood culture) 
CRI3-PVC 
Microbiologically confirmed PVC-related bloodstream infection 
BJ-BONE 
Osteomyelitis 
BJ-JNT 
Joint or bursa 
BJ-DISC 
Disc-space infection 
CNS-IC 
Intracranial infection 
CNS-MEN 
Meningitis or ventriculitis 
CNS-SA 
Spinal abscess without meningitis 
CVS-VASC 
Arterial or venous infection 
CVS-ENDO 
Endocarditis 
CVS-CARD 
Myocarditis or pericarditis 
CVS-MED 
Mediastinitis 
EENT-CONJ 
Conjunctivitis 
EENT-EYE 
Eye, other than conjunctivitis 
EENT-EAR 
Ear mastoid  
EENT-ORAL 
Oral cavity (mouth, tongue, or gums)  
EENT-SINU 
Sinusitis 
EENT-UR 
Upper respiratory tract, pharyngitis, laryngitis, epiglottitis  
LRI-BRON 
Bronchitis, tracheobronchitis, bronchiolitis, tracheitis, without evidence of pneumonia 
LRI-LUNG 
Other infections of the lower respiratory tract 
GI-CDI 
Clostridium difficile infection 
GI-GE 
Gastroenteritis (excluding CDI) 
GI-GIT 
Gastrointestinal tract (esophagus, stomach, small and large bowel, and rectum), excluding GE, CDI 
GI-HEP 
Hepatitis 
GI-IAB 
Intra-abdominal infection, not specified elsewhere  
REPR-EMET 
Endometritis 
REPR-EPIS 
Episiotomy 
REPR-VCUF 
Vaginal cuff 
REPR-OREP 
Other infections of the male or female reproductive tract 
SST-SKIN 
Skin infection 
SST-ST 
Soft tissue (necrotizing fascitis, infectious gangrene, necrotizing cel ulitis, infectious myositis, lymphadenitis, or 
lymphangitis) 
SST-DECU 
Decubitus ulcer, including both superficial and deep infections 
SST-BURN 
Burn 
SST-BRST 
Breast abscess or mastitis 
SYS-DI 
Disseminated infection 
SYS-CSEP 
Treated unidentified severe infection in adults and children 
NEO-CSEP 
Clinical sepsis in neonates 
NEO-LCBI 
Laboratory-confirmed bloodstream infection in neonates, non-CNS 
NEO-CNSB 
Laboratory-confirmed bloodstream infection with coagulase-negative staphylococci in neonates 
NEO-PNEU 
Pneumonia in neonates 
NEO-NEC 
Necrotising enterocolitis 
 
 
49 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Definition of active HAI 
Onset of HAI1 
 
Case definition 
Day 3 onwards 
AND  Meets the case definition on the day of survey. 
OR 
Day 1 (day of admission) or Day 2: SSI criteria met 
at any time after admission (including previous 
surgery 30 days/90 days).  
OR 
OR 
Day 1 or Day 2 AND patient discharged from acute 
care hospital in preceding 48 hours. 
OR 
Day 1 or Day 2 AND patient discharged from acute 
Patient is receiving treatment3  
care hospital in preceding 28 days if CDI2 present. 
AND  
HAI has previously met the case definition between 
OR 
Day 1 of treatment and survey day. 
Day 1 or Day 2 AND patient has relevant device 
inserted on this admission prior to onset. 
1 Date of onset of HAI: date of first signs or symptoms of the infection; if unknown, record the date when treatment was started 
for this infection or the date the first diagnostic sample was taken. If no treatment or sample, please estimate. Not to be 
recorded if signs/symptoms are present at admission. 
 2CDI: Clostridium difficile infection  
 3Any kind of treatment, not necessarily antimicrobial. 
 
 
50 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
HAI case definition codes, overview 
SSI 
Surgical site infection 
 
SSI-S 
Superficial incisional 
 
SSI-D 
Deep incisional 
 
SSI-O 
Organ/space 
PN 
Pneumonia 
 
PN1 
Positive quantitative culture from minimally contaminated lower respiratory tract specimen 
 
PN2 
Positive quantitative culture from possibly contaminated lower respiratory tract specimen 
 
PN3 
Microbiological diagnosis by alternative microbiology methods 
 
PN4 
Positive sputum culture or non-quantitative culture from lower respiratory tract specimen 
 
PN5 
Clinical signs of pneumonia without positive microbiology 
UTI 
Urinary tract infection* 
 
UTI-A 
Microbiological y confirmed symptomatic UTI 
 
UTI-B 
Not microbiologically confirmed symptomatic UTI 
 
* Asymptomatic bacteriuria are not within the scope of the PPS 
BSI 
Bloodstream infection (laboratory-confirmed) 
 
Source of BSI: 
 
C-CVC 
Central vascular catheter (note: report as CRI3 if microbiological criteria are met) 
 
C-PVC 
Peripheral vascular catheter 
 
S-PUL 
Secondary to pulmonary infection 
 
S-UTI 
Secondary to urinary tract infection 
 
S-DIG 
Secondary to digestive tract infection 
 
S-SSI 
Secondary to surgical site infection 
 
S-SST 
Secondary to skin and soft tissue infection 
 
S-OTH 
Secondary to another infection 
 
UO 
BSI of (confirmed) unknown origin 
 
UNK 
No information/truly unknown 
CRI-CVC 
Central vascular catheter-related infection 
 
CRI1-CVC  Local CVC-related infection (no positive blood culture) 
 
CRI2-CVC  General CVC-related infection (no positive blood culture) 
 
CRI3-CVC  Microbiological y confirmed CVC-related BSI 
CRI-PVC 
Peripheral vascular catheter-related infection 
 
CRI1-PVC  Local PVC-related infection (no positive blood culture) 
 
CRI2-PVC  General CRI (no positive blood culture) 
 
CRI3-PVC  Microbiological y confirmed PVC-related BSI 
CVS 
Cardiovascular system infection 
  
VASC 
Arterial or venous infection 
  
ENDO 
Endocarditis 
  
CARD 
Myocarditis or pericarditis 
  
MED 
Mediastinitis 
CNS 
Central nervous system infection 
  
IC 
Intracranial infection 
  
MEN 
Meningitis or ventriculitis 
  
SA 
Spinal abscess without meningitis 
EENT 
Eye, ear, nose or mouth infection 
  
CONJ 
Conjunctivitis 
  
EYE 
Eye, other than conjunctivitis 
  
EAR 
Ear mastoid  
  
ORAL 
Oral cavity (mouth, tongue, or gums)  
  
SINU 
Sinusitis 
  
UR 
Upper respiratory tract, pharyngitis, laryngitis, epiglottitis  
GI   
Gastrointestinal system infections 
  
CDI 
Clostridium difficile infection 
  
GE 
Gastroenteritis (excluding CDI) 
  
GIT 
Gastrointestinal tract (esophagus, stomach, small and large bowel, and rectum), excluding GE, CDI 
  
HEP 
Hepatitis 
  
IAB 
Intra-abdominal, not specified elsewhere  
LRI 
Lower respiratory tract infection, other than pneumonia 
  
BRON 
Bronchitis, tracheobronchitis, bronchiolitis, tracheitis, without evidence of pneumonia 
  
LUNG 
Other infections of the lower respiratory tract 
51 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
REPR 
Reproductive tract infections 
  
EMET 
Endometritis 
  
EPIS 
Episiotomy 
  
VCUF 
Vaginal cuff 
  
OREP 
Other infections of the male or female reproductive tract 
SST 
Skin and soft tissue infections 
  
SKIN 
Skin 
  
ST 
Soft tissue (necrotising fascitis, infectious gangrene, necrotizing cel ulitis, infectious myositis, 
lymphadenitis, or lymphangitis) 
  
DECU 
Decubitus ulcer, including both superficial and deep infections 
  
BURN 
Burn 
  
BRST 
Breast abscess or mastitis 
BJ   
Bone and joint infection 
  
BONE 
Osteomyelitis 
  
JNT 
Joint or bursa 
  
DISC 
Disc space infection 
SYS 
Systemic infections 
  
DI 
Disseminated infection 
  
CSEP 
Treated unidentified severe infection in adults and children 
NEO 
CASE DEFINITIONS FOR NEONATES 
  
CSEP 
Clinical sepsis in neonates 
  
LCBI 
Laboratory-confirmed bloodstream infection in neonates, non-coagulase-negative staphylococci 
  
CNSB 
Laboratory-confirmed bloodstream infection with coagulase-negative staphylococci in neonates 
  
PNEU 
Pneumonia in neonates 
  
NEC 
Necrotising enterocolitis 
 
BSI origin (BSI source) code list 
Related to catheter  
C-CVC 
Central vascular catheter, clinical relationship (e.g. symptoms improve within 48 hours after 
catheter removal)  
C-PVC 
Peripheral vascular catheter, clinical relationship (e.g. symptoms improve within 48 hours after 
catheter removal)  

CRI3-CVC, central vascular catheter, microbiologically confirmed  

CRI3-PVC, peripheral vascular catheter, microbiological y confirmed 
Secondary to another site 
S-PUL 
Pulmonary infection 
S-UTI 
Urinary tract infection 
S-SSI 
Surgical site infection 
S-DIG 
Digestive tract infection 
S-SST 
Skin soft tissue 
S-OTH 
Other infection (e.g. meningitis, osteomyelitis, etc.) 
BSI of unknown origin 
UO 
None of the above; BSI confirmed to be of unknown origin 
* Note: Do not report CRI3 as BSI with BSI origin C-CVC or C-PVC, but use CRI3-CVC or CRI3-PVC; see CRI definitions. 
52 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Case definitions of healthcare-associated infections 
SSI: SURGICAL SITE INFECTION 
Superficial incisional (SSI-S) 

Infection occurs within 30 days after the operation and infection involves only skin and subcutaneous tissue of the 
incision and at least one of the following: 
 
Purulent drainage with or without laboratory confirmation, from the superficial incision. 
 
Organisms isolated from an aseptically obtained culture of fluid or tissue from the superficial incision. 
 
At least one of the following signs or symptoms of infection: pain or tenderness, localised swelling, redness, 
or heat, and superficial incision is deliberately opened by surgeon, unless incision is culture-negative. 
 
Diagnosis of superficial incisional SSI made by a surgeon or attending physician. 
Deep incisional (SSI-D) 
Infection occurs within 30 days after the operation if no implant is left in place, or within 90 days if implant is in 
place and the infection appears to be related to the operation and infection involves deep soft tissue (e.g. fascia, 
muscle) of the incision and at least one of the following: 
 
Purulent drainage from the deep incision but not from the organ/space component of the surgical site. 
 
A deep incision spontaneously dehisces or is deliberately opened by a surgeon when the patient has at least 
one of the following signs or symptoms: fever (> 38 °C), localised pain or tenderness, unless incision is 
culture-negative. 
 
An abscess or other evidence of infection involving the deep incision is found on direct examination, during 
reoperation, or by histopathologic or radiologic examination. 
 
Diagnosis of deep incisional SSI made by a surgeon or attending physician. 
Organ/space (SSI-O) 
Infection occurs within 30 days after the operation if no implant is left in place, or within 90 days if implant is in 
place and the infection appears to be related to the operation and infection involves any part of the anatomy (e.g. 
organs and spaces) other than the incision which was opened or manipulated during an operation, and at least one 
of the following: 
 
purulent drainage from a drain that is placed through a stab wound into the organ/space; 
 
organisms isolated from an aseptically obtained culture of fluid or tissue in the organ/space; 
 
an abscess or other evidence of infection involving the organ/space that is found on direct examination, 
during reoperation, or by histopathologic or radiologic examination; 
 
diagnosis of organ/space SSI made by a surgeon or attending physician. 
53 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
PN: PNEUMONIA 
Two or more serial chest X-rays or CT-scans with a suggestive image of pneumonia for patients with underlying 
 
Rx
cardiac or pulmonary disease (in patients without underlying cardiac or pulmonary disease one definitive chest X-
ray or CT-scan is sufficient), 
and at least one of the following: 
 
fever > 38 °C with no other cause; 
 
leukopenia (<4 000 WBC/mm3) or leucocytosis ( 12 000 WBC/mm3); 
 
 s
and at least one of the following (or at least two if clinical pneumonia only = PN 4 and PN 5): 
om
 
pt
 
new onset of purulent sputum, or change in character of sputum (colour, odour, quantity, consistency); 
Sym
 
cough or dyspnea or tachypnea; 
 
suggestive auscultation (rales or bronchial breath sounds), ronchi, wheezing; 
 
worsening gas exchange (e.g. O2 desaturation or increased oxygen requirements or increased ventilation 
demand); 
and according to the used diagnostic method: 
 
a) Bacteriologic diagnostic test performed by: 
 
Positive quantitative culture from minimally contaminated LRT (lower respiratory tract) specimen (PN 1): 
 
broncho-alveolar lavage (BAL) with a threshold of > 104 CFU2/ml or  5 % of BAL obtained cells 
contain intracellular bacteria on direct microscopic exam (classified on the diagnostic category BAL); 
 
protected brush (PB Wimberley) with a threshold of > 103 CFU/ml; 
 
distal protected aspirate (DPA) with a threshold of > 103 CFU/ml.  
 
Positive quantitative culture from possibly contaminated LRT specimen (PN 2): 
 
Quantitative culture of LRT specimen (e.g. endotracheal aspirate) with a threshold of 106 CFU/ml 
b) Alternative microbiology methods (PN 3):  
 
 
positive blood culture not related to another source of infection; 
ology
 
Positive growth in culture of pleural fluid;  
bi
 
 
pleural or pulmonary abscess with positive needle aspiration; 
icro

M
 
histologic pulmonary exam shows evidence of pneumonia;  
 
positive exams for pneumonia with virus or particular germs (Legionella, Aspergillus, mycobacteria, 
mycoplasma, Pneumocystis carinii): 
 
positive detection of viral antigen or antibody from respiratory secretions (e.g. EIA, FAMA, shell vial 
assay, PCR); 
 
positive direct exam or positive culture from bronchial secretions or tissue;  
 
seroconversion (e.g. influenza viruses, Legionella, Chlamydia); 
 
detection of antigens in urine (Legionella). 
c) Others: 
 
positive sputum culture or non-quantitative LRT specimen culture (PN 4)
 
no positive microbiology (PN 5)
Notes:  
One definitive chest X-ray or CT-scan for the current pneumonia episode may be sufficient in patients with underlying cardiac or 
pulmonary disease if comparison with previous X-rays is possible. 
PN 1 and PN 2 criteria were validated without previous antimicrobial therapy. However, this does not exclude the diagnosis of 
PN 1 or PN 2 in the case of previous antimicrobial use. 
Comment: The subdivision of the pneumonia definition in five categories allows for the comparison of similar 
entities of pneumonia within and between countries. It is essential that all hospitals report PN4 and PN5 (clinical 
pneumonia without microbiological evidence) if appropriate in order to achieve overall comparability, even if a 
microbiological exam was performed and yielded negative results. It is also advised, both for clinical and 
surveillance purposes, that networks promote as microbiological confirmation (PN1–3) as a routine practice, at 
least in the ICU. 
 
                                                      
2 Colony-forming units 
54 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Intubation-associated pneumonia (IAP): a pneumonia is defined as intubation-associated (IAP) if an invasive 
respiratory device was present (even intermittently) in the 48 hours preceding the onset of infection.  
UTI: URINARY TRACT INFECTION  
UTI-A: microbiologically confirmed symptomatic UTI 

 
Patient has at least one of the following signs of symptoms with no other recognised cause: fever (> 38°C), 
urgency, frequency, dysuria, or suprapubic tenderness  
and  
 
patient has a positive urine culture, that is, ≥ 105 microorganisms per ml of urine with no more than two 
species of microorganisms. 
UTI-B: not microbiologically confirmed symptomatic UTI 
 
Patient has at least two of the following with no other recognised cause: fever (> 38°C), urgency, 
frequency, dysuria, or suprapubic tenderness,  
and 
 
at least one of the following: 
 
positive dipstick for leukocyte esterase and/or nitrate; 
 
pyuria urine specimen with ≥ 10 WBC/ml or ≥ 3 WBC/high-power field of unspun urine; 
 
organisms seen on Gram stain of unspun urine; 
 
at least two urine cultures with repeated isolation of the same uropathogen (Gram-negative bacteria 
or S. saprophyticus) with ≥ 102 colonies/ml urine in nonvoided specimens; 
 
≤ 105 colonies/ml of a single uropathogen (Gram-negative bacteria or S. saprophyticus) in a patient 
being treated with effective antimicrobial agent for a urinary infection; 
 
physician diagnosis of a urinary tract infection; 
 
physician institutes appropriate therapy for a urinary infection. 
UTI-C: asymptomatic bacteriuria: EXCLUDED FOR PPS, not to be reported* 
 
Patient has no fever (> 38°C), urgency, frequency, dysuria, or suprapubic tenderness 
and  
either of the following criteria: 
 
Patient has had an indwelling urinary catheter within seven days before urine is cultured, 
and 
 
patient has a urine culture, that is, ≥ 105 microorganisms per ml of urine with no more than two species of 
microorganisms; 
 
patient has not had an indwelling urinary catheter within seven days before the first positive culture; 
and 
 
patient has had at least two positive urine cultures ≥ 105 microorganisms per mm3 of urine with repeated 
isolation of the same microorganism and no more than two species of microorganisms. 
* Note: Bloodstream infections secondary to asymptomatic bacteriuria are reported as BSI with source (origin) S-UTI 
 
 
55 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
BSI: BLOODSTREAM INFECTION 
BSI: Laboratory-confirmed bloodstream infection 

 
One positive blood culture for a recognised pathogen  
or 
 
patient has at least one of the following signs or symptoms: fever (> 38°C), chills, or hypotension  
and  
 
two positive blood cultures for a common skin contaminant (from two separate blood samples, usually 
within 48 hours). 
Skin contaminants = coagulase-negative staphylococci, Micrococcus sp., Propionibacterium acnes, Bacillus sp., 
Corynebacterium sp. 
Note: This definition corresponds to the former HELICS BSI-A definition; BSI-B (single blood culture for skin contaminants in 
patients with central vascular catheter and adapted treatment) was deleted fol owing recommendations at an ECDC expert 
meeting in January 2009 and subsequent confirmation at the annual meeting.  
Sources of bloodstream infection: 
 
Catheter related: the same microorganism was cultured from the catheter or symptoms improve within 48 
hours after removal of the catheter (C-PVC: peripheral catheter, C-CVC: central vascular catheter).  
Important: Report C-CVC or C-PVC BSI as CRI3-CVC or CRI3-PVC respectively if microbiologically confirmed; 
see CRI3 definition.  
 
Secondary to another infection: the same microorganism was isolated from another infection site, or strong 
clinical evidence exists that bloodstream infection was secondary to another infection site, invasive 
diagnostic procedure or foreign body: 
 
pulmonary (S-PUL); 
 
urinary tract infection (S-UTI); 
 
digestive tract infection (S-DIG); 
 
surgical site infection (S-SSI); 
 
skin and soft tissue (S-SST); 
 
other (S-OTH). 
 
Unkown origin (UO): none of the above, bloodstream infection of unknown origin (verified during survey 
and no source found) 
 
Unknown (UNK): no information available about the source of the bloodstream infection or information 
missing 
Note:  
Primary bloodstream infections include catheter-related BSI and BSI of unknown origin. 
A CVC-associated bloodstream infection in accordance with CDC/NHSN definitions (as opposed to CVC-related BSI) is a primary 
BSI with central venous catheter use (even intermittent) in the 48 hours preceding the onset of the infection: therefore the 
presence of ‘the relevant device’ (central/peripheral vascular catheter) in the 48 hours before onset of infection is col ected even 
in the absence of microbiological confirmation. (See also AJIC, 1997;25:112-6). 
 
 
56 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
CRI: CATHETER-RELATED INFECTION 
CRI1-CVC: local CVC-related infection (no positive blood culture) 
 
Quantitative CVC culture  103 CFU/ml (1) or semi-quantitative CVC culture > 15 CFU (2) 
and  
 
pus/inflammation at the insertion site or tunnel. 
CRI1-PVC: local PVC-related infection (no positive blood culture) 
 
Quantitative PVC culture  103 CFU/ml or semi-quantitative PVC culture > 15 CFU  
and  
 
pus/inflammation at the insertion site or tunnel. 
CRI2-CVC: General CVC-related infection (no positive blood culture) 
 
Quantitative CVC culture  103 CFU/ml or semi-quantitative CVC culture > 15 CFU  
and 
 
clinical signs improve within 48 hours after catheter removal. 
CRI2-PVC: General PVC-related infection (no positive blood culture) 
 
Quantitative PVC culture  103 CFU/ml or semi-quantitative PVC culture > 15 CFU 
and 
 
clinical signs improve within 48 hours after catheter removal.  
CRI3-CVC: microbiologically confirmed CVC-related bloodstream infection 
 
BSI occurring 48 hours before or after catheter removal (if any) 
and 
 
positive culture with the same microorganism of either: 
 
quantitative CVC culture  103 CFU/ml or semi-quantitative CVC culture > 15 CFU; 
 
quantitative blood culture ratio CVC blood sample/peripheral blood sample > 5 (3); 
 
differential delay of positivity of blood cultures (4): CVC blood sample culture positive two hours or 
more before peripheral blood culture (blood samples drawn at the same time); 
 
positive culture with the same microorganism from pus from insertion site. 
CRI3-PVC: microbiologically confirmed PVC-related bloodstream infection 
 
BSI occurring 48 hours before or after catheter removal (if any) 
and  
 
positive culture with the same microorganism of either: 
 
quantitative PVC culture  103 CFU/ml or semi-quantitative PVC culture > 15 CFU;  
 
positive culture with the same microorganism from pus from insertion site. 
Notes:  
  CVC=central vascular catheter; PVC=peripheral vascular catheter.  
  Central vascular catheter colonisation should not be reported. 
  A CRI3 (-CVC or -PVC) is also a bloodstream infection with source C-CVC or C-PVC respectively; however when a CRI3 is 
reported, the BSI should not be reported in the point prevalence survey; microbiologically confirmed catheter-related BSI 
should be reported as CRI3. 
References 
(1) Brun-Buisson C, Abrouk F, Legrand P, Huet Y, Larabi S, Rapin M. Diagnosis of central venous catheter-related 
sepsis. Critical level of quantitative tip cultures. Arch Intern Med 1987; 147(5):873-877. 
(2) Maki DG, Weise C, Sarafin H. A semiquantitative culture method for identifying intravenous-catheter-related 
infection. N Engl J Med 1977; 296:1305-1309. 
(3) Blot F, Nitenberg G, Brun-Buisson C. New tools in diagnosing catheter-related infections. Support Care Cancer 
2000; 8(4):287-292. 
(4) Quilici N, Audibert G, Conroy MC, Bollaert PE, Guillemin F, Welfringer P et al. Differential quantitative blood 
cultures in the diagnosis of catheter-related sepsis in intensive care units. Clin Infect Dis 1997; 25(5):1066-1070. 
(5) Raad I, Hanna HA, Alakech B, Chatzinikolaou I, Johnson MM, Tarrand J. Differential time to positivity: a useful 
method for diagnosing catheter-related bloodstream infections. Ann Intern Med. 2004 Jan 6;140(1):18-25. 
 
 
57 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
BJ: BONE AND JOINT INFECTION  
BJ-BONE: osteomyelitis  

Osteomyelitis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from bone;  
 
patient has evidence of osteomyelitis on direct examination of the bone during a surgical operation or 
histopathologic examination;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), localised swelling, tenderness, heat, or drainage at suspected site of bone infection; 
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from blood;  
 
positive blood antigen test (e.g. H. influenzae, S. pneumoniae); 
 
radiographic evidence of infection, e.g. abnormal findings on X-ray, CT scan, MRI, radiolabel scan 
(gallium, technetium, etc.).  
Reporting instructions: Report mediastinitis following cardiac surgery that is accompanied by osteomyelitis as 
surgical site infection-organ/space (SSI-O).  
BJ-JNT: joint or bursa  
Joint or bursa infections must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from joint fluid or synovial biopsy; 
 
patient has evidence of joint or bursa infection seen during a surgical operation or histopathologic 
examination;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: joint pain, 
swelling, tenderness, heat, evidence of effusion or limitation of motion;  
and  
at least one of the following:  
 
organisms and white blood cells seen on Gram’s stain of joint fluid;  
 
positive antigen test on blood, urine, or joint fluid;  
 
cellular profile and chemistries of joint fluid compatible with infection and not explained by an 
underlying rheumatologic disorder;  
 
radiographic evidence of infection, e.g. abnormal findings on X-ray, CT scan, MRI, radiolabel scan 
(gallium, technetium, etc.).  
BJ-DISC: disc space infection  
Vertebral disc space infection must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from vertebral disc space tissue obtained during a surgical operation or 
needle aspiration;  
 
patient has evidence of vertebral disc space infection seen during a surgical operation or histopathologic 
examination;  
 
patient has fever (> 38 °C) with no other recognised cause or pain at the involved vertebral disc space  
and 
radiographic evidence of infection, e.g. abnormal findings on X-ray, CT scan, MRI, radiolabel scan (gallium, 
technetium, etc.); 
 
patient has fever (> 38 °C) with no other recognised cause and pain at the involved vertebral disc space  
and  
positive antigen test on blood or urine (e.g. H. influenzae, S. pneumoniae, N. meningitidis, or Group B 
Streptococcus).  
 
 
58 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
CNS: CENTRAL NERVOUS SYSTEM INFECTION  
CNS-IC: intracranial infection (brain abscess, subdural or epidural infection, 

encephalitis)  
Intracranial infection must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from brain tissue or dura;  
 
patient has an abscess or evidence of intracranial infection seen during a surgical operation or 
histopathologic examination;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: headache, 
dizziness, fever (> 38 °C), localising neurologic signs, changing level of consciousness, or confusion,  
and  
at least one of the following:  
 
organisms seen on microscopic examination of brain or abscess tissue obtained by needle aspiration 
or by biopsy during a surgical operation or autopsy;  
 
positive antigen test on blood or urine;  
 
radiographic evidence of infection, e.g. abnormal findings on ultrasound, CT scan, MRI, radionuclide 
brain scan, or arteriogram; 
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen 
and,  
if diagnosis is made antemortem, physician institutes appropriate antimicrobial therapy.  
Reporting instruction: If meningitis and a brain abscess are present together, report the infection as IC.  
CNS-MEN: meningitis or ventriculitis  
Meningitis or ventriculitis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from cerebrospinal fluid (CSF);  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), headache, stiff neck, meningeal signs, cranial nerve signs, or irritability,  
and  
at least one of the following:  
 
increased white cells, elevated protein, and/or decreased glucose in CSF;  
 
organisms seen on Gram’s stain of CSF;  
 
organisms cultured from blood;  
 
positive antigen test of CSF, blood, or urine;  
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen  
and, 
if diagnosis is made antemortem, physician institutes appropriate antimicrobial therapy.  
Reporting instructions:  
 
Report CSF shunt infection as SSI if it occurs ≤90 days of placement; if >90 days or after 
manipulation/access of the shunt, report as CNS-MEN if the infection meets the general case definition of 
HAI 
 
Report meningoencephalitis as MEN.  
 
Report spinal abscess with meningitis as MEN.  
CNS-SA: spinal abscess without meningitis  
An abscess of the spinal epidural or subdural space, without involvement of the cerebrospinal fluid or adjacent 
bone structures, must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from abscess in the spinal epidural or subdural space; 
 
patient has an abscess in the spinal epidural or subdural space seen during a surgical operation or at 
autopsy or evidence of an abscess seen during a histopathologic examination;  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), back pain, focal tenderness, radiculitis, paraparesis, or paraplegia,  
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from blood;  
 
radiographic evidence of a spinal abscess, e.g. abnormal findings on myelography, ultrasound, CT 
scan, MRI, or other scans (gallium, technetium, etc.);  
and,  
if diagnosis is made antemortem, physician institutes appropriate antimicrobial therapy.  
Reporting instruction: Report spinal abscess with meningitis as meningitis. 
59 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
CVS: CARDIOVASCULAR SYSTEM INFECTION  
CVS-VASC: arterial or venous infection  

Arterial or venous infection must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from arteries or veins removed during a surgical operation and blood culture 
not done or no organisms cultured from blood;  
 
patient has evidence of arterial or venous infection seen during a surgical operation or histopathologic 
examination;  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), pain, erythema, or heat at involved vascular site, 
and 
more than 15 colonies cultured from intravascular cannula tip using semiquantitative culture method,  
and  
blood culture not done or no organisms cultured from blood.  
 
patient has purulent drainage at involved vascular site,  
and  
blood culture not done or no organisms cultured from blood.  
Reporting instructions: Report infections of an arteriovenous graft, shunt, or fistula, or intravascular cannulation 
site without organisms cultured from blood as CVS-VASC; report CVS-VASC matching the third criterion as CRI1 or 
CRI2, as appropriate. 
CVS-ENDO: endocarditis  
Endocarditis of a natural or prosthetic heart valve must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from valve or vegetation;  
 
patient has two or more of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), new or changing murmur, embolic phenomena, skin manifestations (i.e. petechiae, splinter 
haemorrhages, painful subcutaneous nodules), congestive heart failure, or cardiac conduction abnormality, 
and at least one of the following:  
 
organisms cultured from two or more blood cultures;  
 
organisms seen on Gram’s stain of valve when culture is negative or not done;  
 
valvular vegetation seen during a surgical operation or autopsy;  
 
positive antigen test on blood or urine (e.g. H. influenzae, S. pneumoniae, N. meningitidis, or Group 
B Streptococcus);  
 
evidence of new vegetation seen on echocardiogramme; 
and,  
if diagnosis is made antemortem, physician institutes appropriate antimicrobial therapy.  
CVS-CARD: myocarditis or pericarditis  
Myocarditis or pericarditis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from pericardial tissue or fluid obtained by needle aspiration or during a 
surgical operation;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), chest pain, paradoxical pulse, or increased heart size;  
and  
at least one of the following:  
 
abnormal ECG/EKG consistent with myocarditis or pericarditis;  
 
positive antigen test on blood (e.g. H. influenzae, S. pneumoniae);  
 
evidence of myocarditis or pericarditis on histologic examination of heart tissue;  
 
fourfold rise in type-specific antibody with or without isolation of virus from pharynx or feces;  
 
pericardial effusion identified by echocardiogramme, CT scan, MRI, or angiography.  
Note: Most cases of postcardiac surgery or postmyocardial infarction pericarditis are not infectious.  
CVS-MED: mediastinitis  
Mediastinitis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from mediastinal tissue or fluid obtained during a surgical operation or 
needle aspiration;  
 
patient has evidence of mediastinitis seen during a surgical operation or histopathologic examination;  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), chest pain, or sternal instability;  
and  
at least one of the following:  
60 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
 
purulent discharge from mediastinal area; 
 
organisms cultured from blood or discharge from mediastinal area; 
 
mediastinal widening on X-ray.  
Reporting instruction: Report mediastinitis following cardiac surgery that is accompanied by osteomyelitis as SSI-O. 
 
 
61 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
EENT: EYE, EAR, NOSE, THROAT, OR MOUTH INFECTION  
EENT-CONJ: conjunctivitis  

Conjunctivitis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has pathogens cultured from purulent exudate obtained from the conjunctiva or contiguous tissues, 
such as eyelid, cornea, meibomian glands, or lacrimal glands;  
 
patient has pain or redness of conjunctiva or around eye;  
and  
at least one of the following:  
 
WBCs and organisms seen on Gram stain of exudates;  
 
purulent exudates;  
 
positive antigen test (e.g. ELISA or IF for Chlamydia trachomatis, herpes simplex virus, adenovirus) 
on exudate or conjunctival scraping; 
 
multinucleated giant cells seen on microscopic examination of conjunctival exudate or scrapings  
 
positive viral culture; 
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen.  
Reporting instructions  
 
Report other infections of the eye as EYE.  
 
Do not report chemical conjunctivitis caused by silver nitrate (AgNO3) as a health care–associated infection.  
 
Do not report conjunctivitis that occurs as a part of a more widely disseminated viral illness (such as 
measles, chickenpox, or a URI).  
EENT-EYE: eye, other than conjunctivitis  
An infection of the eye, other than conjunctivitis, must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from anterior or posterior chamber or vitreous fluid.  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: eye pain, visual 
disturbance, or hypopyon and at least one of the following:  
 
physician diagnosis of an eye infection  
 
positive antigen test on blood (e.g. H. influenzae, S. pneumoniae)  
 
organisms cultured from blood.  
EENT-EAR: ear mastoid  
Ear and mastoid infections must meet at least one of the following criteria:  
Otitis externa must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has pathogens cultured from purulent drainage from ear canal;  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), pain, redness, or drainage from ear canal  
 
and organisms seen on Gram’s stain of purulent drainage.  
Otitis media must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from fluid from middle ear obtained by tympanocentesis or at surgical 
operation;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), pain in the eardrum, inflammation, retraction or decreased mobility of eardrum, or fluid 
behind eardrum.  
Otitis interna must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from fluid from inner ear obtained at surgical operation;  
 
patient has a physician diagnosis of inner ear infection.  
Mastoiditis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from purulent drainage from mastoid; 
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), pain, tenderness, erythema, headache, or facial paralysis;  
and  
at least one of the following:  
 
a. organisms seen on Gram stain of purulent material from mastoid; 
 
b. positive antigen test on blood.  
62 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
EENT-ORAL: oral cavity (mouth, tongue, or gums)  
Oral cavity infections must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from purulent material from tissues of oral cavity;  
 
patient has an abscess or other evidence of oral cavity infection seen on direct examination, during a 
surgical operation, or during a histopathologic examination;  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause: abscess, 
ulceration, or raised white patches on inflamed mucosa, or plaques on oral mucosa;  
and  
at least one of the following:  
 
organisms seen on Gram’s stain;  
 
positive KOH (potassium hydroxide) stain;  
 
multinucleated giant cells seen on microscopic examination of mucosal scrapings;  
 
positive antigen test on oral secretions;  
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen;  
 
physician diagnosis of infection and treatment with topical or oral antifungal therapy.  
Reporting instructions: Report healthcare-associated primary herpes simplex infections of the oral cavity as ORAL; 
recurrent herpes infections are not healthcare-associated.  
EENT-SINU: sinusitis  
Sinusitis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from purulent material obtained from sinus cavity;  
 
patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), pain or tenderness over the involved sinus, headache, purulent exudate, or nasal 
obstruction; 
and  
at least one of the following:  
 
positive transillumination;  
 
positive radiographic examination (including CT scan).  
EENT-UR: upper respiratory tract, pharyngitis, laryngitis, epiglottitis  
Upper respiratory tract infections must meet at least one of the following criteria:  
 
Patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), erythema of pharynx, sore throat, cough, hoarseness, or purulent exudate in throat;  
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from the specific site;  
 
organisms cultured from blood;  
 
positive antigen test on blood or respiratory secretions;  
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen;  
 
physician diagnosis of an upper respiratory infection.  
 
Patient has an abscess seen on direct examination, during a surgical operation, or during a histopathologic 
examination.  
 
 
63 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
LRI: LOWER RESPIRATORY TRACT INFECTION, OTHER THAN 
PNEUMONIA  
LRI-BRON: bronchitis, tracheobronchitis, bronchiolitis, tracheitis, without 

evidence of pneumonia  
Tracheobronchial infections must meet at least one of the following criteria:  
 
Patient has no clinical or radiographic evidence of pneumonia  
and  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), cough, new or increased sputum production, rhonchi, wheezing and at least one of the 
following:  
 
positive culture obtained by deep tracheal aspirate or bronchoscopy;  
 
positive antigen test on respiratory secretions.  
Reporting instruction: Do not report chronic bronchitis in a patient with chronic lung disease as an infection unless 
there is evidence of an acute secondary infection, manifested by change in organism.  
LRI-LUNG: other infections of the lower respiratory tract  
Other infections of the lower respiratory tract must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms seen on smear or cultured from lung tissue or fluid, including pleural fluid;  
 
patient has a lung abscess or empyema seen during a surgical operation or histopathologic examination;  
 
patient has an abscess cavity seen on radiographic examination of lung.  
Reporting instructions: Report lung abscess or empyema without pneumonia as LUNG.  
 
 
64 
 
 
 


 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
GI: GASTROINTESTINAL SYSTEM INFECTION  
GI-CDI: Clostridium difficile infection 

A Clostridium difficile infection (previously also referred to as Clostridium difficile associated diarrhoea, or CDAD) 
must meet at least one of the following criteria: 
 
diarrhoeal stools or toxic megacolon, and a positive laboratory assay for C. difficile toxin A and/or B in stools 
or a toxin-producing C. difficile organism detected in stool via culture or other means, e.g. a positive PCR 
result; 
 
pseudomembranous colitis revealed by lower gastro-intestinal endoscopy; 
 
colonic histopathology characteristic of C. difficile infection (with or without diarrhoea) on a specimen 
obtained during endoscopy, colectomy or autopsy. 
Note: If clinical signs of Clostridium difficile infection appear in 28 days after hospital discharge period, GI-CDI must be defined as 
healthcare-associated infection. 
(*) May be community- or healthcare-associated, depending on case’s history. If healthcare-associated, may have been acquired 
in the same facility or imported. 
GI-GE: gastroenteritis (excluding CDI) 

Gastroenteritis must meet at least one of the following criteria:  
 
Patient has an acute onset of diarrhoea (liquid stools for more than 12 hours) with or without vomiting or 
fever (> 38 °C) and no likely non-infectious cause (e.g. diagnostic tests, therapeutic regimen other than 
antimicrobial agents, acute exacerbation of a chronic condition, or psychological stress).  
 
Patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: nausea, 
vomiting, abdominal pain, fever (> 38 °C), or headache;  
and 
at least one of the following:  
 
an enteric pathogen is cultured from stool or rectal swab;  
 
an enteric pathogen is detected by routine or electron microscopy;  
 
an enteric pathogen is detected by antigen or antibody assay on blood or feces;  
 
evidence of an enteric pathogen is detected by cytopathic changes in tissue culture (toxin assay);  
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen.  
GI-GIT: gastrointestinal tract (esophagus, stomach, small and large bowel, and 
rectum) excluding gastroenteritis and appendicitis  
Gastrointestinal tract infections, excluding gastroenteritis and appendicitis, must meet at least one of the following 
criteria:  
 
patient has an abscess or other evidence of infection seen during a surgical operation or histopathologic 
examination;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause and compatible 
with infection of the organ or tissue involved: fever (> 38 °C), nausea, vomiting, abdominal pain, or 
tenderness; 
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from drainage or tissue obtained during a surgical operation or endoscopy or 
from a surgically placed drain;  
 
organisms seen on Gram stain or KOH stain or multinucleated giant cells seen on microscopic 
examination of drainage or tissue obtained during a surgical operation or endoscopy or from a 
surgically placed drain;  
 
organisms cultured from blood;  
 
evidence of pathologic findings on radiographic examination;  
65 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
 
evidence of pathologic findings on endoscopic examination (e.g. Candida esophagitis or proctitis).  
GI-HEP: hepatitis  
Hepatitis must meet the following criterion:  
 
Patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), anorexia, nausea, vomiting, abdominal pain, jaundice, or history of transfusion within the 
previous three months;  
and  
at least one of the following:  
 
positive antigen or antibody test for hepatitis A, hepatitis B, hepatitis C, or delta hepatitis;  
 
abnormal liver function tests (e.g. elevated ALT/AST, bilirubin);  
 
cytomegalovirus (CMV) detected in urine or oropharyngeal secretions.  
Reporting instructions  
 
Do not report hepatitis or jaundice of non-infectious origin (alpha-1 antitrypsin deficiency, etc).  
 
Do not report hepatitis or jaundice that results from exposure to hepatotoxins (alcoholic or acetaminophen-
induced hepatitis, etc).  
 
Do not report hepatitis or jaundice that results from biliary obstruction (cholecystitis).  
GI-IAB: intra-abdominal, not specified elsewhere including gallbladder, bile ducts, 
liver (excluding viral hepatitis), spleen, pancreas, peritoneum, subphrenic or 
subdiaphragmatic space, or other intra-abdominal tissue or area not specified 
elsewhere  
Intra-abdominal infections must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from purulent material from intra-abdominal space obtained during a 
surgical operation or needle aspiration;  
 
patient has abscess or other evidence of intra-abdominal infection seen during a surgical operation or 
histopathologic examination;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), nausea, vomiting, abdominal pain, or jaundice;  
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from drainage from surgically placed drain (e.g. closed suction drainage system, 
open drain, T-tube drain);  
 
organisms seen on Gram stain of drainage or tissue obtained during surgical operation or needle 
aspiration; 
 
organisms cultured from blood and radiographic evidence of infection, e.g. abnormal findings on 
ultrasound, CT scan, MRI, or radiolabel scans (gallium, technetium, etc.) or on abdominal X-ray.  
Reporting instruction: Do not report pancreatitis (an inflammatory syndrome characterised by abdominal pain, 
nausea, and vomiting associated with high serum levels of pancreatic enzymes) unless it is determined to be 
infectious in origin.  
 
 
66 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
REPR: REPRODUCTIVE TRACT INFECTION  
REPR-EMET: endometritis  

Endometritis must meet at least one of the following criteria:  
  patient has organisms cultured from fluid or tissue from endometrium obtained during surgical operation, by 
needle aspiration, or by brush biopsy;  
  patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause:  
fever (> 38 °C), abdominal pain, uterine tenderness, or purulent drainage from uterus.  
 
Reporting instruction: Report postpartum endometritis as a health care-associated infection unless the amniotic 
fluid is infected at the time of admission or the patient was admitted 48 hours after rupture of the membrane.  
REPR-EPIS: episiotomy  
Episiotomy infections must meet at least one of the following criteria:  
  postvaginal delivery patient has purulent drainage from the episiotomy;  
  postvaginal delivery patient has an episiotomy abscess.  
REPR-VCUF: vaginal cuff  
Vaginal cuff infections must meet at least one of the following criteria:  
  posthysterectomy patient has purulent drainage from the vaginal cuff;  
  posthysterectomy patient has an abscess at the vaginal cuff;  
  posthysterectomy patient has pathogens cultured from fluid or tissue obtained from the vaginal cuff. 
  
Reporting instruction: Report vaginal cuff infections as SSI-O if other SSI criteria are met (within 30 days following 
hysterectomy). 
REPR-OREP: other infections of the male or female reproductive tract (epididymis, 
testes, prostate, vagina, ovaries, uterus, or other deep pelvic tissues, excluding 
endometritis or vaginal cuff infections)  
Other infections of the male or female reproductive tract must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from tissue or fluid from affected site;  
 
patient has an abscess or other evidence of infection of affected site seen during a surgical operation or 
histopathologic examination;  
 
patient has two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: fever (> 38 °C), 
nausea, vomiting, pain, tenderness, or dysuria;  
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from blood;  
 
physician diagnosis.  
Reporting instructions  
 
Report endometritis as EMET.  
 
Report vaginal cuff infections as VCUF.  
 
 
67 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
SST: SKIN AND SOFT TISSUE INFECTION  
SST-SKIN: skin infection  

Skin infections must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has purulent drainage, pustules, vesicles, or boils;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: pain or 
tenderness, localised swelling, redness, or heat; 
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from aspirate or drainage from affected site; if organisms are normal skin flora 
(i.e. diphtheroids [Corynebacterium spp], Bacillus [not B anthracis] spp, Propionibacterium spp, 
coagulase-negative staphylococci [including S epidermidis], viridans group streptococci, Aerococcus 
spp, Micrococcus spp), they must be a pure culture;  
 
organisms cultured from blood;  
 
positive antigen test performed on infected tissue or blood (e.g. herpes simplex, varicella zoster, H. 
influenzae, N. meningitidis);  
 
multinucleated giant cells seen on microscopic examination of affected tissue;  
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen.  
Reporting instructions  
 
Report infected decubitus ulcers as DECU.  
 
Report infected burns as BURN.  
 
Report breast abscesses or mastitis as BRST. 
SST-ST: soft tissue (necrotizing fascitis, infectious gangrene, necrotizing cellulitis, 
infectious myositis, lymphadenitis, or lymphangitis)  
Soft tissue infections must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has organisms cultured from tissue or drainage from affected site;  
 
patient has purulent drainage at affected site; 
 
patient has an abscess or other evidence of infection seen during a surgical operation or histopathologic 
examination;  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms at the affected site with no other recognised 
cause: localised pain or tenderness, redness, swelling, or heat; 
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from blood;  
 
positive antigen test performed on blood or urine (e.g. H. influenzae, S. pneumoniae, N. 
meningitidis, Group B Streptococcus, Candida spp); 
 
diagnostic single antibody titer (IgM) or fourfold increase in paired sera (IgG) for pathogen.  
Reporting instructions  
 
Report infected decubitus ulcers as DECU.  
 
Report infection of deep pelvic tissues as OREP.  
SST-DECU: decubitus ulcer, including both superficial and deep infections  
Decubitus ulcer infections must meet the following criterion:  
 
patient has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: redness, 
tenderness, or swelling of decubitus wound edges 
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from properly collected fluid or tissue (see comments below);  
 
organisms cultured from blood.  
Comments  
 
Purulent drainage alone is not sufficient evidence of an infection.  
 
Organisms cultured from the surface of a decubitus ulcer are not sufficient evidence that the ulcer is 
infected. A properly collected specimen from a decubitus ulcer involves needle aspiration of fluid or biopsy 
of tissue from the ulcer margin.  
SST-BURN: burn  
Burn infections must meet at least one of the following criteria:  
68 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
 
patient has a change in burn wound appearance or character, such as rapid eschar separation, or dark 
brown, black, or violaceous discoloration of the eschar, or edema at wound margin and histologic 
examination of burn biopsy shows invasion of organisms into adjacent viable tissue;  
 
patient has a change in burn wound appearance or character, such as rapid eschar separation, or dark 
brown, black, or violaceous discoloration of the eschar, or edema at wound margin;  
and  
at least one of the following:  
 
organisms cultured from blood in the absence of other identifiable infection;  
 
isolation of herpes simplex virus, histologic identification of inclusions by light or electron microscopy, 
or visualisation of viral particles by electron microscopy in biopsies or lesion scrapings.  
 
patient with a burn has at least two of the following signs or symptoms with no other recognised cause: 
fever (> 38 °C) or hypothermia (< 36 °C), hypotension, oliguria (< 20 cc/hr), hyperglycemia at previously 
tolerated level of dietary carbohydrate, or mental confusion;  
and  
at least one of the following:  
 
histologic examination of burn biopsy shows invasion of organisms into adjacent viable tissue  
 
organisms cultured from blood;  
 
isolation of herpes simplex virus, histologic identification of inclusions by light or electron microscopy, 
or visualisation of viral particles by electron microscopy in biopsies or lesion scrapings.  
Comments  
 
Purulence alone at the burn wound site is not adequate for the diagnosis of burn infection; such purulence 
may reflect incomplete wound care.  
 
Fever alone in a burn patient is not adequate for the diagnosis of a burn infection because fever may be the 
result of tissue trauma or the patient may have an infection at another site.  
 
Surgeons in regional burn centres who take care of burn patients exclusively may require Criterion 1 for 
diagnosis of burn infection. 
 
Hospitals with regional burn centres may further divide burn infections into the following: burn wound site, 
burn graft site, burn donor site, burn donor site-cadaver; NHSN, however, will code all of these as BURN.  
SST-BRST: breast abscess or mastitis  
A breast abscess or mastitis must meet at least one of the following criteria:  
 
patient has a positive culture of affected breast tissue or fluid obtained by incision and drainage or needle 
aspiration;  
 
patient has a breast abscess or other evidence of infection seen during a surgical operation or 
histopathologic examination;  
 
patient has fever (> 38 °C) and local inflammation of the breast and physician diagnosis of breast abscess.  
 
 
69 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
SYS: SYSTEMIC INFECTION  
SYS-DI: disseminated infection  

Disseminated infection is infection involving multiple organs or systems, without an apparent single site of 
infection, usually of viral origin, and with signs or symptoms with no other recognised cause and compatible with 
infectious involvement of multiple organs or systems.  
Reporting instructions  
 
Use this code for viral infections involving multiple organ systems (e.g. measles, mumps, rubella, varicella, 
erythema infectiosum). These infections often can be identified by clinical criteria alone. Do not use this 
code for healthcare-associated infections with multiple metastatic sites, such as with bacterial endocarditis.  
 
Do not report fever of unknown origin (FUO) as DI.  
 
Report viral exanthems or rash illness as DI. 
SYS-CSEP: treated unidentified severe infection (formerly: clinical sepsis in adults 
and children) 
 
Patient has at least one of the following: 
 
clinical signs or symptoms with no other recognised cause; 
 
fever (38 °C); 
 
hypotension (systolic pressure < 90 mm); 
 
or oliguria (20 cm3(ml)/hr); 
and 
 
blood culture not done or no organisms or antigen detected in blood; 
and 
 
no apparent infection at another site; 
and 
 
physician institutes treatment for sepsis. 
Reporting instructions:  
 
Do not use this code unless absolutely needed (last-resort definition). 
 
For CSEP in neonates, use NEO-CSEP case definition (see below). 
 
 
70 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
NEO: SPECIFIC NEONATAL CASE DEFINITIONS 
NEO-CSEP: clinical sepsis 

All of the three following criteria:   
 
supervising physician started appropriate antimicrobial therapy for sepsis for at least five days; 
 
no detection of pathogens in blood culture or not tested; 
 
no obvious infection at another site; 
and 
two of the following criteria (without other apparent cause): 
 
fever (> 38 °C) or temperature instability (frequent post-set of the incubator) or hypothermia 
(< 36.5 °C); 
 
tachycardia (> 200/min) or new /increased bradycardia (< 80/min); 
 
capillary refilling time (CRT) > 2s; 
 
new or increased apnoea(s) (> 20s); 
 
unexplained metabolic acidosis;  
 
new-onset hyperglycemia (> 140mg/dl); 
 
another sign of sepsis (skin colour (only if the CRT is not used), laboratory signs (CRP, interleukin), 
increased oxygen requirement (intubation), unstable general condition of the patient, apathy). 
Note: A one-time detection of coagulase-negative staphylococci (CNS) in blood cultures should not exclude the diagnosis of 
clinical sepsis. A clinical sepsis can also be diagnosed with a single positive blood culture with CNS, which is considered as a blood 
culture contamination, while other criteria of CNS bloodstream infection are not met and criteria of clinical sepsis have been met. 
NEO-LCBI: laboratory-confirmed BSI 
 
At least two of: temperature > 38 °C or < 36.5 °C or temperature instability, tachycardia or bradycardia, 
apnoea, extended capillary refilling time (CRT), metabolic acidosis, hyperglycaemia, other sign of BSI such 
as apathy;  
and 
 
a recognised pathogen other than coagulase-negative staphylococci (CNS) cultured from blood or 
cerebrospinal fluid (CSF; this is included because meningitis in this age group is usually haematogenous, so 
positive CSF can be regarded as evidence of BSI even if blood cultures are negative or were not taken). 
Note: In order to be consistent with BSI reporting in adults (including secondary BSI), the criterion ‘the organism is not related to 
an infection at another site’ was removed from the Neo-KISS definition for the purposes of the EU PPS. 
Report the origin of the neonatal BSI in the field BSI origin. 
If both the case definitions for NEO-LCBI and NEO-CNSB are matched, report NEO-LCBI. 
NEO-CNSB: laboratory-confirmed BSI with coagulase-negative staphylococci 
(CNS)  
 
At least two of: temperature > 38 °C or < 36.5 °C or temperature instability, tachycardia or bradycardia, 
apnoea, extended recapillarisation time, metabolic acidosis, hyperglycaemia, other sign of BSI such as 
apathy;  
and 
 
CNS is cultured from blood or catheter tip; 
and 
 
patient has one of: C-reactive protein > 2.0 mg/dL, immature/total neutrophil ratio (I/T ratio) > 0.2, 
leukocytes < 5/nL, platelets <100/nL. 
Note: In order to be consistent with BSI reporting in adults (including secondary BSI), the criterion ‘the organism is not related to 
an infection at another site’ was removed from the Neo-KISS definition for the purposes of the EU PPS. 
Report the origin of the neonatal BSI in the field BSI origin. 
If both the case definitions for NEO-LCBI and NEO-CNSB are matched, report NEO-LCBI. 
 
 
71 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
NEO-PNEU: pneumonia 
 
respiratory compromise;  
and 
 
new infiltrate, consolidation or pleural effusion on chest X-ray; 
and 
 
and at least four of: temperature > 38 °C or < 36.5 °C or temperature instability, tachycardia or 
bradycardia, tachypnoea or apnoea, dyspnoea, increased respiratory secretions, new onset of purulent 
sputum, isolation of a pathogen from respiratory secretions, C-reactive protein > 2.0 mg/dL, I/T ratio > 0.2. 
NEO-NEC: necrotising enterocolitis 
 
Histopathological evidence of necrotising enterocolitis;  
or  
 
at least one characteristic radiographic abnormality (pneumoperitoneum, pneumatosis intestinalis, 
unchanging ‘rigid’ loops of small bowel) 
plus at least two of the following without other explanation:  
vomiting, abdominal distention, prefeeding residuals, persistent microscopic or gross blood in stools. 
Algorithm for diagnosis of catheter-related infections  
Blood
culture
Positive blood culture
Negative blood culture
criteria
(or not done)
Tip/
Positive tip 
Negative 
Positive tip culture
Negative 
insertion site 
culture
tip culture 
tip culture 
culture
or tip 
or tip 
criteria
culture not 
culture not 
done
done
Symptoms 
Clinical signs 
Pus or 
Purulent 
improve 
improve 
inflammation 
Other
drainage at 
within 48 
within 48 
at tunnel site
criteria
involved 
hours of 
hours of 
vascular 
removal
removal
site
CRI3-CVC 
BSI, origin 
CRI2-CVC 
CRI1-CVC 
CVS-VASC
or 
C-CVC or 
or 
or 
HAI
CRI3-PVC
C-PVC
CRI2-PVC
CRI1-PVC
type
Hierarchy
 
Note: Arterial line is central or peripheral, depending on where it ends. 
72 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Microorganism code list 
The microorganism code list is adapted from the original WHOCARE coding system. The current list (150 codes) is 
a selection of microorganisms based on their frequency of occurrence in healthcare-associated infections in 
different infection types and/or on their public health importance. Networks/countries preferring to use the 
complete WHOCARE list (currently 990 codes) may obtain the database from ECDC. The minimal list (32 codes, 
currently used by some countries for HAI surveillance) should not be used for the EU PPS. 
Microorganism code list (PPS selection), by category 
Family 
Microorganism 
Code 
Gram + cocci 
Staphylococcus aureus 
STAAUR 
  
Staphylococcus epidermidis 
STAEPI 
  
Staphylococcus haemolyticus 
STAHAE 
  
Coagulase-negative staphylococci, not specified 
STACNS 
  
Other coagulase-negative staphylococci (CNS) 
STAOTH 
  
Staphylococcus spp., not specified 
STANSP 
  
Streptococcus pneumonia 
STRPNE 
  
Streptococcus agalactiae (B) 
STRAGA 
  
Streptococcus pyogenes (A) 
STRPYO 
  
Other haemolytic streptococci (C, G) 
STRHCG 
  
Streptococcus spp., other 
STROTH 
  
Streptococcus spp., not specified 
STRNSP 
  
Enterococcus faecalis 
ENCFAE 
  
Enterococcus faecium 
ENCFAI 
  
Enterococcus spp., other 
ENCOTH 
  
Enterococcus spp., not specified 
ENCNSP 
  
Gram-positive cocci, not specified 
GPCNSP 
  
Other Gram-positive cocci 
GPCOTH 
Gram – cocci 
Moraxella catharralis 
MORCAT 
  
Moraxella spp., other 
MOROTH 
  
Moraxella spp., not specified 
MORNSP 
  
Neisseria meningitides 
NEIMEN 
  
Neisseria spp., other 
NEIOTH 
  
Neisseria spp., not specified 
NEINSP 
  
Gram-negative cocci, not specified 
GNCNSP 
  
Other gram-negative cocci 
GNCOTH 
Gram + bacilli 
Corynebacterium spp. 
CORSPP 
  
Bacillus spp. 
BACSPP 
  
Lactobacillus spp. 
LACSPP 
  
Listeria monocytogenes 
LISMON 
  
Gram-positive bacilli, not specified 
GPBNSP 
  
Other gram-positive bacilli 
GPBOTH 
Enterobacteriaceae 
Citrobacter freundii 
CITFRE 
  
Citrobacter koseri (e.g. diversus) 
CITDIV 
  
Citrobacter spp., other 
CITOTH 
  
Citrobacter spp., not specified 
CITNSP 
  
Enterobacter cloacae 
ENBCLO 
  
Enterobacter aerogenes 
ENBAER 
  
Enterobacter agglomerans 
ENBAGG 
  
Enterobacter sakazaki  
ENBSAK 
  
Enterobacter gergoviae 
ENBGER 
  
Enterobacter spp., other 
ENBOTH 
  
Enterobacter spp., not specified 
ENBNSP 
  
Escherichia coli  
ESCCOL 
73 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Family 
Microorganism 
Code 
  
Klebsiella pneumonia 
KLEPNE 
  
Klebsiella oxytoca 
KLEOXY 
  
Klebsiella spp., other 
KLEOTH 
  
Klebsiella spp., not specified 
KLENSP 
  
Proteus mirabilis 
PRTMIR 
  
Proteus vulgaris 
PRTVUL 
  
Proteus spp., other 
PRTOTH 
  
Proteus spp., not specified 
PRTNSP 
  
Serratia marcescens 
SERMAR 
  
Serratia liquefaciens  
SERLIQ 
  
Serratia spp., other 
SEROTH 
  
Serratia spp., not specified 
SERNSP 
  
Hafnia spp. 
HAFSPP 
  
Morganella spp. 
MOGSPP 
  
Providencia spp. 
PRVSPP 
  
Salmonella Enteritidis 
SALENT 
  
Salmonella Typhi or Paratyphi 
SALTYP 
  
Salmonella Typhimurium 
SALTYM 
  
Salmonella spp., not specified 
SALNSP 
  
Salmonella spp., other 
SALOTH 
  
Shigella spp. 
SHISPP 
  
Yersinia spp. 
YERSPP 
  
Other enterobacteriaceae 
ETBOTH 
  
Enterobacteriaceae, not specified 
ETBNSP 
Gram – bacilli 
Acinetobacter baumannii  
ACIBAU 
  
Acinetobacter calcoaceticus 
ACICAL 
  
Acinetobacter haemolyticus 
ACIHAE 
  
Acinetobacter lwoffii 
ACILWO 
  
Acinetobacter spp., other 
ACIOTH 
  
Acinetobacter spp., not specified 
ACINSP 
  
Pseudomonas aeruginosa  
PSEAER 
  
Stenotrophomonas maltophilia 
STEMAL 
  
Burkholderia cepacia 
BURCEP 
  
Pseudomonadaceae family, other 
PSEOTH 
  
Pseudomonadaceae family, not specified 
PSENSP 
  
Haemophilus influenza 
HAEINF 
  
Haemophilus parainfluenzae 
HAEPAI 
  
Haemophilus spp., other  
HAEOTH 
  
Haemophilus spp., not specified 
HAENSP 
  
Legionella spp. 
LEGSPP 
  
Achromobacter spp. 
ACHSPP 
  
Aeromonas spp. 
AEMSPP 
  
Agrobacterium spp. 
AGRSPP 
  
Alcaligenes spp. 
ALCSPP 
  
Campylobacter spp. 
CAMSPP 
  
Flavobacterium spp. 
FLASPP 
  
Gardnerella spp. 
GARSPP 
  
Helicobacter pylori 
HELPYL 
  
Pasteurella spp. 
PASSPP 
  
Gram-negative bacilli, not specified 
GNBNSP 
  
Other Gram-negative bacilli, non enterobacteriaceae  
GNBOTH 
Anaerobic bacilli 
Bacteroïdes fragilis 
BATFRA 
74 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Family 
Microorganism 
Code 
  
Bacteroïdes other 
BATOTH 
  
Clostridium difficile 
CLODIF 
  
Clostridium other 
CLOOTH 
  
Propionibacterium spp. 
PROSPP 
  
Prevotella spp. 
PRESPP 
  
Anaerobes, not specified 
ANANSP 
  
Other anaerobes 
ANAOTH 
Other bacteria 
Mycobacterium, atypical 
MYCATY 
  
Mycobacterium tuberculosis complex 
MYCTUB 
  
Chlamydia spp. 
CHLSPP 
  
Mycoplasma spp. 
MYPSPP 
  
Actinomyces spp. 
ACTSPP 
  
Nocardia spp. 
NOCSPP 
  
Other bacteria 
BCTOTH 
Fungi 
Candida albicans 
CANALB 
  
Candida glabrata 
CANGLA 
  
Candida krusei 
CANKRU 
  
Candida parapsilosis 
CANPAR 
  
Candida tropicalis 
CANTRO 
  
Candida spp., other 
CANOTH 
  
Candida spp., not specified 
CANNSP 
  
Aspergillus fumigatus 
ASPFUM 
  
Aspergillus niger 
ASPNIG 
  
Aspergillus spp., other 
ASPOTH 
  
Aspergillus spp., not specified 
ASPNSP 
  
Other yeasts 
YEAOTH 
  
Fungi other 
FUNOTH 
  
Filaments other 
FILOTH 
  
Other parasites 
PAROTH 
Viruses 
Adenovirus 
VIRADV 
  
Cytomegalovirus (CMV) 
VIRCMV 
  
Enterovirus (polio, coxsackie, echo) 
VIRENT 
  
Hepatitis A virus 
VIRHAV 
  
Hepatitis B virus 
VIRHBV 
  
Hepatitis C virus 
VIRHCV 
  
Herpes simplex virus 
VIRHSV 
  
Human immunodeficiency virus (HIV) 
VIRHIV 
  
Influenza A virus 
VIRINA 
  
Influenza B virus 
VIRINB 
  
Influenza C virus 
VIRINC 
  
Norovirus 
VIRNOR 
  
Parainfluenzavirus 
VIRPIV 
  
Respiratory syncytial virus (RSV) 
VIRRSV 
  
Rhinovirus 
VIRRHI 
  
Rotavirus 
VIRROT 
  
SARS virus 
VIRSAR 
  
Varicella-zoster virus 
VIRVZV 
  
Virus, not specified 
VIRNSP 
  
Other virus 
VIROTH 
Microorganism not identified 
_NONID 
Examination not done 
_NOEXA 
Sterile examination 
_STERI 
75 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Family 
Microorganism 
Code 
Result not (yet) available or missing 
_NA 
Note:  
Negative microorganism codes: _NONID: evidence exists that a microbiological examination has been done, but the 
microorganism cannot be correctly classified; _NOEXA: no diagnostic sample taken, no microbiological examination done; 
_STERI: a microbiological examination has been done, but the result was negative (e.g. negative culture); _NA: the results of the 
microbiological examination are not yet available or cannot be retrieved.  
If available, microbiological results should be reported for the active HAI on the survey date, covering the entire infection 
episode. Results which are not available on the survey date should not be waited for. 
76 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
Antimicrobial resistance markers and codes 
The method for collecting AMR marker data was modified to allow comparative analysis between ECDC ARHAI 
networks EARS-Net and HAI-Net. 
New method to collect AMR markers 
For each antimicrobial marker, indicate whether microorganism is susceptible (S), intermediate (I), resistant (R) or 
susceptibility unknown (UNK): 
Staphylococcus aureus 
 
 
MRSA: Resistant to oxacillin (OXA) or other markers of methicillin-resistant S. aureus (MRSA), such as 
cefoxitin (FOX), cloxacillin (CLO), dicloxacillin (DIC), flucloxacillin (FLC), meticillin (MET)  
 
VRSA: Resistant to glycopeptides (GLY): vancomycin (VAN) or teicoplanin (TEC) 
 
VISA: Intermediate to glycopeptides (GLY): vancomycin (VAN) or teicoplanin (TEC) 
Enterococcus spp. 
 
VRE: Resistant to glycopeptides (GLY): vancomycin (VAN) or teicoplanin (TEC) 
Enterobacteriaceae (Selection: Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp., Citrobacter spp., 
Serratia spp., Morganella spp.) 
 
Third-generation cephalosporins (C3G): cefotaxime (CTX), ceftriaxone (CRO), ceftazidime (CAZ) 
 
Carbapenems (CAR): imipenem (IPM), meropenem (MEM), doripenem (DOR) 
Pseudomonas aeruginosa 
 
Carbapenems (CAR): imipenem (IPM), meropenem (MEM), doripenem (DOR) 
Acinetobacter spp. 
 
Carbapenems (CAR): imipenem (IPM), meropenem (MEM), doripenem (DOR) 
Old (PPS I) method to collect AMR markers (still allowed, but not recommended) 
Codes 
Microorganisms 




Staphylococcus aureus 
Oxa- S 
Oxa R 
 
Unknown 
MSSA 
MRSA 
Enterococcus spp. 
Gly-S 
Gly-IR 
  
Unknown 
 
VRE 
Enterobacteriaceae: Selection: Escherichia coli, 
C3G-S, 
C3G-IR, 
C3G-IR, 
Unknown 
Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp., 
Car-S 
Car-S 
Car-IR 
Citrobacter spp., Serratia spp., Morganella spp.  
Pseudomonas spp., Acinetobacter spp. 
Car-S 
Car-IR 
  
Unknown 
Oxa=Oxacil in, Gly=glycopeptides (vancomycin, teicoplanin), C3G= third-generation cephalosporins (cefotaxim, cetriaxone, 
ceftazidim), Car=carbapenems (imipenem, meropenem, doripenem) 
If AMR markers are collected in accordance with the PPS I protocol methodology, report S (susceptible), IR (non-
susceptible) or U (unknown), except for MRSA, report non-susceptibility to oxacillin (or equivalent) as R (resistant). 
 
 
 
77 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
Surgery categories 
NHSN surgery codes  
Reference: NHSN operative procedure category mappings to ICD-9-CM codes, October 2010. Available from: 
www.cdc.gov/nhsn/PDFs/pscManual/9pscSSIcurrent.pdf. 
NHSN code  Operative 
procedure 
Description 
ICD-9-CM Codes 
NHSN-AAA   Abdominal 
Resection of abdominal aorta with  38.34, 38.44, 38.64  
aortic 
anastomosis or replacement  
aneurysm 
repair  
NHSN-AMP   Limb 
Total or partial amputation or 
84.00-84.19, 84.91  
amputation  
disarticulation of the upper or lower 
limbs, including digits  
NHSN-APPY   Appendix 
Operation of appendix (not 
47.01, 47.09, 47.2, 47.91, 47.92, 47.99  
surgery  
incidental to another procedure)  
NHSN-AVSD   Shunt for 
Arteriovenostomy for renal dialysis   39.27, 39.42  
dialysis  
NHSN-BILI   Bile duct, liver  Excision of bile ducts or operative 
50.0, 50.12, 50.14, 50.21-50.23, 50.25, 50.26, 
or pancreatic 
procedures on the biliary tract, liver  50.29, 50.3, 50.4, 50.61, 50.69, 51.31-51.37, 
surgery  
or pancreas (does not include 
51.39, 51.41-51.43, 51.49, 51.51, 51.59, 51.61-
operations only on gallbladder)  
51.63, 51.69, 51.71, 51.72, 51.79, 51.81-51.83, 
51.89, 51.9151.95, 51.99, 52.09, 52.12, 52.22, 
52.352.4, 52.51-52.53, 52.5952.6, 52.7, 52.92, 
52.95, 52.96, 52.99  
NHSN-BRST   Breast surgery   Excision of lesion or tissue of breast  85.12, 85.20-85.23, 85.31-85.36, 85.41-85.48, 
including radical, modified, or 
85.50, 85.53, 85.54, 85.6, 85.70-85.76, 85.79, 
quadrant resection, lumpectomy, 
85.93, 85.96  
incisional biopsy, or mammoplasty.  
NHSN-CARD  Cardiac surgery  Procedures on the valves or septum  35.00 - 35.04, 35.10-35.14, 35.20-35.28, 35.31-
of heart; does not include coronary  35.35, 35.39, 35.42, 35.50, 35.51, 35.53, 35.54, 
artery bypass graft, surgery on 
35.60-35.63, 35.7035.73, 35.81-35.84, 35.91-
vessels, heart transplantation, or 
35.95, 35.98-35.99, 37.10, 37.11, 37.24, 37.31-
pacemaker implantation  
37.33, 37.35, 37.36, 37.41, 37.49, 37.60 
NHSN-CEA   Carotid 
Endarterectomy on vessels of head  38.12  
endarterectomy  and neck (includes carotid artery 
and jugular vein)  
NHSN-CBGB   Coronary artery  Chest procedure to perform direct  36.10-36.14, 36.19  
bypass graft 
revascularisation of the heart; 
with both chest  includes obtaining suitable vein 
and donor site  from donor site for grafting.  
incisions  
NHSN-CBGC   Coronary artery  Chest procedure to perform direct  36.15-36.17, 36.2  
bypass graft 
vascularisation of the heart using, 
with chest 
for example the internal mammary 
incision only  
(thoracic) artery  
NHSN-CHOL   Gallbladder 
Cholecystectomy and 
51.03, 51.04, 51.13, 51.21-51.24  
surgery  
cholecystotomy  
NHSN-COLO  Colon surgery   Incision, resection, or anastomosis  17.31-17.36, 17.39, 45.03, 45.26, 45.41, 45.49, 
of the large intestine; includes 
45.52, 45.71-45.76, 45.79, 45.81-45.83, 45.92-
large-tosmall and smal -to-large 
45.95, 46.03, 46.04, 46.10, 46.11, 46.13, 46.14, 
bowel anastomosis; does not 
46.43, 46.52, 46.75, 46.76, 46.94  
include rectal operations  
NHSN-CRAN  Craniotomy  
Incision through the skull to excise,  01.12, 01.14, 01.21-01.25, 01.28, 01.31, 01.32, 
repair, or explore the brain; does 
01.39, 01.41, 01.42, 01.51-01.53, 01.59, 02.11-
not include taps or punctures  
02.14, 02.91-02.93, 07.51-07.54, 07.59, 07.61-
07.65, 07.68, 07.69, 07.71, 07.72, 07.79, 38.01, 
38.11, 38.31, 38.41, 38.51, 38.61, 38.81, 39.28  
NHSN-CSEC   Cesarean 
Obstetrical delivery by Cesarean 
74.0, 74.1, 74.2, 74.4, 74.91, 74.99  
section  
section  
NHSN-FUSN   Spinal fusion   Immobilisation of spinal column  
81.00-81.08  
78 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
NHSN code  Operative 
procedure 
Description 
ICD-9-CM Codes 
NHSN-FX  
Open reduction  Open reduction of fracture or 
79.21, 79.22, 79.25, 79.26, 79.31, 79.32, 79.35, 
of fracture  
dislocation of long bones that 
79.36, 79.51, 79.52, 79.55, 79.56  
requires internal or external 
fixation; does not include 
placement of joint prosthesis  
NHSN-GAST   Gastric surgery   Incision or excision of stomach; 
43.0, 43.42, 43.49, 43.5, 43.6, 43.7, 43.81, 
includes subtotal or total 
43.89, 43.91, 43.99, 44.15, 44.21, 44.29, 44.31, 
gastrectomy; does not include 
44.38 - 44.42, 44.49, 44.5, 44.61-44.65, 44.68-
vagotomy and fundoplication  
44.69, 44.95-44.98  
NHSN-HER   Herniorrhaphy   Repair of inguinal, femoral, 
17.11-17.13, 17.21-17.24, 53.00 - 53.05, 53.10-
umbilical, or anterior abdominal 
53.17, 53.21, 53.29, 53.31, 53.39, 53.41-53.43, 
wall hernia; does not include repair  53.49, 53.51, 53.59, 53.61-53.63, 53.69  
of diaphragmatic or hiatal hernia or 
hernias at other body sites.  
NHSN-HPRO  Hip prosthesis   Arthroplasty of hip  
00.70-00.73, 00.85-00.87, 81.51 - 81.53  
NHSN-HTP   Heart 
Transplantation of heart  
37.51-37.55  
transplant  
NHSN-HYST   Abdominal 
Removal of uterus through an 
68.31, 68.39, 68.41, 68.49, 68.61, 68.69  
hysterectomy   abdominal incision  
NHSN-KPRO   Knee prosthesis  Arthroplasty of knee  
00.80-00.84, 81.54, 81.55  
NHSN-KTP   Kidney 
Transplantation of kidney  
55.61, 55.69  
transplant  
NHSN-LAM   Laminectomy   Exploration or decompression of 
03.01, 03.02, 03.09, 80.50, 80.51, 80.53, 80.54
spinal cord through excision or 
80.59, 84.60-84.69, 84.80-84.85  
incision into vertebral structures  
NHSN-LTP   Liver transplant  Transplantation of liver  
50.51, 50.59  
NHSN-NECK   Neck surgery   Major excision or incision of the 
30.1, 30.21, 30.22, 30.29, 30.3, 30.4, 31.45, 
larynx and radical neck dissection;  40.40-40.42  
does not include thyroid and 
parathyroid operations.  
NHSN-NEPH   Kidney surgery   Resection or manipulation of the 
55.01-55.02, 55.11, 55.12, 55.24, 55.31, 55.32, 
kidney with or without removal of  55.34, 55.35, 55.39, 55.4, 55.51, 55.52, 55.54, 
related structures  
55.91  
NHSN-OVRY  Ovarian 
Operations on ovary and related 
65.01, 65.09, 65.12, 65.13, 65.2165.25, 65.29, 
surgery  
structures  
65.31, 65.39, 65.41, 65.49, 65.51-65.54, 65.61-
65.64, 65.71-65.76, 65.79, 65.81, 65.89, 65.92-
65.95, 65.99  
NHSN-PACE   Pacemaker 
Insertion, manipulation or 
00.50-00.54, 17.51, 17.52, 37.7037.77, 37.79-
surgery  
replacement of pacemaker  
37.83, 37.85-37.87, 37.89, 37.94-37.99  
NHSN-PRST   Prostate 
Suprapubic, retropubic, radical, or  60.12, 60.3, 60.4, 60.5, 60.61, 60.62, 60.69  
surgery  
perineal excision of the prostate; 
does not include transurethral 
resection of the prostate.  
NHSN-PVBY   Peripheral 
Bypass operations on peripheral 
39.29  
vascular bypass  arteries  
surgery  
NHSN-REC   Rectal surgery   Operations on rectum  
48.25, 48.35, 48.40, 48.42, 48.43, 48.49-48.52, 
48.59, 48.61-48.65, 48.69, 48.74  
NHSN-
Refusion of 
Refusion of spine  
81.30-81.39  
RFUSN  
spine  
NHSN-SB  
Small bowel 
Incision or resection of the smal  
45.01, 45.02, 45.15, 45.31-45.34, 45.51, 45.61-
surgery  
intestine; does not include smal -to- 45.63, 45.91, 46.01, 46.02, 46.20-46.24, 46.31, 
large bowel anastomosis.  
46.39, 46.41, 46.51, 46.71-46.74, 46.93  
NHSN-SPLE   Spleen surgery   Resection or manipulation of spleen  41.2, 41.33, 41.41-41.43, 41.5, 41.93, 41.95, 
41.99  
79 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
NHSN code  Operative 
procedure 
Description 
ICD-9-CM Codes 
NHSN-THOR  Thoracic 
Noncardiac, nonvascular thoracic 
32.09, 32.1, 32.20, 32.21-32.23, 32.25, 32.26, 
surgery  
surgery; includes pneumonectomy  32.29, 32.30, 32.39, 32.41, 32.49, 32.50, 32.59, 
and diaphragmatic or hiatal hernia  32.6, 32.9, 33.0, 33.1, 33.20, 33.25, 33.28, 
repair.  
33.31-33.34, 33.39, 33.41 - 33.43, 33.48, 33.49, 
33.98, 33.99, 34.01-34.03, 34.06, 34.1, 34.20, 
34.26, 34.3, 34.4, 34.51, 34.52, 34.59, 34.6, 
34.81-34.84, 34.89, 34.93, 34.99, 53.80-53.84  
NHSN-THYR   Thyroid and/or  Resection or manipulation of 
06.02, 06.09, 06.12, 06.2, 06.31, 06.39, 06.4, 
parathyroid 
thyroid and/or parathyroid  
06.50-06.52, 06.6, 06.7, 06.81, 06.89, 06.91-
surgery  
06.95, 06.98, 06.99  
NHSN-VHYS   Vaginal 
Vaginal hysterectomy; includes that  68.51, 68.59, 68.71, 68.79  
hysterectomy   by laparoscope  
 
NHSN-VSHN   Ventricular 
Ventricular shunt operations, 
02.2, 02.31-02.35, 02.39, 02.42, 02.43, 54.95  
shunt  
including revision and removal of 
shunt  
NHSN-XLAP   Exploratory 
Procedures involving an incision 
53.71-53.72, 53.75, 54.0, 54.11, 54.12, 54.19, 
laparotomy  
through abdominal wall to gain 
54.3, 54.4, 54.51, 54.59, 54.61, 54.63, 54.64, 
access into the abdominal cavity; 
54.71-54.75, 54.92, 54.93  
diagnostic procedure on abdominal 
region 
Report NHSN-codes even if the incision is not entirely closed at procedure’s end (i.e. if wires or tubes extrude through the 
incision).  
Examples of non-NHSN surgery 
 
Obstetrical procedures: peri-delivery/labour (one or more) ICD-9-CM 75.3 and 75.9. 
 
Dental extraction: ICD-9-CM code 23.1 Surgical removal.  
 
Transurethral resection of prostate  
 
Incision and drainage of abscess with secondary closure  
 
Any diabetic forefoot amputation with healing by secondary intention  
 
Any other operation where healing is by secondary intention  
 
Tonsillectomy  
 
Application of external fixator/Olizarov  
 
Extraventricular drain  
 
Hysteroscopic removal of fibroids: Evacuation of retained products of conception 
 
 
 
80 
 
 
 

 
 
 
 
TECHNICAL DOCUMENT 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3 
 
 
 
References 
1.  Improving Patient Safety in Europe (IPSE). The IPSE report 2005-2008. Lyon: Université Claude Bernard 
Lyon 1; November 2009]. Available from 
http://www.ecdc.europa.eu/en/activities/surveillance/HAI/Documents/0811_IPSE_Technical_Implementation_
Report 
2.  European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). Point prevalence survey of healthcare-associated 
infections and antimicrobial use in European acute care hospitals. Protocol version 4.3. Full scale survey and 
codebook. Stockholm: ECDC: 2012. Available from: 
http://www.ecdc.europa.eu/en/activities/surveillance/HAI/about_HAI-Net/Pages/PPS.aspx 
3.  Council of the European Union. Council Recommendation of 9 June 2009 on patient safety, including the 
prevention and control of healthcare associated infections (2009/C 151/01). Available from: http://eur-
lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=OJ:C:2009:151:0001:0006:EN:PDF 
 
4.  Zingg W, Holmes A, Dettenkofer M, Goetting T, Secci F, Clack L, Allegranzi B, Magiorakos AP, Pittet D; for the 
systematic review and evidence-based guidance on organization of hospital infection control programmes 
(SIGHT) study group. Hospital organisation, management, and structure for prevention of health-care-
associated infection: a systematic review and expert consensus. Lancet Infect Dis. 2015 Feb;15(2):212-24 
5.  Pollack LA, Plachouras D, Sinkowitz-Cochran R, Gruhler H, Monnet DL, Weber JT; Transatlantic Taskforce on 
Antimicrobial Resistance (TATFAR) Expert Panel on Stewardship Structure and Process Indicators. A concise set 
of structure and process indicators to assess and compare antimicrobial stewardship programs among EU and 
US hospitals: results from a multinational expert panel. Infect Control Hosp Epidemiol. 2016 Jul 15:1-11.  
6.  European Centre for Disease Prevention and Control. Point prevalence survey of healthcare-associated 
infections and antimicrobial use in European acute care hospitals, 2011–2012. Stockholm: ECDC; 2013. 
Available from: http://www.ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/healthcare-associated-infections-
antimicrobial-use-PPS.pdf 
7.  WHO, Regional Office for Europe. European database on human and technical resources for health (HlthRes-
DB). Available from http://www.euro.who.int/en/data-and-evidence/databases/european-database-on-human-
and-technical-resources-for-health-hlthres-db 

8.  Eurostat – Health care facilities. Hospital beds by financing sector. Available from: 
http://ec.europa.eu/eurostat/cache/metadata/Annexes/hlth_res_esms_an10.pdf 
9.  Organisation for Economic Co-operation and Development (OECD). OECD Health Statistics 2014. Definitions, 
Sources and Methods. Available from http://www.oecd.org/els/health-systems/health-data.htm 
10.  Resar R, Griffin FA, Haraden C, Nolan TW. Using Care Bundles to Improve Health Care Quality. IHI Innovation 
Series white paper. Cambridge, Massachusetts: Institute for Healthcare Improvement; 2012. Available from 
http://www.ihi.org/resources/pages/ihiwhitepapers/usingcarebundles.aspx 
11.  Zarb P, Coignard B, Griskeviciene J, Muller A, Vankerckhoven V, Weist K, Goossens M, Vaerenberg S, Hopkins S, 
Catry B, Monnet D, Goossens H, Suetens C; National Contact Points for the ECDC pilot point prevalence 
survey; Hospital Contact Points for the ECDC pilot point prevalence survey. The European Centre for Disease 
Prevention and Control (ECDC) pilot point prevalence survey of healthcare-associated infections and 
antimicrobial use. Euro Surveill. 2012 Nov 15;17(46). 
12.  Reilly JS, Price L, Godwin J, Cairns S, Hopkins S, Cookson B, Malcolm W, Hughes G, Lyytikainen O, Coignard B, 
Hansen S, Suetens C; National Participants in the ECDC pilot validation study. A pilot validation in 10 European 
Union Member States of a point prevalence survey of healthcare-associated infections and antimicrobial use in 
acute hospitals in Europe, 2011. Euro Surveill. 2015 Feb 26;20(8). 
13.  HELICS surveillance of SSI protocol, version 9.1, September 2004. Available from 
http:///www.ecdc.europa.eu/IPSE/helicshome.htm 
14.  HELICS Surveillance of Nosocomial Infections in Intensive Care Units protocol, version 6.1, September 2004. 
Available from http://www.ecdc.europa.eu/IPSE/helicshome.htm  
15.  Kuijper EJ, Coignard B, Tüll P, the ESCMID Study Group for Clostridium difficile (ESGCD), EU Member States 
and the European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). Emergence of Clostridium difficile-
associated disease in North America and Europe. Clin Microbiol Infect 2006;12 (Suppl 6):2-18 
16.  Neo-KISS. Protokoll. December 2009. Nationales Referenzzentrum für Surveillance von nosokomialen 
Infektionen. Available from http://www.nrz-hygiene.de/dwnld/NEOKISSProtokoll221209.pdf   
81 
 
 
 

 
 
 
 
PPS of HAIs and antimicrobial use in European acute care hospitals – protocol version 5.3  
TECHNICAL DOCUMENT 
 
 
 
17.  Geffers C, Baerwolff S, Schwab F, Gastmeier P. Incidence of healthcare-associated infections in high-risk 
neonates: results from the German surveillance system for very-low-birthweight infants. J Hosp Infect. 2008 
Mar;68(3):214-21. 
18.  CDC/NHSN surveillance definition of healthcare-associated infection and criteria for specific types of infections 
in the acute-care setting, AM J Infect Control 2008; 36: 309-32.  
19.  Hansen S, Sohr D, Geffers C, Astagneau P, Blacky A, Koller W, Morales I, Moro ML, Palomar M, Szilagyi E, 
Suetens C, Gastmeier P. Concordance between European and US case definitions of healthcare-associated 
infections. Antimicrob Resist Infect Control. 2012 Aug 2;1(1):28. doi: 10.1186/2047-2994-1-28. 
 
82 
 
 
 

European Centre for Disease 
Prevention and Control (ECDC)
Postal address:  
Granits väg 8, SE-171 65 Solna, Sweden
Subscribe to our monthly email 
www.ecdc.europa.eu/en/publications
Visiting address:  
Tomtebodavägen 11a, SE-171 65 Solna, Sweden
Contact us 
xxxxxxxxxxxx@xxxx.xxxxxx.xx
Tel. +46 858601000
Fax +46 858601001
 Follow us on Twitter 
www.ecdc.europa.eu 
@ECDC_EU 
An agency of the European Union
 Like our Facebook page 
www.europa.eu
www.facebook.com/ECDC.EU
ECDC is committed to ensuring the transparency and independence of its work
In accordance with the Staff Regulations for Officials and Conditions of Employment of Other Servants of the European Union and the 
ECDC Independence Policy, ECDC staff members shall not, in the performance of their duties, deal with a matter in which, directly or 
indirectly, they have any personal interest such as to impair their independence. Declarations of interest must be received from any 
prospective contractor(s) before any contract can be awarded.
www.ecdc.europa.eu/en/aboutus/transparency
HOW TO OBTAIN EU PUBLICATIONS
Free publications:
•  one copy: 
via EU Bookshop (http://bookshop.europa.eu);
•  more than one copy or posters/maps: 
from the European Union’s representations (http://ec.europa.eu/represent_en.htm); 
from the delegations in non-EU countries (http://eeas.europa.eu/delegations/index_en.htm);
by contacting the Europe Direct service (http://europa.eu/europedirect/index_en.htm) or 
calling 00 800 6 7 8 9 10 11 (freephone number from anywhere in the EU) (*).
(*) The information given is free, as are most calls (though some operators, phone boxes or hotels may charge you).
Priced publications:
•  via EU Bookshop (http://bookshop.europa.eu).

Document Outline