L'ENISA a pour mission d'assurer un niveau élevé de sécurité des réseaux et de l'information. Elle agit de différentes façons: en intervenant en tant qu'expert en matière de sécurité des réseaux et de l'information auprès des autorités nationales et des institutions européennes; en favorisant l’échange de meilleures pratiques; en facilitant les contacts entre les institutions (nationales et européennes) et les entreprises.