Ceci est une version HTML d'une pièce jointe de la demande d'accès à l'information 'Infectious Diseases'.


 
 
 
 
 
 
TESSy - The European 
 
Surveillance System 
 
 
 
 
 
 
 
HIV Drug Resistance Reporting Protocol  
 
and Analysis Plan 2019 
  HIV drug resistance surveillance data for 2018 and historical 
data 
 
 
 
February 2019 

link to page 3 link to page 3 link to page 3 link to page 3 link to page 4 link to page 4 link to page 4 link to page 4 link to page 5 link to page 5 link to page 5 link to page 6 link to page 6 link to page 6 link to page 7 link to page 8 link to page 8 link to page 8 link to page 8 link to page 12 link to page 12 link to page 12 link to page 14 link to page 14 link to page 14 link to page 14 link to page 14 link to page 14 link to page 14 link to page 15 link to page 15 HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Contents 
Contents 
Introduction ............................................................................................................... 4 
How to use this document ..................................................................................................... 4 
Finding further information .................................................................................................... 4 
Copyright ............................................................................................................................. 4 

Reporting to TESSy .................................................................................................... 5 
Checking the data collection schedule .................................................................................... 5 
Preparing data ...................................................................................................................... 5 

Denominator data ............................................................................................................ 5 
Historical HIVDR data ....................................................................................................... 6 
Checking metadata ............................................................................................................... 6 
Checking your data source profile .......................................................................................... 6 
Submitting your data ............................................................................................................ 7 
Finalising your submission ..................................................................................................... 7 
TESSy HelpDesk ................................................................................................................... 7 

Changes to current metadata ...................................................................................... 8 
Annex 1 HIVDRAGGR metadata ................................................................................... 9 
Available record types ...................................................................................................... 9 
Current record type version .............................................................................................. 9 

Description of dataset: HIVDRAGGR, aggregated record type .................................................. 9 
Annex 2 Case definition and analysis plan ................................................................... 13 
Introduction ....................................................................................................................... 13 
HIVDR case definition .................................................................................................... 13 
Draft analysis plan (for information only) ............................................................................. 15 
Description of surveillance data ...................................................................................... 15 
Data cleaning ................................................................................................................ 15 
Calculation of specific indicators ...................................................................................... 15 
Principles of analysis ...................................................................................................... 15 
Geographical grouping of countries ................................................................................. 15 
Absolute numbers .......................................................................................................... 15 
Reporting delays ............................................................................................................ 16 
Outputs ......................................................................................................................... 16 

 
 
© ECDC February 2019 All rights reserved. 
 
 

link to page 4 link to page 8 link to page 12
HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Introduction 
Introduction  
This reporting protocol is for the 2019 data call for transmitted HIV drug resistance (HIVDR) diagnoses 
made in 2018. Acquired drug resistance is out of scope for this surveillance data collection and reporting 
protocol. The objective of HIVDR data collection are: 
1. Monitoring the prevalence of and trends in HIV drug resistance in newly diagnosed HIV patients, 
when they start antiretroviral treatment (ART) for the first time, to inform national treatment 
policies in the EU/EEA Member States; 
2. Identification of at-risk populations for transmission of drug-resistant HIV; 
3. Identification of high-risk geographical areas; 
4. Reporting emerging trends in resistance to learned societies and professional associations to help 
guide their treatment protocol updates. 
  
This reporting protocol covers the 31 European Union/European Economic Area (EU/EEA) countries. 
The  reporting  of  HIVDR  is  voluntary.  Reporting  protocols  are  data  collection  guidelines  for  data 
managers in reporting countries. 
The  TESSy  website  contains  additional  generic  technical  information  for  each  data  collection  in  the 
general technical annex and surveillance protocol. Additional information on the HIV and AIDS data 
collection is available in TESSy HIVAIDS reporting protocol. 
How to use this document 
This reporting protocol has three main sections: 
  Reporting to TESSy – contains guidelines on how to prepare data for submission to TESSy, 
deadlines for data submission, subject-specific information (e.g. new changes to metadata), 
and links to further information. 
  Annex  1  HIVDR  metadata  –  contains  the  metadata  set  for  the  subject(s)  covered  by  this 
reporting protocol. 
  Annex 2 HIVDR-specific material – contains subject-specific material relevant for distribution 
with the reporting protocol: 
o  Case definitions. 
o  Analysis plan. 
Finding further information  
 Paragraphs denoted by the information icon tell where you can find further information. 
Updated links to all the schedules, documentation and training materials mentioned in this reporting 
protocol are included in the technical annex on the TESSy website, including: 
  Metadata sets and history. 
  Tutorials for data transformation using respectively Excel and Access. 
  TESSy user documentation. 
  CSV and XML transport protocols. 
Copyright 
© European Centre for Disease Prevention and Control, 2019. Reproduction is authorised, provided 
the source is acknowledged.  
 
Page 4 of 18 

link to page 4 link to page 4 link to page 5 link to page 5 link to page 6 link to page 6 link to page 8 link to page 8

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Reporting to TESSy 
Reporting to TESSy  
This section provides both an overview of the TESSy reporting process and tips on where you can find 
useful information. 
The overall process is: 
1.  Familiarise yourself with the data collection deadlines. 
2.  Prepare (export and transform) your data. 
3.  Check that your data comply with the metadata. 
4.  Check that your data source profile is up-to-date. 
5.  Submit your file(s) to TESSy. 
6.  Finalise and approve your submission. 
Checking the data col ection schedule 
 An updated link to the current data collections schedule is provided in the technical annex. 
The 2018 HIV/AIDS surveillance data collection opens in March 2019 and closes on 15 September 
2019. Please inform us as soon as possible if you are unable to meet the  15 September 
deadline, 
and on a case-by-case basis, we will determine whether countries reporting later can be 
included in the 2018 data report planned to be published in Q1 in 2020. 
Table 1. Indicative timeframe for 2018 HIVDR data collection. 
Description of process 
Date 
Data cal  for submission of HIVDR data 
Open from March 2019 
Data submission for HIVDR closes 
15 September 2019 
Validation of data tables  
Within two-three weeks of country data upload  
Data analysis and report drafting  
October 2019 
Validation of draft report by countries 
October-November 2019 
Publication of the surveil ance report 
Q1/2020 
Preparing data 
After you have exported the data from your national database, you need to ensure that the data are in 
a format that TESSy can accept. This applies both to the type of file submitted to TESSy (only CSV and 
XML files can be submitted) and to the format of the data in certain fields. 
 Tutorials covering how you can transform your data to the correct TESSy format using Excel or 
Access are available on the TESSy documents website. Information on the file formats is available in 
the CSV Transport Protocol and XML Transport Protocol. 
Annex 1 HIVDR metadata describes the HIV/AIDS variables for reporting to TESSy, including a 
detailed description of HIVDR variables in the TESSy metadata set. 
The data will be submitted in aggregate format.  
Denominator data 
The total number of patients tested for HIVDR needs to be collected as denominator for calculation of 
the overall transmitted drug resistance (TDR) prevalence. 
 
Page 5 of 18 




HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Reporting to TESSy 
Historical HIVDR data 
It is recommended that historical data are updated every time data are submitted to TESSy. If historical 
data for HIVDR exist, you may upload such data since year 2000. 
Checking metadata 
The TESSy metadata define the fields and data formats that are valid as input to TESSy for a given 
subject. The metadata set is the set of standard variables that is applied for reporting to TESSy across 
all diseases under EU surveillance and hence defines all details of each variable and its coding. New 
versions reflect changes in one or more disease areas.  
As surveillance requirements change, the data changes needed to support the new requirements are 
identified  and  agreed  upon  by  nominated  surveillance  contact  points  in  countries  and  are  then 
implemented as changes to the TESSy metadata.  
In order to ensure that your data can be saved correctly in TESSy, you therefore need to check that 
your data are correctly formatted according to the most recent metadata set. 
It is especially important to focus on: 
 
Field formats 
Many fields require that data are formatted in a specific way. For example, dates must be in the 
YYYY-MM-DD format; dates in the DD/MM/YYYY format will be rejected. 
 
Coded values  
Some fields only permit the use of specific values (coded values). For example, MSM, HETERO, 
IDU and OTH are the coded values for Transmission and any other value in a Transmission field 
will be rejected. 
 
The metadata file contains all the definitions and rules you need to comply with to format your data 
correctly for every subject (usually a disease). The file can be downloaded as an Excel file from the 
TESSy documents website. 
By filtering the fields in the file by subject, you can see the fields required for your subject and the rules 
applying to these fields. 
 The technical annex provides an overview of how you work with the metadata file, and the TESSy 
user documentation provides in-depth details on metadata. 
Checking your data source profile 
Before submitting your file(s), please review the profile for your data source(s) in TESSy (go to Data 
sources
), and update the information for record type HIVDRAGGR.  
 
Complete and up-to-date data source information for each subject is important for improving 
interpretation of data - each surveillance system has different features that need to be taken into 
account when comparing data at international level. 
If your data source information is out-of-date and you do not have access rights to update it, please 
request your National Focal Point for Surveillance or National Coordinator to do so. 
 In-depth information on the data source variables is available in the TESSy user documentation. 
 
Page 6 of 18 




HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Reporting to TESSy 
Submitting your data 
Data are submitted through the TESSy web interface (go to Upload). 
 
 The Technical Annex provides an overview of how you submit files to TESSy, and the TESSy user 
documentation provides in-depth descriptions of all the upload methods. 
Finalising your submission 
The compliance of your data with the validation rules in the metadata is checked automatically during 
the data upload. 
The result of your upload – i.e. rejected or validated – is displayed immediately after the conclusion of 
the check in the Validation details webpage. Please review the result carefully: 
  If  your  file  has  been  rejected,  there  will  be  a  message  explaining  each  instance  of  non-
compliance with the metadata that you need to correct. 
  If your file has been validated, there might be warnings and remarks relating to possible data 
quality issues or to potential overwriting of existing records that you should consider. 
When your file has been validated and you are satisfied that all corrections have been made, please 
ensure prompt approval – unapproved uploads can block the approval of other uploads.  
HIVDR verification reports are available online to check if data in TESSy are the same data the user has 
submitted. The data are presented either by date used for statistics or date of diagnosis. Information 
on the “data source” is displayed as well for countries to keep information on their national surveillance 
systems updated. 
 The TESSy user documentation provides information on reviewing validation results and adjusting 
reporting periods to avoid overwriting existing records. 
TESSy HelpDesk 
Email:  xxxxx@xxxx.xxxxxx.xx 
Telephone number:  +46-(0)8-5860 1601 
 
Availability: 9:00 – 16:00 Stockholm time, Monday to Friday (except ECDC 
 
  Holidays) 
 
 
Page 7 of 18 


HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Changes to current metadata 
Changes to current metadata 
HIVDRAGGR is a new record type and no changes have yet been applied. 
 Information on changes to the metadata for other subjects is available on the TESSy documentation 
website. 
 
Page 8 of 18 

link to page 8 link to page 8 HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 1 HIVDRAGGR metadata 
Annex 1 HIVDRAGGR metadata  
This section describes: 
  The HIVDRAGGR metadata set 
  Dataset structure: HIVDR aggregated record type 
Available record types  
Different record types are available for European level reporting of HIV/AIDS surveillance data. HIVDR 
data are reported in aggregate in the HIVDRAGGR record type.  
The dataset structure for HIVDR is provided in this section. For all the other record types related to 
HIV epidemiological reporting, please refer to HIV/AIDS reporting protocol.  
Current record type version 
Table 2 shows the record type available for reporting 2018 HIVDR surveillance data to TESSy. 
Table 2. HIVDRAGGR record version type for 2018 data. 
Subject 
Record type 
Aggregated 
record type version 
HIVDR 
HIVDRAGGR 
HIVDRAGGR 1 
 
 
Description of dataset: HIVDRAGGR, aggregated record type  
The variables used for aggregate reporting include drug class, transmission, country of origin, reporting 
country and the number of cases. All variables are mandatory, unless otherwise specified. 
1.  RecordType  
The record type defines the structure and the format of the data reported. It is defined by ECDC and 
specifies what data values TESSy expects to receive. The record type is related to the ‘subject’. Only 
valid combinations of record type, subject and data source will be accepted. For aggregated HIVDR 
data, the record type is HIVDRAGGR
 
2.  RecordTypeVersion (not mandatory) 
The version of the record type defines the current structure of the data reported. If the original dataset 
for any particular disease changes, the version number increases. All record types started at version 1 
with the launch of TESSy. This variable can be omitted if a valid metadata set is provided.  
Coding for HIVDRAGGR value =1.  
 
3.  Subject  
The subject describes the disease or related health topic under surveillance: HIVDR
 
4.  DataSource 
The  data  source  specifies  the  surveillance  system  from  which  the  data  on  this  particular  disease 
originate. The list of available surveillance systems per country is an integral part of TESSy and will be 
 
Page 9 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 1 HIVDRAGGR metadata 
generated and revised/updated in collaboration with the nominated contact points for surveillance in 
each MS.  
 
5.  ReportingCountry  
The country reporting the record. 
Coding: Country = ISO 3166-1 alpha-2 (two-letter code). 
 
6.  DateUsedForStatistics 
This is the date used by the national surveillance institute or organisation in the national and other 
official statistics to indicate the period for which HIVDRAGGR data are reported. The date is expressed 
as a year and should have the following format:   
Coding: YYYY 
 
7.  ResistanceDrugClass 
This variable specifies the drugs under HIVDR surveillance. Only low, intermediate and high-level 
resistance as defined by the Stanford HIVdb susceptibility algorithm should be reported. ‘Potentially 
low’ resistance will be considered as not clinically relevant and therefore be excluded.  
When reporting HIVDR by drug class, the following categorisation should be used: 
Nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NRTI) class refers to any NRTI. Examples include 
abacavir (ABC), emtricitabine (FTC), lamivudine (3TC), tenofovir disoproxil fumarate (TDF), 
zidovudine (ZDV);  
Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTI) class refers to any NNRTI. Examples 
include: efavirenz (EFV), etravirine (ETV), nevirapine (NVP), rilpivirine (RIL);  
Protease inhibitor (PI) class refers to any PI such as atazanavir (ATV), darunavir (DRV), 
fosamprenavir (FPV), lopinavir/ritonavir (LPV/r), ritonavir (RTV), saquinavir (SQV), tipranavir (TPV); 
Integrase inhibitor (INI)1 class refers to any INI such as dolutegravir (DTG), raltegravir (RAL).  
It is possible to code resistance to one or multiple classes of drugs. When reporting resistance against 
a combination of different drug classes, the resistance level can vary between the drug classes, e.g. 
being low for one and intermediate or high for another. 
Each case should be categorised only once. If a case is reported as resistant to a combination of drug 
classes, the same case should not be reported again under the individual drug classes.  
 
Coding:   
NRTI 
NNRTI 
PI 
INI 
NRTI + NNRTI 
PI + NRTI 
PI + NNRTI 
PI + NRTI + NNRTI 
                                                
1 Also referred to as integrase strand transfer inhibitors (INSTI) 
 
Page 10 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 1 HIVDRAGGR metadata 
 
8.  NumberDetected  
Total number of patients with laboratory-detected HIVDR against any of the existing NRTI, NNRTI, INI 
and PI or their combination (see ResistanceDrugClass).  
Coding:  
Number = Min:0; Max:999999999 
 
9.  NumberTested 
This variable specifies the number of newly diagnosed HIV patients tested during the reporting period 
for susceptibility upon ART initiation by route of transmission. It is required as denominator for 
calculation of the overall TDR prevalence.  
Coding:  
Number = Min:0; Max:999999999 
 
 
UNK 
 
Unknown 
 
10. Transmission 
Describes the most probable route of HIV transmission. ‘Heterosexual contact’ is used for cases for 
which heterosexual transmission is highly probable and which do not fit into another category. Cases 
not fully documented should be coded as UNK.   
Coding:  
 
HETERO  
heterosexual contact  
IDU  
 
ever injected drugs  
MSM    
MSM/homo or bisexual male  
OTH 
Other  route  of  transmission  (haemophiliac  patient,  mother-to-child 
transmission, nosocomial or transfusion recipient)  
UNK    
Unknown or undetermined  
 
11. Origin  
Origin of the patient.  
Coding: 
REPCOUNTRY  Case is born in/from the reporting country  
 
ABROAD 
Case is from abroad (not from the reporting country) 
UNK    
Unknown   
 
Table 3. Variables and coded values for HIVDRAGGR record type. 
Variables for HIVDRAGGR 
Coded values 
1.  RecordType 
HIVDRAGGR 
2.  RecordTypeVersion 

3.  Subject 
HIVDR 
4.  DataSource 
Country-specific code 
5.  ReportingCountry 
2-letter code 
 
Page 11 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 1 HIVDRAGGR metadata 
6.  DateUsedForStatistics 
YYYY 
7.  ResistanceDrugClass 
NRTI; NNRTI; PI; INI; NRTI+NNRTI; PI+NRTI; 
PI+NNRTI; PI+NRTI+NNRTI 
8.  NumberDetected 
Number of patients fulfil ing the HIVDR case 
definition 
9.  NumberTested   
Number of patients tested 
10.  Transmission 
MSM, HETERO, IDU, OTH, UNK 
11.  Origin  
REPCOUNTRY, ABROAD, UNK 
 
 
Page 12 of 18 

link to page 8 link to page 13 HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
Introduction 
Robust surveillance data are critical to monitor and inform the public health response to the European 
HIV epidemic in an accurate and timely fashion. HIV surveillance within Europe has been coordinated 
jointly by the European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) and the WHO Regional Office 
for Europe since 2008.  
ECDC  is  implementing  a  surveillance  system  for  HIV  drug  resistance  (HIVDR)  in  European 
Union/European  Economic  Area  (EU/EEA)  countries.  Increasing  the  number  of  people  receiving 
antiretroviral treatment (ART) among those living with HIV is critical to reduce HIV incidence and AIDS-
related morbidity and mortality in the region. Preventing and managing the emergence of HIVDR is a 
key component of a comprehensive and effective HIV response and should be integrated into broader 
efforts to ensure sustainability and greatest impact. It is essential that actions to monitor, prevent and 
respond to HIVDR are implemented at the clinical, programme and policy levels to address the many 
drivers of HIVDR. To this end, WHO published a Global action plan on HIV drug resistance in July 20172.  
HIVDR surveillance data are submitted to The European Surveillance System (TESSy); this platform 
enables countries to upload and also performs an automated validation to improve data quality.  
This document is a practical reference guide for countries reporting HIVDR data to ECDC. It specifies 
the dataset for HIVDR reporting at the European level, and provides detailed definitions and guidelines 
for coding each variable. It also provides an analysis plan to show how the data will be used.  
HIVDR  is  a  new  record  type  and  will  be  tested  for  feasibility  of  reporting  in  2019  with  voluntary 
countries. The record type will be reviewed and discussed at the European HIV Surveillance Network 
meeting  in  2020.  Revisions  based  on  network  feedback  will  be  implemented  and  further  countries 
invited for reporting in 2020 to achieve larger representation of the countries of countries who collect 
HIVDR data.  
The HIVDR record type will first be tested in an aggregate format. A pilot study on implementation of 
a HIVDR data collection was performed in 2017-2018 (pending publication, provided upon request).  
Each country should examine the contents of the dataset in detail. All fields are mandatory and must 
be completed, even if the information is ‘unknown’.  
 
HIVDR case definition 
HIVDR case definition: 
Any newly diagnosed treatment-naïve HIV patient3 tested prior to initiating HIV treatment for 
susceptibility to any of the 22 available antiretroviral drugs in the four main drug classes.  
In context of this data collection, pre-exposure prophylaxis (PrEP) is not considered treatment and 
cases on PrEP are included.  
Low-level, intermediate and high-level resistance will all be coded as “resistant”. 
 
Required laboratory analysis: 
Sequencing of HIV protease and reverse transcriptase and/or integrase genes.  
 
                                                
2 World Health Organization. Global action plan on HIV drug resistance 2017–2021. Geneva: WHO; 2017. Available from: 
http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/255883/1/9789241512848-eng.pdf. 
3 Commission Implementing Decision (EU) 2018/945: https://eur-lex.europa.eu/legal-
content/EN/TXT/PDF/?uri=CELEX:32018D0945&from=EN 
 
Page 13 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
HIVDR interpretation algorithm: 
HIVDR is defined as any mutation or combination of mutations that produces low, intermediate or high-
level resistance to any relevant NRTI, NNRTI, PI or INI. Potential low-level resistance is not included 
(see below). 
Since 2000, the Stanford University has maintained a free, publicly available drug resistance mutation 
(DRM)  interpretation  system  that  can  be  accessed  via  an  HTML  or  an  automated  web  service,  the 
Stanford  HIV  Drug  Resistance  Database  (HIVdb)4.  HIVdb  is  an  expert  system  that  accepts  user-
submitted HIV-1 sequences in FASTA data format and returns inferred levels of resistance to 22 ARV 
drugs including 8 PI, 7 NRTI, 4 NNRTI, and 3 INI. In the HIVdb system, each drug resistance mutation 
is assigned a drug penalty score and a comment; the total score for a drug is derived by adding the 
scores of each DRM associated with resistance to that drug. Using the total drug score, the programme 
reports  one  of  the  following  5  levels  of  inferred  drug  resistance:  susceptible,  potential  low-level 
resistance, low-level resistance, intermediate resistance, and high-level resistance. The scores are the 
sum of each mutation penalty score for a drug. Scores of less than 10 indicate susceptibility; scores 
between 10 and 14 indicate potential low-level resistance; scores between 15 and 29 indicate low-level 
resistance; scores between 30 and 59 indicate intermediate resistance. Scores of 60 or above indicate 
high-level resistance. For TESSy HIVDR reporting, cases with scores of 15 and higher were defined as 
HIVDR.  
These results are aggregated per drug class, transmission route and origin. 
 
 
 
                                                
4 https://hivdb.stanford.edu/page/release-notes/  
 
Page 14 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
Draft analysis plan (for information only) 
Description of surveillance data 
Data are presented in aggregated format, indicating number of cases per main drug class and overall 
resistance by main route of transmission and country of origin. 
The overall HIVDR prevalence is defined as the percentage of drug-naïve newly diagnosed patients 
infected with an HIV virus carrying any mutation indicative of pre-treatment drug resistance. The 
denominator is the total number of persons tested for each risk group (“NumberTested”). 
Data cleaning 
  Data submitter is contacted in case of lack of clarity or detected inconsistencies; 
  Assessment of data completeness; minimum 30% data completeness is required for any 
variable to be included in any further analysis. 
 
Calculation of specific indicators 
HIVDR prevalence 
Prevalence estimates will be calculated: (1) overall; (2) in each transmission group (MSM, HETERO, 
IDU, OTH); (3) per drug class; and (4) by reporting country and origin.  
Other indicators include: 
  Number of newly diagnosed HIV cases (and proportion of tested cases) with any HIVDR 
mutations. 
  Newly diagnosed HIV infections tested for HIVDR, compared to the numbers of new HIV 
diagnoses reported to TESSy in 2018, by country. 
  Number of HIVDR cases, by country, EU/EEA, 2018 
  Number of HIVDR cases, by drug class resistance, EU/EEA, 2018  
  Number of HIVDR cases, by country and drug class resistance, EU/EEA, 2018 
  Number of HIVDR cases, by drug class resistance and transmission mode, EU/EEA, 2018 
  Number of HIVDR cases, by country of origin, EU/EEA, 2018 
 
Principles of analysis 
Geographical grouping of countries 
Data are presented for the European Union (EU) and European Economic area (EEA) countries: the 
EU consists of 28 Member States and the EEA consists of Norway, Liechtenstein, and Iceland. Data 
for country of origin are grouped by “reporting country” and “abroad” (excluding unknown).  
Absolute numbers  
Data are presented in absolute numbers and proportions of cases resistant to a selected drug class, 
where appropriate. In addition, data are presented by year, reporting country, route of transmission 
and origin. Due to variations in coverage, completeness and representativeness of the data, direct 
comparisons of absolute numbers must be done with caution. 
The tables in the report use absolute numbers. Denominators are based on data collected from 
‘NumberTested’ variable.  
 
Page 15 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
Reporting delays 
Data are provisional due to reporting delays, and because previously reported data are subject to 
regular updates (e.g. detection and deletion of duplicate cases, inclusion of new information about 
cases already reported).    
Outputs 
Data presentation  
The report will include tables, figures, maps, annexes. 
Example of tables: 
Table 1. Number and proportion of newly diagnosed HIV cases with transmitted drug resistance and 
number of new HIV diagnoses reported by country, EU/EEA, 2018. 

Reporting country 
HIVDR cases (% out of HIVDR 
New HIV diagnoses in HIV 
tested cases) 
surveillance system 
 
Austria 
n (%) 

Belgium 
 
 
… 
 
 
Total 
n (%) 
n  
 
Table 2. Number and proportion of newly diagnosed HIV cases with transmitted drug resistance by 
transmission route, EU/EEA, 2018.   

Characteristics 
Number 
(%) 
Total number of reported HIVDR diagnoses 
 
 
Main route of transmission  
 
 
Men who have sex with men  
 
 
Heterosexual contact  
 
 
Injecting drug use  
 
 
Other 
 
 
Unknown 
 
 
 
 
 
 
 
Page 16 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
Table 3. Number and proportion of newly diagnosed HIV cases with transmitted drug resistance by 
drug class and transmission route, EU/EEA, 2018. 

Transmission route 
Nr of MSM 
Nr of 
Nr of IDU 
Nr of UNK 
Nr of OTH 
Total 
(%) 
HETERO 
(%) 
(%) 
(%) 
(%) 
NRTI 
n (%) 
 
 
 
 
 
NNRTI 
 
 
 
 
 
 
PI 
 
 
 
 
 
 
INI 
 
 
 
 
 
 
NRTI+NNRTI 
 
 
 
 
 
 
PI+NRTI 
 
 
 
 
 
 
PI+NNRTI 
 
 
 
 
 
 
PI+NRTI+NNRTI 
 
 
 
 
 
 
 
 
Table 4. Number and proportion of newly diagnosed HIV cases with transmitted drug resistance by 
reporting country and origin, EU/EEA, 2018.  

 Reporting country 
Number of local cases 
Number of cases 
Number of cases 
(%) 
from abroad (%) 
with unknown origin 
(%) 
Austria 
n (%) 
n (%) 
n (%) 
Belgium 
 
 
 
… 
 
 
 
Total 
n (%) 
n (%) 
n (%) 
 
 
 
 
Page 17 of 18 

HIVDR Reporting Protocol 2019 
 
Annex 2 Case definition and analysis plan 
Examples of figures:  
Figure 1. Prevalence of HIVDR by drug class, EU/EEA, 2018.  
NRTI
NNRTI
PI
INI
NRTI+NNRTI
PI+NRTI
PI+NNRTI
 PI+NRTI+NNRTI
 
 
Figure 2. Prevalence of HIV drug resistance by drug class and transmission route, EU/EEA, 2018. 
60%
50%
%)(  40%
e
nc 30%
e
alve 20%
r
P
10%
0%
MSM
HETERO
IDU
OTH
 
 
Output 
These results will be reflected in surveillance reports or journal articles. 
 
 
Page 18 of 18